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Cuando siete extraños son secuestrados y se despiertan en un pueblo abandonado, se crea la confusión. Pronto descubren que las cámaras están vigilando todos sus movimientos y quienquiera que los haya tomado ha tomado medidas extremas para evitar que se vayan. El misterio se complica después de la cena en un misterioso restaurante chino, donde la fortuna de Janet Cooper dice: "Mata a tu vecino y quedarás libre".

Mientras el grupo intenta entender por qué fueron secuestrados, Moira remueve dolorosamente el dispositivo de implante que se ha incrustado en el muslo de cada persona. En otro lugar, tratando de escapar de regreso a sus vidas normales, Joe y McNair prueban cuidadosamente los límites de la cerca invisible. Mientras tanto, de vuelta en San Francisco, la curiosa búsqueda del reportero Renbe de información sobre la madre desaparecida Janet llega a un callejón sin salida.

Después de una semana de intentos de fuga que terminan en fracaso, la tensión comienza a crecer dentro del grupo. Cuando aparece un helicóptero sobre los rehenes, tienen la esperanza de que haya llegado ayuda, pero la nave solo se mantiene suspendida el tiempo suficiente para dejar caer una caja misteriosa. Mientras tanto, el reportero de San Francisco Renbe se vuelve a poner en el caso de la desaparición de Janet, a pesar de las advertencias de detener su investigación.

El Night Manager informa al grupo que uno de ellos podrá realizar el check out. Mientras tanto, Joe tiene una reunión secreta con alguien en la ciudad y Tori recibe una visita propia.

Después de descubrir que Tori no está, la búsqueda del grupo de ella revela a una misteriosa recién llegada con el nombre "Erika" tatuado en su brazo. Erika reacciona violentamente a su nuevo entorno y ataca físicamente a Joe, Janet, Blackham y Moira. Mientras tanto, un sospechoso Renbe cree que ha encontrado un vínculo entre el destino de Tori y la desaparición de Janet.

Cuando Joe cae repentinamente gravemente enfermo, el grupo se alarma. Mientras tanto, Erika descubre un antídoto, pero se niega a dárselo a Joe a menos que él aclare su secreto. En otra parte, la reportera Renbe y Kat asisten al funeral de Tori en Roma y descubren que su padre, el embajador de Estados Unidos en Italia, también está investigando su desaparición.

Cuando Joe le confiesa todo lo que sabe sobre los secuestradores y su organización a Janet, se pone en una posición vulnerable con todos los involucrados. Enojados y desconfiados de la participación de Joe en "el programa", Blackham y Erika idean un plan para usarlo como una posible forma de escapar. Mientras tanto, Kat, Renbe y Stefano creen que Joe es la clave para encontrar a Tori y Janet.

Cuando Joe se despierta atado a una mesa, se le dice que debe ser "reeducado" para poder regresar al programa o morirá. Luego soporta una vertiginosa variedad de sueños, alucinaciones y flashbacks diseñados para llevarlo de regreso al programa y lejos de Janet. De vuelta en la ciudad, tanto Blackham como McNair se ven obligados a aceptar sus turbulentos pasados. En otra parte, continuando su viaje en Sudamérica, Kat y Renbe intentan localizar a la única persona que alguna vez escapó del "programa".

Después de regresar a la ciudad, los problemas de Joe empeoran debido a que sufre los espantosos efectos secundarios causados ​​por su "reeducación". El resto del grupo se pregunta si simplemente estarían mejor sin él. Preocupado por el caótico desastre en el que se ha convertido la ciudad, el director de "El Programa" envía a un sorprendente nuevo gerente nocturno y segundo al mando, Liam Ulrich, para restaurar el orden. Mientras tanto, Renbe y Kat son asaltados por la policía local de América del Sur, lo que termina con el arresto de Renbe.

Cuando el nuevo gerente nocturno, el Sr. Ulrich, informa al grupo que todos los "huéspedes" están restringidos al hotel, se sienten aún más atrapados. El nivel de inquietud aumenta cuando regresan a sus habitaciones y encuentran objetos muy personales que les recuerdan su pasado. Mientras tanto, Kat y Renbe exploran una ciudad abandonada duplicada y descubren mucho más de lo que esperaban.

Incapaz de confiar en Joe, Janet pone su mirada en Ulrich como su boleto para salir de la ciudad. Morse y Blackam comienzan a sentirse cómodos con Ulrich debido a su amable personalidad y amabilidad, pero pronto se dan cuenta de sus verdaderas intenciones. Mientras tanto, Kat y Renbe han regresado a San Francisco, solo para descubrir que sus vidas en Estados Unidos han sido severamente cambiadas por "El Programa".

Cuando el grupo va en busca de Janet y Ulrich, descubren que todos sus suministros han desaparecido. Después de encontrar a la pareja, acuden a Ulrich en busca de ayuda, pero pronto se dan cuenta de que se quedan solos para sobrevivir. Mientras tanto, Kat y Renbe reciben información crucial de un médico forense que los acerca peligrosamente a "El Programa".

Después de sobrevivir a un accidente de furgoneta inesperado, los secuestrados finalmente escapan y deciden ir por caminos separados. Todos intentan regresar a sus vidas normales, sin embargo, "El Programa" no tiene la intención de dejarlos ir. Mientras tanto, Renbe y Kat corren para ayudar a Janet, solo para terminar reuniéndose con el resto del grupo en un territorio inquietantemente familiar.