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Dans le plus grand secret, Abby est emmenée dans un bio-dôme. Avec acharnement, la scientifique Fiona Douglas tente de comprendre comment Abby a pu survivre alors qu'elle avait contracté le virus. Withaker a de plus en plus de mal à cacher qu'il ment au sujet de sa femme et son fils. Pendant ce temps, Anya et Al rencontrent de sérieuses difficultés dans un hôpital à l'abandon. Greg va-t-il pouvoir être soigné à temps ? Un début de saison qui donne de l'ampleur à la dimension sociale de cette série.

Bien qu'exclu du groupe à cause des terribles accusations de Greg, Tom décide de revenir vers ses compagnons d'infortune avec des vivres en gage de sa bonne foi. Il annonce alors qu'il a vu récemment d'autres survivants qui sont, eux, parfaitement armés. Pendant ce temps, Abby et Whitaker subissent une ré-injection du virus afin que l'équipe scientifique de Fiona puisse comprendre quels sont leurs mécanismes de défense immunitaire.

Lorsque le véhicule du groupe tombe en panne, un marchand ambulant du nom de Billy apporte son concours aux malheureux, avant de les rouler dans la farine. L'escroc révèle en effet la position du groupe à Samantha, qui s'arrange pour faire capturer Tom. Elle le fait accuser du meurtre de Gavin, un membre de sa communauté. Samantha promet à Tom de le libérer à la seule condition qu'il élimine Dexter. N'ayant pas d'autre choix, Tom s'exécute, mais Samantha le trahit.

La famille se lance à la recherche de Billy, le traître qui a livré Tom à Samantha. Prisonniers dans les mines de charbon de monsieur Smithson, Tom et Greg tentent de trouver une astuce pour s'échapper par leurs propres moyens. Greg, qui se fait passer pour un géologue, parvient à convaincre Smithson de l'existence d'une fuite de gaz. Une seconde saison qui donne de l'ampleur à la dimension sociale de la série.

Greg pense savoir où sa femme peut se trouver et se rend sur un aérodrome utilisé pour évacuer les survivants. Monsieur Stevens, qui a raté un avion, devient complètement fou. Le reste du groupe rencontre quelques survivants qui se sont organisés pour mener une vie la plus agréable possible. Malheureusement, le virus mute et une famille est contaminée. Les survivants font tout pour contenir l'épidémie, propagée par les oiseaux selon Tim.

Fiona est la seule survivante du laboratoire et elle essaie de trouver un remède. Elle est pense être sur le point de mettre au point un sérum efficace, qu'elle teste sur Al. Whitaker a emmené Peter pour le cacher dans une caravane. Il lui dit de tirer sur quiconque tenterait d'approcher. Abby demande à Fiona où se trouve Peter. Celle-ci lui répond qu'elle l'a vu au laboratoire avec Whitaker.