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Un día, los tres chicos del Club de Detectives CLAMP se encuentran a una anciana cuyo marido falleció y a quien su cuñado quiere robar todas sus pertenencias. Se preparan para poner a prueba su política feminista de sacar a todas las mujeres de un apuro.

Tras el incidente de la anciana, deciden organizar el Club de Detectives de la Escuela CLAMP. La directora de la escuela será su primer cliente. Su trabajo será encontrar la lista, con los datos de todos los estudiantes de la escuela, que ha sido robada.

El día del cumpleaños de Nokoru, una chica llamada Midoriko le reta a encontrar algo que ella misma ha escondido en el colegio, y para conseguirlo le da tres días.

Un día, gracias a una tarta de manzana, Akira tiene la oportunidad de conocer a una chica, Yukiko Kudo. Akira se esfuerza por ayudarla a salir de una difícil sutiacuón en la que se encuentra.

Nokoru, Suoh y Akira forman un gran equipo de trabajo en su Club de Detectives de la Escuela CLAMP. Pero hay un secreto entre Nokoru y Suoh. Cuando se vieron por primera vez, hace tres años, tuvieron sentimientos muy distintos el uno del otro. ¿Qué sentimientos eran aquellos? Y entonces ocurrió "el incidente".

Una misteriosa mujer, Casablanca, secuestra a Nokoru y a Suoh para beneficiarse del gran talento de Nokoru. Suoh es tomado como rehén. Nokoru siente que Suoh está allí por su culpa. Por otro lado, Suoh intenta escapar usando sus habilidades como ninja. ¿Conseguirán huir de las garras de Casablanca?

Los detectives investigan los informes de un fantasma en el museo de la escuela.

Los detectives investigan las misteriosas llamadas telefónicas y cartas que les han ordenado que apaguen la próxima bola.

Suoh y Nagisa se encuentran por primera vez mientras él la protege de ataques misteriosos.

Nokoru y Suoh compiten en un torneo de béisbol.

Nokoru es secuestrado por Casablanca nuevamente.

Los detectives, Utako y Nagisa se van de vacaciones a una isla tropical.

Los detectives ayudan a un compañero de estudios a encontrar a su hurón perdido.

Después de un accidente, Suoh ha perdido la memoria de los últimos tres meses, incluida su relación con Nagisa.

Nokoru encuentra una búsqueda del tesoro en los Archivos del Consejo Estudiantil y los detectives viajan de ida y vuelta por el campus para resolver el misterio.

Los detectives continúan investigando quién es el misterioso pirata informático a medida que sus bromas se vuelven cada vez más peligrosas.

El hacker continúa causando problemas en el campus y los detectives comienzan a perseguirlo con mayor determinación.

Nokoru ha estado tan sobrecargado de trabajo debido al pirata informático que ha comenzado a cometer errores descuidados en el campus y decide que ya no es apto para ser presidente del consejo estudiantil.

Nokoru ha regresado y se detalla el pasado de Idomu.

Idomu ha lanzado un ataque completo contra Nokoru y retiene a todo el Clamp School como rehén.

Las bromas de Idomu han ido demasiado lejos ahora y amenazan a toda la escuela. ¿Es este problema demasiado grande para que incluso los detectives de Clamp School lo resuelvan?