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Nous sommes au QG du Gouvernement Intersidéral, à New York. Le Président fait appel au Capitaine Flam pour élucider un mystère sur la planète Dénef : la rétrogradation des Terriens en hommes préhistoriques.

Le Capitaine Flam et le Professeur Simon pensent que l'Empereur arrive à traverser la matière grâce à une "modification oscillatoire des atomes".

Flam et son équipe localisent sur une carte l'usine de Belwar et Cunnig, qui se trouve non loin d'une ancienne cité. Flam défend à Johann de les accompagner à l'usine et la dépose à la base. Le lendemain matin, celle-ci lui désobéit et part seule à l'usine ! Le professeur, après examen de l'homme-singe anesthésié, découvre la cause de la rétrogradation et recherche un remède avec Crag...

Flam et Crag se mettent sur la piste d'un suspect, le scientifique Kenneth Lester, et le retrouvent dans des ruines cachées de l'ancien Empire de Dénef. L'empereur de l'Espace surgit à nouveau et les retient tous les trois prisonniers. Puis, il ordonne au chef du Gouvernement Intersidéral de lui laisser le pouvoir…

Le Capitaine Flam et son équipe procèdent à des essais de navigation avec le Cyberlabe. Soudain, ils captent un message de détresse du fantôme d'un savant, Darmor, qui apparaît dans leur vaisseau. Celui-ci leur demande de venir sauver sa planète, Katan, qui est à la fois menacée par une destruction prochaine (due à l'attraction de Jupiter) et par une guerre. L'équipe doit donc remonter dans le temps pour lui venir en aide.

La jeune Terrienne conduit Flam et son équipe au village de son peuple. Ils découvrent les vestiges d'une fusée, objet de culte pour ce peuple qui leur apprend qu'elle vient de la planète Koom. Nos héros découvrent qu'il s'agit en fait de la planète qu'ils connaissent sous le nom de Dénef ! Ils en déduisent que des hommes venus de Dénef ont construit là une base qui a été détruite il y a très longtemps et que ce peuple primitif en sont les descendants.

Sur Katan, l'équipe du Cyberlabe retrouve le savant Darmor. Celui-ci leur explique qu'il souhaite emmener son peuple sur la planète Koom à bord de la lune de Katan, aménagée en vaisseau spatial. Son compatriote, le général Jakal, préfère quant à lui la manière forte en conduisant son peuple vers une guerre de conquête contre Mars.

L'équipe reprend connaissance et se rend compte que le Cyberlabe ne dispose plus que d'une faible quantité d'énergie. Heureusement, le détecteur de Tachyionium que leur a prêté Darmor contient suffisamment de Tachyonium pour leur permettre de remonter 100 millions d'années en avant, jusqu'à la naissance des premières planètes. Cela afin de retrouver du Tachyonium. Ils assistent donc en accéléré à la formation des planètes et se retrouvent sur Katan, qui est à cette époque une énorme boule de magma en fusion !

Le gravium est un métal indispensable pour réguler la gravité. Il n'y a que cinq mines de gravium bien connues dans l'espace. Un homme nommé Wrackar menace le gouvernement du système solaire avec la destruction de toutes les mines de Gravium si on ne lui donne pas le pouvoir du gouvernement. Comme le président ne cède pas au chantage, il commence à détruire les mines une à une…

Après la destruction de quatre des cinq mines connues de Gravium, seules les mines sous-marines de la planète Baim restent. Mais cela provoque aussi une vague de destruction. Selon une mystérieuse légende, le diable marin en serait responsable. Alors que le Capitaine Flam enquête sur l'une des mines, celle-ci s'effondre et devient un piège potentiellement mortel.

En capturant Ki Iris, l'un de ses partisans, Captain Flam découvre un indice sur Wrackar : une terrible technique appelée transplantation mentale. La question se pose quant à la véritable identité du diable marin. À la recherche de réponses, le Capitaine Flam infiltre la base secrète de Wrackar déguisé en Ki Iri.

Wrackar prévoit une destruction totale : il veut couler les masses terrestres de la planète Baim à l'aide d'une énorme bombe sous-marine. Captain Flam découvre qu'une ancienne race secrète de créatures sous-marines vit au fond de l'océan, qui semble être liée à Wrackar. Il fournit des adeptes à l'organisation de Wrackar à l'aide de greffes d'esprit sur les corps de pêcheurs kidnappés.

La planète Laguna, très petite, voit s'épuiser ses ressources en oxygène et en eau. Les autorités font évacuer les habitants. Le Capitaine Flam leur promet de trouver un moyen de rétablir artificiellement l'oxygène et l'eau sur Laguna. Il décide avec son équipe de partir à la recherche du Créateur Universel, qui se trouverait dans la constellation du Sagittaire.

