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House en est à huit mois de prison. En raison des coupes budgétaires, l'administration doit libérer des places et propose donc à House une libération pour bonne conduite dans les cinq jours. La nouvelle de la libération du médecin se répand vite dans la prison, et les autres détenus veulent s'approprier tous ses biens. Plus problématique, House doit aussi donner ses vingt dernières pilules de Vicodin à Mendelson, le chef d'un groupe de détenus violents.

House est en prison avec une peine prolongée mais il reçoit une offre inespérée : Foreman, le nouveau doyen de l'hôpital, lui offre une libération conditionnelle s'il s'attache à résoudre en 12 heures le cas de poumons qui ont un comportement proche de la vie autonome depuis la mort du donneur et dont il faut s'assurer qu'il est viable pour une transplantation qui pourrait sauver une patiente de Wilson.

Benjamin, un millionnaire qui vit chichement, perd connaissance sans explication alors qu'il venait de faire un don d'un million de dollars à une association. House prend le dossier de cet homme généreux et se retrouve avec une équipe exclusivement féminine : le Dr Park, ainsi que le Dr Adams qu'il a appelé.

Le dirigeant d'une entreprise américaine est pris de troubles de la vision à la veille de la décision de la délocalisation de son entreprise. House s'en occupe espérant trouver un mécène pour son service. Le Dr Park pense a une thyrotoxicose. House s'en occupe et force le patient à financer son service en échange de ne pas révéler que ses problèmes de santé puissent être d'ordre psychiatrique. Mais le patient se met à vomir du sang.

Un homme, très apprécié dans sa ville, tombe subitement malade alors qu'il couchait avec une adolescente. Chase est de retour dans l'équipe, ainsi que Taub, mais qui doit s'occuper de ses deux filles. Ce dernier apprend également que House a lancé un pari sur la filiation de ses filles. Après tergiversations, Taub décide de faire un test de paternité.

Un adolescent, qui veut suivre les pas de son père et devenir artiste de cirque, est admis à Princeton-Plainsboro pour une paralysie partielle. L'équipe de House se charge du cas et pense d'abord à une endocardite puis à un syndrome de Sjogren et enfin à une anémie aplasique nécessitant une greffe de moelle osseuse. L'équipe demande à la mère de l'adolescent des renseignements sur son père biologique pour qu'il puisse faire don de sa moelle. Le père refuse et House pense que la mère cache quelque chose de bien plus grave.

Le service diagnostic reçoit le dossier d'Iris, une adolescente souffrant d'anaphylaxie mais de cause inexpliquée. La mère avoue lui donner du diazépam pour calmer son humeur, mais de nouveaux symptômes apparaissent, a priori causée par une grossesse. Or, l'adolescente affirme ne pas être active sexuellement. L'équipe a un nouveau mystère à résoudre avec Chase : Park remarque que celui-ci se montre très apprêté de sa personne.

Un procureur respecté fait une attaque cardiaque en plein milieu d'un procès. Outre les symptômes physiques, le patient s'avère être très paranoïaque : il possède chez lui une pièce renfermant plusieurs fusils d'assaut. L'équipe, qui pensait à un empoisonnement, doit maintenant déterminer si c'est la maladie qui le rend paranoïaque ou s'il s'agit d'un symptôme neurologique.

Un patient souffrant de maladie d’Alzheimer est admis en urgence à l'hôpital lorsqu'il présente des signes de violence incontrôlable durant un simple entretien de routine. Alors que l'équipe le soigne, House décide d'affronter Foreman en plaçant dans son bureau plusieurs cartes de visite sur lesquelles il écrit ce que le patient fera ou non.

House soigne une jeune fille qui prétend avoir des troubles respiratoires mais il remarque qu'elle n'est pas apparentée à son père comme elle le prétend. Après le départ de son faux père, la fille saigne de l'oreille. House, désormais libre, réunit son équipe dans un restaurant très éloigné de l'hôpital où ils aperçoivent tous Foreman et sa nouvelle conquête.

House se fait interroger par un certain Walter Cofield, ancien mentor de Foreman et actuel dirigeant du service de neurologie. Un professeur de chimie qui s'est effondré en joggant par temps neigeux a été admis à la clinique récemment. Mais il est ensuite devenu très violent et a attaqué Chase qui s'est retrouvé en salle de réanimation. House, Taub, Park et Adams sont interrogés séparément.

Chase se réveille trois semaines après son opération. Alors qu'il récupère doucement de sa blessure, il reçoit la visite de House qui parle d'un énième cas mais lui claque la porte au nez.

Un conseiller conjugal est sur le point de faire une intervention publique quand il s'effondre en plein discours. House examine le cas avec son équipe quand il décide de nommer un chef parmi les différents membres.

House et son équipe s’occupent du cas d'un non voyant, indépendant et à succès, qui est frappé par une mystérieuse maladie alors qu'il s’apprêtait à demander sa petite-amie en mariage. House et son équipe mettent tout en œuvre pour le sauver et, au cours de cette épreuve, Will doit faire face à une décision qui pourrait changer à jamais son existence. Pendant ce temps, House reçoit la visite surprise de sa mère qui lui parle d’une nouvelle relation qu’elle entretient.

Un militaire revient d'Afghanistan les menottes aux poignets pour avoir diffusé sur Internet les vidéos d'une opération militaire ayant causé la mort de plusieurs civils. Quand il perd connaissance et est pris de spasmes, il est envoyé au service diagnostic du Princeton-Plainsboro.

L'équipe et House s'intéressent au cas d'un joueur de hockey de 22 ans qui s'est évanoui en crachant du sang suite à une bagarre lors d'un match. En même temps, House lâche une bombe à Wilson, et Wilson propose à Park de l'aider à changer de mode de vie.

L'équipe de House prend le cas d'un homme pleurant du sang. En même temps, House recherche une nouvelle prostituée, son ancienne favorite Emily arrêtant pour se marier. La "compagnie" d'Emily lui manquant, House aidé de son "épouse" Dominika essaye de saboter la relationn d'Emily

House et son équipe s'occupent du cas d'un jeune garçon qui rêve d'être violemment étranglé, puis se réveille sans pouvoir respirer. Pendant ce temps, Park rêve de ses collègues, ce qui provoque au sein de l'équipe, ce qui les amène à s'interroger sur a signification de ces rêves. Dominika découvre un secret qui pourrait ruiner sa relation avec House.

Un père et sa fille passent du temps ensemble lorsque la fille insiste pour faire une attraction interdite par la mère. Le père cède, mais mal lui en prend, car il retrouve sa fille inanimée et saignant du nez.

Peter Treiber, le légiste de l'hôpital s'ouvre lui-même le crâne avec son scalpel lors d'une autopsie. Treiber ne veut avoir à faire qu'à House et l'équipe prend le cas en charge.

House est réveillé par Wilson à 6h30 du matin qui lui annonce qu'il ne veut plus continuer la chimiothérapie. House refuse car cela pourrait réduire les chances de survie de son ami. Maintenant que Chase est parti, Taub, Park et Adams prennent en charge un pom-pom boy de 19 ans, Derrick, qui saigne du nez, souffre de vertiges et croit entendre des voix.

House se réveille dans un building abandonné. Il aperçoit un corps mort qu'il identifie comme étant son dernier patient. Il hallucine en voyant Kutner qui est pourtant mort lui aussi. Cependant, Kutner l'informe qu'il y a un incendie dans l'immeuble.