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Le Capitaine Hunt se retrouve propulsé dans un système de neuf planètes nommé Seefra, jusqu'alors inconnu des galaxies membres de la République. Il y retrouve Rhade qui a lui aussi, échoué sur une de ces planètes pauvres et arides et qui vit de petits larcins. Les deux hommes réussissent à s'en échapper.

Beka, dérivant dans son vaisseau le Maru, a épuisé toutes ses réserves. Elle décide d'envoyer un dernier message de détresse. Dylan et Rhade parviennent à recevoir ce message et se mettent à la recherche de Béka qu'ils croyaient morte. Entre temps, le Maur tombe aux mains d'un grand patron du transport spatial, qui propose à Béka de trahir son capitaine et de s'associer avec lui.

Beka, Rhaïdé et Dylan sont témoins d'un vol aux méthodes curieuse dans un bar de Seefra 1 : Tous les clients paniquent sans raison, et finissent par s'évanouir. A leur réveil, un précieux tableau a disparu. Le patron du bar se propose d'offrir une prime à qui lui ramènera son bien. Le trio mène l'enquête sur Seefra 7, où il finit par retrouver Harper. Il s'est associé à une certaine Marika, une généticienne qui pratique de terrifiantes expériences.

Doyle s'inquiète de faire toujours le même cauchemar tournant autour de l'Androméda et de Dylan. Alors qu'elle est troublée par ces rêves récurrents et inexplicables, elle rencontre un homme étrange qui dit venir du futur et lui révèle qu'elle est une androïde. De son côté, Dylan a remis en fonctionnement l'IA de l'Andromeda qui lui signale un portail d'hyperpropulsion dans le secteur. Il demande à Beka de le remorquer avec le Maru en espérant profiter de ce portail pour s'échapper du système de Seefra.

Beka a décidé d'aider Dylan Hunt à réparer son vaisseau l'Andromeda ascendant, en transportant de la matière première sur le Maru. Pendant le transport, Beka et Dylan interceptent un étrange message...Celui de Virgil, qui annonce que Beka est l'élu pour percer ce secret du système Seefra. Dylan et son équipe acceptent d'aider Beka et tous partent à la recherche de Virgil et de son secret.

Dylan et son équipage, maintenant basés au Seefra, sont amenés a rencontrer une dénommée Céline, ancienne ingénieur Vedran coincé dans un continuum espace temps. Il s'avère qu'elle détient la solution pour sortir du système planétaire où l'Andromeda est mystérieusement bloqué depuis très longtemps. Le savoir de Céline combiné aux données de la plaque de Méthus vont permettre à Dylan de localiser l'entrée de la voie de la Rédemption.

Alors que sur Seefra l'ambiance est exécrable et que des bandes rivales s'affrontent, Flavine débarque avec fracas sur un vieux vaisseau qui a des problèmes d'atterrissage. Il convie Dylan à un voyage initiatique dans le passé et lui fait des révélations importantes sur ses origines et les circonstances qui l'ont amenés sur Seefra. Son discours est assez énigmatique mais il lui prend à mieux tenir compte du présent, comment le vivre et comment le gérer.

Dylan et son équipe apprennent qu'il y a des mines de cristal sur Seefa 8, une des planètes du système de Seefra. L'énergie qu'ils pourraient adapter à " l'Androméda " et leur permettre de quitter enfin cet endroit où ils se sentent coincés. Le propriétaire des mines est un homme dur qui exploite ses ouvriers. On s'aperçoit que le cristal a des effets néfastes sur les hommes et leur cause des lésions assez graves. Dylan change le but de sa mission : il ne s'agit plus de récupérer le précieux cristal, mais de sauver ces gens et de leur faire quitter ce système d'esclavage.

L'équipage de l'Androméda ne va pas bien. Béka Harper et Rhade se plaignent de leur sort et désignent Trance comme responsable de la situation. Trance se sent rejetée et décide de se retirer dans les tunnels de Seefra-un. Elle y fait la rencontre d'un personnage étrange qui prétend être le gardien du secret des Vedrans.

Prieus, un personnage étrange, joue aux cartes avec Dylan et la " plume ". Il appâte tous les gens de l'équipe avec des offres mirobolantes. Il meurt dans des circonstances mystérieuses. Une terrible tempête s'abat sur Seefra et un étranger aux allures bizarres débarque sur cette planète perdue. Il vient enquêter sur la mort de Prieus et plonge dans le passé plus ou moins douteux de certains membres de l'équipe. L'ambiance est délétère et cette épreuve apparaît comme un véritable test pour les compagnons de Dylan.