Les nouveaux compagnons du Capitaine Flam informent l'équipe qu'un terrible gardien protège le Créateur Universel. L'équipe doit maintenant trouver du télévium, un métal rare, pour réparer le Cyberlabe. Ils se posent sur une petite planète voisine, la Planète de Glace. Flam découvre dans les souterrains un peuple en état d'hibernation. Ceux-ci se réveillent à son arrivée. Ils confondent le Capitaine Flam avec l'un des messagers des "mille hommes", des savants qui étaient censés redonner de l'énergie solaire à leur planète...

Le professeur Simon apprend que la jeune prisonnière est la princesse Syria, de la planète Surune, retenue en otage par le roi Lulstan. Pendant ce temps, le roi demande à Flam de lui construire un canon à protons et de s'allier à lui pour combattre le peuple de Surune. Mais le Capitaine Flam et son équipe ne font pas confiance à Lulstan, qui ne cherche qu'à satisfaire son ambition personnelle. Ils élaborent un plan d'évasion avec le professeur Simon et décident aussi de délivrer la princesse Syria pour la ramener sur Surune, le camp ennemi de Lulstan...

La guerre est déclenchée par Lulstan contre Korok. Dans la bataille, l'appareil de Korok est touché par l'un des vaisseaux de Lulstan. Korok est blessé. Sa fille le ramène au palais, tandis que Flam prend le commandement des vaisseaux de Korok. Ils parviennent à vaincre les forces de Lulstan. Mais cette bataille n'était qu'un leurre destiné à détourner l'attention et permettre à Lulstan de se rendre vers la cachette du Créateur Universel. Flam et ses amis foncent en direction de la cachette afin d'arrêter Lulstan…

C'est sur la planète Kerubérus que se trouve la prison intersidérale, où sont gardés les criminels les plus dangereux de l'univers. L'un d'eux, Kahlon, doté d'une intelligence supérieure et malfaisante, a élaboré un plan d'évasion très au point avec la complicité extérieure de sa très intime "secrétaire" Saturna…

Sur la planète Ariel, Flam et son équipe explorent le laboratoire de Shal Ker et découvrent les preuves de l'existence d'un vaisseau capable de traverser les deux mondes, probablement volé par Saturna. Mala découvre également un journal mentionnant un trésor qui se trouverait dans l'univers parallèle…

Flam est rapidement démasqué par Kalhon pendant leur voyage dans l'autre dimension. Le capitaine réussit à s'enfermer dans le sas du vaisseau et s'en échappe grâce à un propulseur. Il est abandonné par Kahlon sur une planète de glace soumise à la fonte ultrarapide de ses glaciers…

Le Cyberlabe parvient à atterrir tant bien que mal sur la planète invisible. L'équipe part ainsi explorer les lieux pendant que Crag et le professeur Simon gardent le Cyberlabe. Mais ils sont rapidement capturés par les forces de police de la planète, qui les jettent en prison…

Un soir, au Musée Solaire, Ken Lester, un archéologue, examine une pierre rapportée de la planète Alvéola. Soudain, Kahlon fait irruption, abat le savant et s'empare de la pierre ! Quelque temps après, le Capitaine Flam et son équipe assistent à une représentation du Cirque Galactique. Ils sont tous impressionnés par les numéros de l'Homme Caméléon et de Grandes-Oreilles, qui peut entendre le moindre chuchotement à des kilomètres ! Tout à coup, Flam reconnaît Kahlon, son ennemi juré. Ce dernier, sous leurs yeux, fait un numéro de magicien...

Pour contrer Kahlon, Flam et son équipe se font engager dans le Cirque Galactique : Flam en dompteur de morso-lions, Mala en "clown-acrobate", Crag en gladiateur super-costaud et le professeur Simon en robot qui a réponse à tout. Mais Kahlon commence à soupçonner nos amis, qui font un peu trop de zèle.

Après l'avoir hypnotisée avec sa montre, Flam interroge Saturna qui lui indique l'emplacement des quatre pierres que détient Kahlon. Flam et Johann partent en Cosmolem rejoindre Crag et Mala au cirque, pendant qu'Ezla est chargé de surveiller Saturna dans la capsule…

Le directeur découvre alors que Kahlon et Flam ont triché et les fait enfermer et attacher avec leurs fiancées respectives. Mais Kahlon conclut un marché avec le directeur, ce qui lui permet d'obtenir les deux dernières pierres. Kahlon rassemble les sept pierres devant Flam et Johann qui, écœurés, voient ensuite leur ennemi rétrécir progressivement au point de pouvoir pénétrer dans l'une des pierres précieuses et connaître enfin le secret des septs pierres…

