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Un año después de un brutal ataque terrorista en Odessa, se responsabiliza a aquellos poseedores de poderes extraordinarios. Por eso, ahora son perseguidos y tratan de esconderse en los lugares más remotos del planeta.

Tommy utiliza sus poderes de teleportación para salvarse a sí mismo y su amiga Emily de Lucas y Joanne Collins, que están matando evos. Ren Shimosawa encuentra el juego Evernow en el ordenador de Miko, se une a ella para rescatar a su padre. Noah regresa a Primatech con Quentin Frady, un ex trabajador temporal en Renautas, la empresa que compró Primatech. Oscar encuentra un ferrocarril subterráneo que Oscar utilizaba para ayudar a evos a escapar a Canadá. Cuando Lucas y Joanne se encuentran transportados a la antigua habitación de Tommy en el quinto nivel de Primatech, escapan matando a las personas que quedaban en la empresa y obteniendo archivos con la ubicación conocida de evos.

En el polo norte, la joven Malina usa su poder para suprimir el mal que se está acercando a la tierra. Mientras tanto, Molly Walker, que tiene el poder para localizar otros Evos, ha sido capturada por Renautas. En la torre de Yamagato, Miko es capturada por un hombre llamado Harris, que entrega la espada a Erica Kravid, CEO de Renautas. En un hospital, Noah encuentra un video de vigilancia de sí mismo de pie sobre el cuerpo de una chica rubia, al parecer, Claire; el vídeo tiene errores en la secuencia de tiempo, por lo que sospecha de Hiro Nakamura. Joanne está dispuesta a perseguir a los evos que aparecen en los archivos de Primatech, pero Lucas está aterrado por que está desarrollando poderes. Miko corta la mano de Harris y se escapa con Ren, la mano de Harris genera un clon de sí mismo. La madre de Tommy descubre que un hombre ha estado protegiéndo en secreto a su hijo. Carlos se pone la máscara de su hermano para convertirse en El Vengador, pero es derrotado por un policía corrupto son superfuerza. Erica utiliza a Molly para poner en marcha E.P.I.C., una tecnología que identifica a evos en todo el mundo.

Cuando Tommy y su madre tienen un accidente de tráfico, Tommy la teletransporta a un hospital antes de desmayarse. Malina y su compañera invisible, Farah, salen del círculo polar ártico, y Malina muestra su capacidad de traer plantas y animales a la vida. Cuando Lucas revela sus poderes a Joanne y quema la lista de Evos, ella se niega a dispararle, pero se aleja de lo que queda de su matrimonio. Tommy se hace un análisis de sangre para ver si puede donar sangre a su madre, debido a las pruebas los agentes federales descubren que es un Evo y acuden a buscarle. José y el cura Mauricio, ambos Evos, son secuestrados. Noah y Quentin quieren entrar en el edificio Renautas abordan a Taylor Kravid y la hacen ver que su madre Erica utiliza sin compasión a los Evos, incluido el novio de Taylor. En Renautas, encuentran a Molly en una habitación llena de Evos conectados a máquinas, Molly toma el arma de Noah y se dispara a sí misma en la cabeza.

Ren reúne a un grupo de aficionados cosplayers de Evernow en Renautas de modo que Miko pueda entrar en el edificio sin ser detectada. Mientras tanto, Tommy ha sido registrado como un Evo y se le inyecta un dispositivo de localización y se entera de que fue adoptado. Todavía dentro de Renautas, Noah, Quentin y Taylor desubren que la empresa se está preparando para la extinción de la humanidad. Uno de los clones de Harris dispara a Farah en Canadá donde Malina trata de luchar contra sus agentes, pero se ve superada por un Evo que puede manipular las sombras. Al volver a casa, Lucas finalmente se enfrenta a la realidad de la muerte de su hijo en el ataque de hace un año. Cuando Noah y Quentin son capturados por Harris, Miko irrumpe, tomando de nuevo su espada y dándoles la oportunidad de escapar. El hombre que ha estado protegiendo a Tommy aparece y le dice que su destino es ayudar a salvar el mundo. Los científicos de Renautas revelan que queda menos de una semana hasta que la radiación solar destruya la tierra.

