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Tres meses despues del incidente en la Torre, los Mathesons llegan a la ciudad de Willoughby, Texas, donde no todo es lo que parece.

La vida de Miles está en grave peligro ya que él se encuentra en las garras de Tito Andover. Charlie está decidida a encontrar Monroe. Rachel y su padre, el Dr. Porter, intentan desesperadamente revivir a Aaron. Mientras tanto, Neville trama un plan para infiltrarse en las filas de los Patriotas.

Rachel hace un valiente intento para rescatar a Miles y escapar con la esposa enferma de un miembro de la tribu, mientras que Neville y Jason son atrapados con la guardia baja, asaltado por refugiados violentos. Charlie y Adam están en desacuerdo sobre qué hacer con Monroe. Legiones de hombres de la tribu amenazan a todos en Willoughby, pero con un liderazgo cuestionable y Aaron se enfrenta a la muerte, una vez más.

La dinámica entre Monroe y Charlie comienza a evolucionar. Mientras tanto, las heridas de Miles y Rachel comienzan a sanar, sin embargo, su curiosidad y la toma de conciencia podría ser su perdición. La manipulacion de Neville's hacia un Patriota hace que Maquiavello paresca un querubin y la mente de Aaron trabaja horas extras despierto o dormido con eficacia alucinante. Rachel y Miles comienzan a planear una resistencia a lo que creen que podría ser una ocupación Patriota.

Aaron y Rachel especulan sobre los efectos extremos de la Nano tecnología, mientras que él también confía en Cynthia. Mientras tanto, una figura del pasado accidentado de Miles, un Ranger de Texas llamado John Fry resurge. Fry podría ser la oportunidad de Miles para derribar a los Patriots a lo grande, sin embargo Miles tendra que convencer a Fry. Charlie tiene una sorpresa para Miles y su madre,mientras que la secretaria Allenford guarda un secreto importante para Neville.

Mientras Charlie, Rachel and Gene se preguntan cual es al verdadera lealtad de Monroe’s, el propio Miles está cansado de las intenciones de su antiguo amigo. Mientras tanto, Aaron sigue teniendo visiones que conducen a un sinfín de preguntas.

Cuando Rachel descubre algunas verdades inquietantes, Miles hace lo que mejor sabe hacer para superar los obstáculos y asi cuidar a sus seres queridos. Mientras tanto, Charlie comparte un momento con su madre asi como Neville y Jason continuan con sus luchas entre padre e hijo.

Cuando Miles y su pandilla tratan de escapar de los peligros de su situación actual, Rachel y Gene continúan luchando con su relación, que afecta a Charlie. Mientras tanto, Neville tiene una apuesta con los Patriots.

La relación entre Rachel y Gene sigue siendo tensa como Charlie muestra su mamá lo mucho que ha crecido.Mientras tanto,Neville da a Jason una proclamación determinada.

Porter es rescatado por Charlie y Monroe, quien le exige a Miles que le diga el paradero de su hijo, apenas éste comienza a dar señales de lucidez. Más tarde, Charlie descubre que Aaron se ha ido y Neville conspira con Julia para envenenar a Harlow.

Monroe se encuentra en un territorio poco familiar y tendrá que hacer una elección sobre su hijo, Conner, Mientras Neville y Julia continúan bailando al son de Jason . Gene guía a Charlie para que haga un incómodo descubrimiento

“Cuando Gene decide ir a Willoughby, Rachel y Charlie se sienten obligados a ayudar cuando Miles y Monroe continúan uniendo fuerzas para sobrevivir”.

“Monroe dirige a Connor y Charlie en una misión arriesgada, mientras Miles y Rachel vigilan las cosas en Willoughby. Mientras, Neville consigue una nueva misión y Aaron se reúne con un viejo amigo”.

“Por alguna razón, los ‘todopoderosos’ nanites están muriéndose… y le piden a Aaron que los salve”.

Aaron despierta en un mundo con energía en un pent-house junto a Priscilla. En un aparente día normal de trabajo, Charlie aparece súbitamente para hacerle distinguir la realidad de la ficción. Luego, irá detrás de Rachel en busca de ayuda.

“Monroe, Charlie y Connor consiguen volver a Willoughby, donde descubren que el centro de reeducación de los patriotas está funcionando. Un encuentro con dos de los jóvenes cadetes hace que Rachel y Miles estén en desacuerdo en hasta donde llegar para acabar con los patriotas. Cuando Neville y Jason encuentran un nuevo aliado para su misión, se revela más sobre la historia de los patriotas”.

“Cuando Miles y el Dr. Porter buscan aliados, Monroe intenta coger bajo guardia a los patriotas. Mientras, las maniobras políticas ponen en peligro a Neville y a Jason, mientras Aaron y Priscilla siguen adelante”.

“Ha llegado el momento de que se resuelva el mayor misterio de la temporada. Y uno de los personajes principales morirá…”

Al huir de un grupo de Rangers, el vagón de Miles se accidenta. Monroe, Charlie y Connor regresan al campamento y se preocupan al saber que éste no ha llegado. Así, comienzan de inmediato su búsqueda. En el camino, Charlie es sorprendida por Neville.

Truman obtiene una segunda oportunidad. Charlie encuentra a Miles en un campo casi agonizante. Los patriotas atacan el campamento de Miles y Monroe con gas tóxico. Los servicios de Neville ya no son necesarios y es buscado para ser ejecutado.

Con una navaja en la garganta de Connor, Neville amenaza a Monroe. Aarón y Priscilla han estado desaparecidos durante 24 horas y Rachel está preocupada. Miles se entera de que los Patriotas quieren asesinar a Carver y empezar una guerra.

Miles, Charlie y Monroe atacan a los patriotas, pero deben lanzar un nuevo plan para evitar la guerra entre California y Texas; Neville pone en su punto de vista al presidente Davis. Mientras tanto, Aaron y Rachel se esfuerzan para salvar a Priscilla pero esto tiene consecuencias inesperadas.