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Seis meses después de la marcha de su hermano, Daniel ha sido recolocado en su puesto y el índice de casos resueltos ha disminuido drásticamente. Además, Serrano ha emprendido una carrera política y exige resultados para apoyar su campaña. Mientras, Lorenzo está frustrado por no encontrar su vocación y no termina de encajar en la Escuela para Mentes Brillantes de Québec. Su cabeza sigue en Madrid, por lo que decide volver a España para continuar atrapando malhechores con su hermano. Una vez reunidos, los Montero tendrán que enfrentarse al “asesino de la Iglesia”, un perturbado que acaba con la vida de los sacerdotes dentro de sus parroquias.

Unos obreros descubren un esqueleto tras la pared de una casa-museo en reformas de una familia castellana de rancio abolengo en la que Lorenzo se encuentra de visita. Pese a que el cadáver lleva allí cinco siglos, el chico insiste en investigar si el suceso fue un asesinato. Por otra parte, un delincuente de poca monta aparece atropellado en una carretera. Todo apunta a que ha sido un accidente, pero Daniel tiene motivos para sospechar que Serrano puede estar detrás de este extraño caso.

La brigada de Daniel Montero descubre el cadáver de un luchador clandestino pero no consiguen las pruebas suficientes como para desmantelar la organización mafiosa para la que peleaba. Con la ayuda del confidente Quisquilla, Daniel y Mansilla se infiltrarán como luchadores ilegales.

Una novia muere envenenada en el altar en el que está a punto de contraer matrimonio. Daniel, Lorenzo y Carmen -que se encontraban en el parque de atracciones pasando un día familiar- terminan involucrados en la boda y retienen a todos los invitados para poder realizar una primera investigación. A lo largo del día van saliendo a la luz secretos de familia que comienzan a dar forma al caso. Mientras tanto, el comisario Serrano prepara las fotos familiares que utilizará en su recién estrenada campaña política, para las que tiene que fingir ser un hombre felizmente casado y con un hijo al que adora. Por su parte, Blasco y Zambrano competirán por la atención de una atractiva mujer que ha sido víctima de un atraco. Lo que no saben en un primer momento es que la chica es una hábil vendedora, que se aprovechará de la situación para hacerles comprar objetos que ninguno de los dos necesita.

Daniel y Lorenzo tratarán de resolver el caso de un secuestrador de niños que podría terminar perjudicando la carrera hacia el poder del subcomisario Serrano. Las víctimas son infantes con pocos recursos y con problemas familiares, a los que nadie echa de menos. Serrano, enfrascado de lleno en su campaña electoral, exigirá resultados inmediatos a su equipo de policías, ya que su asesora le recomienda ofrecer una imagen familiar y no puede permitir fallos en la captura de este secuestrador.

Un caballo cae fulminado durante la carrera y el jinete resulta muerto en la caída. Las primeras pruebas apuntan a una combustión espontánea en el organismo del animal, pero los hermanos Montero encuentran indicios de que el asunto no es tan sencillo como parece y comienzan a investigar en profundidad. Por otra parte, la aparición de unas antiguas fotografías en las que aparecen juntos el subcomisario Serrano y Carmen desata la ira de Daniel. La relación entre ambos jóvenes está cada vez más deteriorada por los celos y la idea de marcharse a vivir juntos empieza a tambalearse.

La brigada de Daniel Montero inicia una investigación para encontrar al asesino de Luis Yebra y todo apunta a un agente de seguros -supuestamente enfermo de esquizofrenia- que se presenta con la palabra "culpable" grabada con un cuchillo en la frente. Por su parte, el comisario Serrano sigue muy de cerca los pasos de su candidato rival, ya que tiene muy claro su objetivo en las elecciones y no está dispuesto a permitir que nadie se lo arruine.

Dos hermanos mueren el mismo día en un hospital. Uno después de ser atracado y el otro mientras le estaban haciendo un transplante de corazón donado por su hermano. Los policías investigarán el caso y descubrirán que no es una fatal coincidencia.

Aunque todas las pruebas apuntan al agente como responsable de la muerte de un joven magrebí, los hermanos Montero no tardarán en descubrir que el asunto es más complejo de lo que podría parecer en un primer momento. La presencia de la madre de Blasco, que se ha trasladado junto a los policías para apoyar a su hijo, será clave en la resolución del caso. Para poder descubrir al verdadero autor del crimen, Mansilla tendrá que hacerse pasar por experto jugador de póquer. Por su parte, el comisario Serrano se muestra muy contrariado por la detención de uno de sus hombres, ya que se trata de una cuestión delicada que podría dañar su imagen en plena campaña electoral.

Daniel Montero, su hermano Lorenzo y el resto de los agentes de la brigada investigarán la misteriosa muerte de una ambiciosa periodista del corazón que acaba de publicar un polémico libro en el que critica a todos sus compañeros. Su inesperada muerte, que en un primer momento se cree debida a un ataque al corazón, levantará las sospechas entre los agentes por la cantidad de enemigos que se había granjeado. El caso comienza a enturbiarse cuando el vidente que encontró el cuerpo sin vida de la periodista invita a los sospechosos a realizar una sesión televisiva de espiritismo en directo para encontrar al asesino. Por su parte, Carmen y Daniel se reencontrarán para tratar de superar sus problemas de pareja mientras en la comisaría, María hará lo posible por hablar con el joven para comunicarle algo muy importante.

El comisario Rivas, encargado de investigar la muerte del ex-miembro de la brigada de Serrano, ordenará el cierre de la comisaría ya que, hasta que se demuestre lo contrario, todos pueden ser culpables. Los agentes se convertirán en protagonistas de un juego de intriga llevado a cabo por el comisario, que irá descartándolos uno a uno como si de una novela de Agatha Christie se tratara.

Serrano es acusado de corrupción después de que se descubra una conversación que mantuvo con un importante empresario. Para lavar su imagen de cara a las elecciones, se ofrece como rehén en un atraco que él mismo ha planeado.

Un asesino que ataca a parejas de novios por la calle llama a un programa radiofónico y afirma que es miembro del cuerpo de policía. A partir de la noticia la gente empezará a desconfiar de la policía, cosa que dificultará la investigación.