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Afro ha sido testigo de la muerte de su padre a manos del hombre que reclamaba el título del "Número Uno". Ahora, afro busca venganza y emprende un viaje para reclamar de nuevo el titulo perdido por su padre.

Afro revive su duro pasado a través de los sueños, momento en el cual es encontrado por una chica llamada Okiku que cura las heridas del samurai.

En el clan de los Siete, sigue persiguiendo a Afro. Este tendrá que enfrentarse al enemigo mas difícil que podía encontrarse ... sí mismo.

El pasado, vuelve para enseñarle a Afro Samurai una lección sobre las consecuencias que conlleva escoger la venganza de su padre en lugar de a su familia adoptiva y lo que realmente significa llevar el 'Número dos' diadema.

Afro tendrá que luchar con su amigo de la infancia Jinno, que los 7 trajeron de entre los muertos. De esta batalla dependerá si afro consigue llegar al lugar donde le espera el portador de la bandana numero uno.