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El Coleccionista ha atrapado a los Guardianes de la Galaxia en su prisión especial. Ahora los Guardianes de la Galaxia deben destruir y escapar del Coleccionista.

Mientras están en la Tierra, los Guardianes de la Galaxia se encuentran con Spider-Man, que los ayuda en su lucha contra Thanos, quien escapó de su prisión subterránea y se unió al simbionte Carnage.

A medida que los Guardianes de la Galaxia y Spider-Man reanudan su lucha con Thanos poseído por Carnage, descubren que persigue el simbionte Venom que se lleva a cabo en Horizon High. Después de que Rocket Raccoon derriba a Max Modell, un ataque de Thanos hace que Spider-Man se vincule al simbionte Venom mientras Thanos continúa con su plan de difundir los simbiontes en todo Manhattan.

Los Guardianes han capturado a Thanos, pero no es una tarea fácil transportar al criminal más buscado en la galaxia, ya que son blanco de los cazarrecompensas de Kallusian, Ravagers e incluso Rhomann Dey y Sam Alexander.

Los Guardianes persiguen a Thanos y Sam Alexander al planeta natal de Thanos, Titán, donde descubren una arena de gladiadores con el padre de Sam, Jesse Alexander, y los que ha entrenado allí.

A medida que los Guardianes de la Galaxia obtienen todo lo que quieren después de entregar a Thanos a los Nova Corps, Rocket Raccoon busca una recompensa. Compite con Wraith en la captura del artista de estafas alienígenas, Ichthyo Pike. Mientras tanto, Groot busca a Rocket Raccoon donde dos criminales lo roban y arrojan su cuerpo en un planeta desértico. Sus habitantes lo encuentran como un espantapájaros para proteger el agua y los cultivos de un grupo de Gerboids.

En el Templo de Morag, Gamora encuentra a Nebula allí y la trae en expiación por los daños que ha causado a otros planetas dándoles unidades que también los harían perseguir por sus habitantes. Desafortunadamente para ellos, Yondu y Kraglin conducen a los Ravagers a saquear los mismos planetas para robar las unidades que les han dado. Ahora Gamora y Nebula deben trabajar juntas para reclamar cada una de las unidades y vencer a los Ravagers.

Mientras está en Knowhere, Drax no tiene ganas de ser un destructor ya que varios oponentes intentan reclamar su título. Con la ayuda de Broker, Drax intenta varios trabajos ocasionales en Knowhere hasta que tiene un encuentro con el autoproclamado, Campeón del Universo.

En Conjunción, Star-Lord comienza su propio programa de televisión llamado "Star-Lord's Super Awesome Variety Hour" donde sus invitados incluyen a Fandral y un segmento de "Mystery Ex" que presenta a Lucy y Supergiant donde el Gran Maestro arregla el espectáculo. Otras cosas vistas en Conjunction Galactic Network incluyen un informe de noticias de Nova Star Blaster secuestrado en el que están Rocket Raccoon y Groot, el programa de televisión, NOVAS protagonizado por los Nova Corps donde Rhomann Dey rescató la cápsula de escape de Gamora y un comercial de Drax, "The Flame Parrilla".

Desperdiciando sus riquezas y apenas sacando al Milano del depósito, los Guardianes de la Galaxia toman un trabajo de transporte que Howard el pato les ofrece cuando el artículo que necesita está en el espacio Kallusian. Aunque no saben que están robando a los Kree y tienen un encuentro con una acusadora Kree llamada Phyla-Vell.

Los Guardianes de la Galaxia se encuentran en una prisión Kree llamada el Monolito de Justicia Kree dirigido por la Doctora Minerva después de haber robado su "paquete" que luego fue tomada por Howard el Pato. Bajo las órdenes de la Inteligencia Suprema, la Doctora Minerva debe torturarlos para que confiesen antes de ser ejecutados. Rocket Raccoon presenta un plan para sacarlos.

Para descubrir quién los formó después de escapar del Monolito de Justicia Kree, los Guardianes de la Galaxia persiguen a Howard el Pato en Knowhere. Él confiesa que el Coleccionista lo hizo establecer a los Guardianes de la Galaxia a cambio de ver el exterior de su torre y también lo traicionó. Phyla-Vell continúa persiguiendo a los Guardianes de la Galaxia cuando el Coleccionista ha saboteado el Milano para atacar a Hala.

Después de que el Coleccionista aparentemente destruye el planeta Kree, Hala, Phyla-Vell se une con los Guardianes de la Galaxia para llevarlo ante la justicia. Descubren que el Coleccionista convirtió la tecnología específica Kree llamada Generador de Agujeros Negros en un motor de compresión molecular para reducir a Hala.

Los guardianes sin tiempo de detener la explosión, no tienen de otra que entrar al vórtice negro para salvarse; se separan llegando un mundo diferente basado en sus emociones. Gamora deberá escapar de un mundo de lo que más odia: ser una princesa, Drax está ahora en una realidad donde es un héroe famoso, pero nada es lo que parece y deberá salir antes de que la cuarta pared lo acabe.

