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Yuri está en la ciudad, arreglada para una cita, cuando un agente moribundo de la 3WA (Agencia Mundial de Obras y Bienestar) le entrega una tarjeta especial para que la lleve a la sede central. Yuri se muestra reacia a aceptarla, hasta que aparecen unos hombres con uniformes azules y comienzan a perseguirla. Yuri le pasa la tarjeta a su compañera Kei, que tampoco está muy dispuesta a involucrarse, pero de algún modo los hombres consiguen arrebatársela. Kei y Yuri salen tras ellos, aunque también deben escapar de sus perseguidores cuando finalmente recuperan la tarjeta. La persecución las lleva por los barrios más peligrosos de la ciudad, dejando a su paso un rastro de destrucción.

Kei y Yuri se encuentran en un aeropuerto escoltando a unos hombres hasta el avión, pero estos reciben disparos. Las chicas persiguen al asesino, que resulta ser una mujer hermosa y muy hábil llamada Lady Flair. Tras fracasar en su intento de capturarla, descubren que la Policía Militar la ha detenido. Sin embargo, Kei no se cree esa versión y, más tarde, ambas irrumpen en la base militar, donde se están desarrollando robots gigantes con forma de araña.

Al ver al pez gordo Waldess en las instalaciones de su corporación GCN, Kei intenta enfrentarse a él, pero sus guardaespaldas la detienen y la expulsan. Frustrada y harta de la situación, Kei decide renunciar. Mientras tanto, Yuri recibe la misión de proteger a un neurocientífico, pero se mete en problemas cuando Lady Flair irrumpe para asesinarlo. Waldess se retira temporalmente a un crucero que navega por el océano de un planeta plagado de peligrosos remolinos. Kei va tras él, pero se encuentra en apuros al descubrir que Lady Flair también está a bordo. Yuri acude entonces en su ayuda.

El profesor Kupps ha llegado a la sede central de la 3WA, pero ha ocultado su mente dentro de un mundo virtual de rol creado por él mismo. Ahora le corresponde a Yuri entrar en ese mundo y rescatarlo. Kei abandona las instalaciones, pero en el metro se encuentra con los hombres de uniforme azul del primer episodio y descubre que planean atacar la 3WA y matar a Kupps. Mientras Yuri se adentra en una fortaleza y combate monstruos fantásticos dentro del mundo virtual, Kei termina siendo arrastrada de vuelta a la sede de la 3WA.

Gracias al testimonio de Kaps, la GCN está siendo investigada. Los representantes de Lucifer deciden que Waldess es demasiado peligroso, especialmente porque sigue persiguiendo a Siren, así que contratan a una asesina para eliminarlo: ¡nada menos que Lady Flair! Kei lleva su arma a reparar, pero la 3WA se la confisca. Mientras tanto, Yuri recibe una nueva compañera algo despistada llamada Lilly. Ambas deben ayudar a la Unidad 9 a vigilar a Waldess en un puerto espacial, pero la situación se complica cuando otros asesinos comienzan a actuar contra él.

¡Waldess se ha infiltrado en la estación espacial Siren! Tras tomar el control de las transmisiones y declarar que conquistará la galaxia, Yuri y Lilly son enviadas junto con la 3WA para combatirlo. Sin embargo, Lilly decide abandonar la misión a mitad de camino, dejando sola a Yuri. Mientras Kei debe tomar una decisión sobre el futuro de las Lovely Angels, Lady Flair se enfrenta a los fantasmas de su pasado.

Kei y Yuri viajan junto con Touma, un compañero consultor de problemas y experto en informática, a World's World, un parque temático retro que recrea la sociedad japonesa de la década de 1990. Su misión consiste en proteger a Touma mientras este resuelve unos problemas del sistema relacionados con un virus informático.