Noah Bennet toma el asunto en sus propias manos para obtener respuestas muy necesarias. Cuando Tommy hace un descubrimiento sorprendente, él y Emily hacen un viaje inesperado. Por otra parte, Luke sigue luchando con el hecho de que él se ha convertido en lo que él ha estado cazando. Malina encuentra un aliado sorprendente. Miko se queda para salvar a su padre, pero Erica toma medidas para interferir. Mientras tanto, Carlos aprende más sobre lo que realmente está pasando con EVOS de una fuente inesperada.

En un intento de conseguir respuestas, Noah Bennet une fuerzas con Hiro Nakamura para volver al día de los trágicos eventos del 13 de junio de 2014 que lo iniciaron todo. A punto de dar un discurso para conmemorar el evento, Mohinder Suresh recibe un terrible mensaje de Angela Petrelli sobre los verdaderos motivos de Erica Kravid. En Japan, Hachiro Otomo hace un movimiento calculado contra Hiro Nakamura. Mientras tanto, un Luke mucho más feliz y Joanne llegan a Odessa con la esperanza de encontrar una cura para la enfermedad de su hijo.

Como consecuencia de tragedia sin precedentes, Erica Kravid pone su oscuro plan en marcha con Renautas. Hiro y Angela reciben una importante misión que podría cambiar el curso de la humanidad. En Odessa, un angustiado Luke y Joanne se dan cuenta de su trágica misión tras la pérdida de su hijo. Mientras tanto, Noah Bennet tiene una inesperada reunión con Matt Parkman. En Japón, los orígenes de Miko salen a la luz. En otro lugar, la verdad detrás del servicio militar de Carlos se revela.

Noah va en busca de Tommy para revelarle su pasado y guiarle en su destino para detener un evento catastrófico. Los descubrimientos de Taylor sobre su madre, Erica Kravid, conducen a su captura por parte de un grupo clandestino. Erica se intensifica su búsqueda de Tommy y Malina mientras la carrera para finalizar sus peligrosos planes se intensifica. Por otra parte, Emily tiene un encuentro inesperado con Joanne. Mientras tanto, Dearing lleva a Carlos más cerca de encontrar a su sobrino secuestrado y Luke y Malina se separan en un encuentro violento.

Los destinos de Noah y Luke finalmente se cruzan cuando Malina desata su verdadero poder para salvar a los que la rodean. Tommy puede tener que unir fuerzas con su enemiga, Erica Kravid, para completar su misión. Mientras tanto, Carlos se enfrenta a su pasado violento, bajo la atenta mirada de Matt Parkman. Por otra parte, Ren tiene la tarea de la misión imposible de encontrar a Miko.

Tras la misteriosa desaparición de Noah, Luke y Malina se unen para rescatar a Tommy y salvar a la humanidad. En la misteriosa Sunstone Manor, Carlos y Farah luchan junto al haitiano para acabar con Matt Parkman y liberar a los prisioneros bajo su control. Tommy y Miko unen sus fuerzas contra Erica y su plan brutal para el futuro.

Con el fin de la civilización acercándose rápidamente, Erica pone en marcha su alarmante plan de supervivencia con la ayuda de Tommy. Malina se apresura para unirse con Tommy y Luke se le une mientras Quentin y Phoebe conspiran contra ellos. Matt Parkman tiene sus propios planes para garantizar la seguridad de su familia que podrían poner a Taylor en peligro mortal.

A medida que la cuenta atrás hasta el fin del mundo avanza, Tommy se encuentra a sí mismo frente a su mayor reto mientras que Erica toma medidas drásticas para que su plan tenga éxito. Malina trata de cumplir la profecía de su bisabuela para salvar el mundo con la ayuda de Luke y Quentin. Emily y Ren buscan desesperadamente a Miko. Carlos se enfrenta a una elección de vida o muerte.