Seefra un est assiégée par les troupes d'Ormuz. Des millions de réfugiés se retrouvent sans médicament et sans nourriture. Dylan décide de venir en aide à ces populations en leur envoyant, par téléportation, du matériel de secours. Harper et Hohne, un ami, tente de fabriquer le téléporteur.

Beka est très amoureuse de Peter, un individu étrange rencontré sur Seefran I. Elle semble complètement obnubilée par lui et se désintéresse du reste de l'équipe. Mais l'individu est pervers et profite de la situation pour la couper définitivement de ses compagnons en la menaçant de la faire sauter avec le " Maru " si elle entre en communication avec eux. Au détour de tout cela, on apprend également que Beka est considérée, en quelque sorte, comme la mère de tous les Nietzschéens.

Trance est toujours à la recherché de ses origines. Elle part sur Seefra 2 ou elle rencontre un homme se faisant passer pour le Dieu du soleil. Trance s'aperçoit qu'elle a beaucoup en commun avec cet homme et ensemble, ils se mettent peu à retrouver la mémoire. Trance décide d'abandonner Dylan et l'équipage de l'Andromeda pour se retrouver spirituellement sur Seefra 2.

Le soleil Vedran se rapproche du système Seefra. Trance voit sa température augmenter dangereusement. Le seul moyen de rétablir son équilibre serait de la mettre en contact avec un échantillon de plasma solaire et Dylan charge Beka et Rhaïdé d'en collecter. Mais l'état de Trance se dégrade extrêmement vite. Elle sombre dans l'inconscience et se retrouve en contact avec un des autres avatars de son soleil qui la somme de venir d'abandonner Dylan et s'unir à eux.

Pour ralentir la course d'un soleil qui risque de dévaster tout le système de Seefra, Harper met sur pied une opération délicate. Il s'agit de placer un réflecteur gigantesque à proximité de l'entrée d'un trou noir. Beka se charge de la mission, mais elle court un très grand danger. Pendant ce temps, une étrange créature se glisse à l'intérieur de l'Androméda ; elle prétend avoir été la femme de Dylan durant les longues années où il était resté en exil dans un trou noir. Dylan est troublé, mais il ne se souvient plus de rien...

Dylan et son équipe vont tenter de pénétrer dans un soleil pendant les trios heures d'extraction programmée de celui-ci. Le but est de le remettre en état et d'en profiter pour récupérer par la même occasion un combustible pour Androméda.

Happé dans un cauchemar qui se transforme en vies successives ; Dylan doit absolument se réveiller afin de réparer le générateur de l'hyper-propulsion sur le point d'exploser et menaçant la population de la planète Seefra 1 qui attend les immigrants évacués de Seefra 9.

L'Androméda dispose de nouveau de l'hyper-propulsion. Mais son I.A. refuse de l'utiliser par mesure de sécurité. Pour outrepasser son verrouillage, Dylan a besoin de Rommie. Il charge Doyle de la remettre en état et il se retrouve face à une androïde paranoïaque qui veut contrôler seule le vaisseau et éliminer tous ceux qu'elle soupçonne de l'avoir trahie.

Tandis que Rhaidé tente désespérément de faire évacuer une planète destinée être engloutie par le soleil, et dont il doit en convaincre le chef, Burma et ses disciples, qui refusent de croire en leur fin programmée, à bord de l'Androméda Rommie découvre que Trance a une double personnalité.

Après s'être aperçu que la Trance qui est à bord de l'Andromeda n'est pas la vraie, Dylan et Rhaide retournent sur Methus deux pour récupérer leur vraie amie avant que cette planète ne disparaisse. Pendant ce temps Burma réussit à monter à bord de l'Androméda pour faire sauter ce vaisseau.

Trance se souvient qu'elle appartenait à la Nébuleuse des Lambent Kith, une congrégation de soleils, avant de s'enfuir pour veiller sur Dylan. Cette congrégation compte détruire l'Abysse en entraînant avec lui tous les Mondes Connus. Dylan convainc Maura, la représentante du conseil, de lui laissant une chance de sauver les trois Galaxies en lui permettant d'emprunter la Voie de l'Eternité.

Après la destruction de la Terre, Dylan découvre que l'Abysse s'est allié aux Nietzschéens quand leur flotte vient affronter l'Androméda. D'abord surpris d'avoir été si vite localisé, il comprend peu à peu que Maura les a renseignés car elle n'est pas ce qu'elle prétend être. Elle a entraîné l'Androméda dans un piège car elle est l'avatar de l'Abysse.