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Batman y Superman unen fuerzas cuando Lex Luthor inicia un plan en Ciudad Gótica para derrotar al Hombre de Acero, utilizando a varios villanos del Caballero de la Noche. Más tarde, Luthor combina el gas de control mental de Hiedra Venenosa con Kryptonita, logrando controlar la mente de Superman.

Batman y Robin se enfrentan a Superman, quien está bajo el control mental de Lex Luthor. Mientras el villano prepara el lanzamiento de un ejército de robots de LexCorp para conquistar el mundo y tomar el control de las fuerzas militares, los héroes deberán detener su ambicioso plan.

Batman une fuerzas con Flecha Verde, el nuevo integrante de la Liga de la Justicia en Ciudad Gótica, para detener al Conde Vértigo, un villano capaz de alterar el sentido del equilibrio de las personas con un peligroso plan.

Luciérnaga busca aumentar sus poderes con la ayuda de su nueva aliada Blaze, pero un accidente con fósforo radiactivo lo transforma en el peligroso Fósforo. Ahora, el Batiequipo debe detenerlo antes de que use una planta nuclear para destruir Ciudad Gótica.

Batman y Robin unen fuerzas con Flash para detener al Amo de los Espejos, quien planea atrapar a todos en sus propios reflejos mediante su peligrosa tecnología.

Una ola de caos invade Ciudad Gótica cuando sus habitantes comienzan a reír sin control y a deshacerse de sus pertenencias. Batman, Robin y Batichica siguen el rastro del Guasón, quien utiliza un tren de vapor para llevar a cabo su nuevo plan criminal.

Linterna Verde recurre a Batman para encontrar al renegado Sinestro, pero cuando el villano llega a la Tierra, el Pingüino obtiene el anillo de poder y se convierte en una nueva amenaza.

Con la ayuda de un hacker, la mente del Guasón es transferida a una computadora, permitiéndole controlar los nuevos nanobots de Tecnologías Díaz. Con un cuerpo mejorado a su disposición, busca eliminar a Batman, Robin y hasta su propia versión original.

Un grupo de tres estudiantes marginados roba mutágenos del doctor Kirk Langstrom para transformarse en criaturas híbridas con rasgos animales y vengarse de quienes los rechazaron.

Wrath y Scorn, las versiones malvadas del Dúo Dinámico, unen fuerzas con el Guasón, Pingüino, Killer Croc y Ventrílocuo junto a Scarface para ejecutar un peligroso golpe. Batman y Robin deberán enfrentarse a sus retorcidos reflejos para detenerlos.

Cuando Black Mask contrata a Hawkman para ayudar a Shadow Thief a escapar de Arkham y robar un misterioso meteorito, Batman deberá unir fuerzas con el héroe alado para detener sus planes.

Los integrantes con poderes de la Liga de la Justicia comienzan a desaparecer misteriosamente. Batman, Robin y Flecha Verde investigan el caso y descubren que antiguos enemigos y La Unión están detrás de la conspiración.

Los héroes de la Liga de la Justicia enfrentan a sus versiones androides para recuperar sus poderes, mientras Hugo Strange prepara el ataque definitivo de La Unión contra la Tierra.