Kei y Yuri reciben alojamiento en un internado femenino de la época del siglo XX. Yuri disfruta mucho de su vida como estudiante de intercambio. A Kei, en cambio, le importa bastante poco, hasta que se entera de las historias de fantasmas que rodean al colegio y comienza a experimentar sus propios encuentros terroríficos.

Kei y Yuri descubren a un estafador llamado Calbee que se hace pasar por consultor de problemas. Ambas lo persiguen con la esperanza de conseguir suficiente dinero de recompensa para permitirse una cena en un costoso restaurante francés. La persecución las lleva a las zonas al aire libre de World's World. Mientras tanto, Calbee intenta seducir a Yuri al mismo tiempo que busca una oportunidad para escapar.

La lluvia sorprende a Yuri y Touma en la ciudad, por lo que ambos terminan refugiándose en una floristería. Allí, Touma se enamora de una joven que trabaja en el establecimiento. Kei y Yuri se dan cuenta del cambio de humor del aficionado a la informática y no dudan en aconsejarlo sobre cómo reunir el valor para invitar a salir a la chica, una idea que le resulta aterradora.

El último día antes de la reapertura del puerto espacial, una bomba destruye la residencia de Touma y las chicas. Kei y Yuri vuelven a asumir sus puestos como guardaespaldas. Touma intenta localizar al responsable, pero, vayan donde vayan, siguen apareciendo más androides que amenazan su vida.

Kei viaja en avión cuando una aeronave de combate enemiga comienza a perseguirlos y derriba el aparato sobre unas montañas cubiertas de nieve. Kei consigue salvar a un bebé al saltar en paracaídas justo antes del terrible impacto y la explosión. Sin embargo, no solo tiene que tranquilizar y cuidar al pequeño, sino también enfrentarse a los villanos que los persiguen con intención de matarlos.

Una adolescente llamada Monica ha pasado toda su vida entrenándose para continuar con la peligrosa tradición familiar de asesinos a sueldo. Su primera misión consiste en acabar con las Dirty Pair. Kei y Yuri viajan a un complejo vacacional para relajarse, pero pronto deben mantenerse alerta cuando comienzan a aparecer bombas, trampas y ataques mortales por todas partes.

La 3WA lleva tiempo siguiendo la pista de un jefe criminal que rara vez aparece en público, excepto ante los ganadores de un torneo mundial de voleibol de playa. Kei y Yuri reciben la misión de participar y ganar el torneo, pero antes deberán someterse al extremadamente riguroso entrenamiento de uno de los excéntricos instructores de la 3WA.

Kei descubre que Yuri está pasando el rato con un adolescente y se acerca para darle una palmada amistosa en la espalda. ¡Pero la cabeza de Yuri sale volando! Resulta que el chico ha creado un androide de tamaño real de Yuri, la chica de la que está enamorado. ¡Vaya metedura de pata! Kei se disculpa, pero la 3WA exige algo más que unas disculpas. Mientras reparan el androide, ordenan a Yuri que sustituya a su doble. Yuri protesta hasta que descubre que el chico pertenece a una familia extraordinariamente rica e influyente que incluso financia a la 3WA. ¡Esta es su gran oportunidad de conseguir por fin una cita y casarse con un hombre rico, mientras que el chico podrá estar con la Yuri de verdad! Sin embargo, él solo aprecia las cualidades ideales de su Yuri: que sea dulce e inocente. Rechaza los rasgos más realistas que ella comparte con cualquier otra chica. ¿Podrá Yuri conquistar su corazón sin dejar de ser ella misma?

Un delincuente que ha escapado de un transporte penitenciario llega a un acuerdo con un jefe criminal para pilotar un avanzado meca de asalto. Sin embargo, antes quiere utilizarlo para atacar al jefe Poporo de la 3WA. Poco después, comienzan a estallar bombas por toda la ciudad y la vida del jefe corre peligro cuando el meca asalta la sede central de la 3WA. Kei y Yuri intentan protegerlo, pero la situación se complica aún más cuando la hija del jefe aparece en la oficina de visita.