Rocket despierta en una instalación de envió de paquetes donde creen que es animal, Groot llega a ayudarlo pero no es quien aparenta; mientras que el verdadero Groot busca la forma de salir de su pesadilla inducida por el ente llamado vórtice negro.

Quill despierta dentro de su nave pero todo está hecho de plastilina, dirigiéndose hacia una estrella ardiente y debe buscar la forma de salir antes de que se derrita; mientras Rocket junto con Drax llegan a un mundo de caricatura donde deberán huir de Ronan el exterminador de plagas.

Gamora junto a Quill deberán ganar en una realidad basada en un videojuego de los 80's, donde obtienen un mapa de la salida de vórtice negro, ahora todos reunidos deberán detener y rescatar al verdadero Groot de una versión posesionada por la entidad llamada vórtice negro que quiere escapar para conquistar el universo.

Después de escapar del Vórtice Negro, los Guardianes de la Galaxia se encuentran en un museo en honor a ellos después de su aparente muerte. Además, se encuentran con Rhomann Dey, quien afirma que Nova Prime ha convertido a toda la galaxia en un estado policial donde cualquier miembro de Nova Corps que se opone a ella es degradado de que Dey fue o arrestado como Sam Alexander.

Cuando los Guardianes de la Galaxia regresan a Knowhere, una Valquiria llega para llevar a los Guardianes de la Galaxia a Asgard bajo las órdenes de Thor. Valquiria afirma que los robots en cuestión son Darkhawks que previamente invadieron Asgard hasta que los Asgardianos los expulsaron a su propio reino privado. Antes de que eso pueda suceder, compiten con versiones robotizadas de J'Que, Cosmo y Star-Lord.

Ahora en Asgard, los Vengadores y Valquiria se encuentran con Thor, que acaba de regresar del Consejo Galáctico, donde planean detener la invasión Darkhawk. Después de una pelea con el Destructor, los Guardianes de la Galaxia son encarcelados junto con Thor y Loki por desobedecer las leyes de Odin, mientras que Heimdall y Valquiria son reasignados para proteger las cámaras de Odin. Durante este tiempo, se revela que los Darkhawks fueron creados por el hermano de Odín, Serpiente en un complot anterior para conquistar Asgard.

Con Odín aprobando su plan, los Guardianes de la Galaxia viajan al Reino Darkhawk para liberar a Rocket, a todo el Consejo Galáctico, y a toda la población de Knowhere, mientras que también plantan el explosivo de Rocket Raccoon en el núcleo de energía en el Reino Darkhawk. Aunque tendrán que lidiar con Serpiente.

Serpiente se ha escapado de la Dimensión Darkhawk y ha infectado el Árbol del Mundo como parte de sus planes para reclamar a Asgard. Después de tomar a Gungir de Odin e incapacitar a la mayoría de los asgardianos, los Guardianes de la Galaxia deben trabajar con Loki para derrotar a Serpiente. Aunque tendrán que atravesar la Forja de Asgard y el Gigante de Piedra que lo protege primero.

Ahora que Serpiente está en control de Asgard y Thor y Odín han sido incapacitados, los Guardianes de la Galaxia y Loki están a la deriva en un fragmento del Puente Bifrost. Usando su poder, Loki envía a los Guardianes de la Galaxia a las diferentes partes de la galaxia para reunir refuerzos. Rocket Raccoon gana Iron Man y Hulk, Groot gana Yondu y Nebula durante la operación de los Ravagers en Veros Seven, Gamora gana a Sam Alexander, Star-Lord gana a Howard el Pato en conjunción después de una breve pelea con el Campeón del Universo, y Drax ayuda a Cosmo en lidiar con los sentimientos encontrados de Knowhere.

Habiendo obtenido algunos aliados para ayudar a combatir a la Serpiente, Loki afirma que necesitarán los fragmentos de la espada Dragonfang que fue forjada en la gran fragua de Asgard por Odin y que se rompió cuando Hela usó por última vez en el Árbol del Mundo corrompido. El primer fragmento es Soonevh, que Rocket Raccoon, Groot, Howard el pato y Cosmo trabajan para obtener de su estrella cercana. El segundo fragmento está en una base militar en Sirius IV que Gamora, Drax y Hulk trabajan para obtener mientras evitan los Ultroides.

El fragmento final de Dragonfang está en Niffleheim, donde gobierna Hela y donde nadie ha salido con vida. Con Hela con amargura de que Odin la desterrara después de que Dragonfang rompiera a Serpiente, Loki planea usar sus encantos para persuadir a Hela de que los ayude a luchar contra Serpiente. Incluso cuando Dragonfang está reforzado, se muestra que Hela tiene a Serpiente como su huésped para que pueda obtener a Loki.

Rhomann Dey rescata a los Guardianes de la Galaxia de ser atrapados en el espacio. Aprenden que Serpiente y sus corruptas esporas del Árbol Mundial han derrotado a todos los miembros de Nova Corps que han sido enviados a Asgard. Mientras Irani Rael afirma que las fuerzas militares de Rigellians, Spartax y Kree están ocupadas luchando contra un sitio para ayudar a luchar contra Serpiente, los Guardianes de la Galaxia no tienen más remedio que contar con la ayuda de Thanos, que es un fanático del trabajo de Hela.