Un étrange professeur du nom de Zaro monopolise les ondes du monde entier pour annoncer la présence d'une planète noire qui menace de détruire la Terre prochainement. En effet, cette planète se rapproche de plus en plus et tous les éminents astronomes ont mystérieusement disparu de la Terre…

Mala ramène au Cyberlabe un soldat de Zaro, une sorte d'homme-singe aux cheveux blancs. Quant à Flam et ses deux compagnons d'infortune, ils parviennent à monter à bord d'un gigantesque vaisseau extraterrestre. Ils y découvrent des créatures qui hibernent qui ne se nourrissent que de sang, mais dont les réserves sont presque épuisées, attendant leur proie comme une araignée dans sa toile…

Flam, Crag et le guide, toujours à bord de leur mini iceberg, débouchent sur un océan sur lequel ils se font attaquer par un morsicus. Ils rencontrent au même moment un chasseur de morsicus, le vieux Kira, qui leur explique que les hommes singes aux cheveux blancs sont en fait des Targans, des êtres pacifiques qui ont mystérieusement disparu de la planète. Ceux-ci ont le pouvoir de créer des mirages pour se protéger !

Le Cyberlabe se rend enfin sur la planète Siki où Flam espère trouver les Targans ainsi que Johann et Simon. Cette planète, bizarrement, semble composée à 100 % d'eau. Entre-temps, le professeur Kane confirme à Flam que la masse de la planète noire est dérisoire. Bref, tout semble bizarre tout d'un coup…

À l'Aéroport Interspatial de New York, le vaisseau Balcan s'apprête à partir pour la prison de Kelaburs. Son chargement : les criminels les plus dangereux de l'espace. Johann, qui s'est portée volontaire pour les escorter, tient tête au Capitaine quand celui-ci essaie de la faire renoncer à sa mission. En effet, Flam s'inquiète pour elle et du bon déroulement du voyage. Le chef des prisonniers, Kim Ivan, a un plan pour sortir des cellules du vaisseau…

Les évadés célèbrent leur victoire et s'enivrent. Kim Ivan, leur chef, fait venir Flam afin que celui-ci les aide à manœuvrer le vaisseau qu'ils ne maîtrisent pas bien. Flam se rend alors compte que le vaisseau est sur le point de percuter un planétoïde ! Le Capitaine Flam fait atterrir le vaisseau en catastrophe sur celui-ci, au bord d'un lac de magma !

Une suite d'évènements étranges se produit au campement : Rollinger, un des bandits, se met à entendre une voix qui lui demande de quitter la planète puis deux autres bandits disparaissent mystérieusement du campement pendant la nuit…

L'équipe est maintenant engagée dans une course contre la montre pour finir la construction du vaisseau, qu'ils baptisent le "Phoenix". Mais il leur manque encore quelques grammes de calcium pour pouvoir mettre en marche les cyclotrons. De plus, des montées de lave se rapprochent dangereusement du vaisseau…

La Société de Production Galactique a pour projet le tournage d'un film sur la vie du Capitaine Flam ! Le président du Gouvernement Intersidéral soupçonne le producteur du film John Valdine, un puissant entrepreneur sans scrupules, de vouloir se servir du film comme couverture afin de s'approprier une mine de diamants située sur la planète Bettons, un des lieux du tournage. Le président demande à Flam de surveiller les faits et gestes de Valdine. Flam et son équipe se font alors passer pour des sosies de leurs propres personnages et réussissent à se faire engager sur le plateau, pour jouer leur propre rôle…

La mer de flammes est entrée en éruption pendant le tournage. Flam et Crag aident l'équipe à s'enfuir. Pendant ce temps, le professeur Simon réussit à installer un micro dans le bureau de Valdine. Johann revient sur Mégara après avoir flairé le faux télégramme…

Le tournage se poursuit sur la planète Bettons, la planète des Stasians. On retrouve les fameux mirages et illusions que leurs habitants projettent aux visiteurs indésirables. Sur cette planète, Ezla a fait atterrir discrètement le Cyberlabe, selon les ordres de Flam. L'équipe de tournage se fait refouler par les Stasians, qui refusent qu'un film soit tourné sur Bettons. Valdine a un plan pour les faire céder : faire passer Carson pour le vrai Capitaine Flam et jouer les diplomates auprès des Stasians…

Les Stasians lancent leurs Cendres Sacrées sur Planète Cité, la ville des Terriens. Les cendres, une fois dispersées par le vent, provoquent une érosion instantanée des métaux. Toutes constructions, vaisseaux, armes est alors réduit en poussière. Heureusement, Crag et Simon ont réussi à faire décoller le Cyberlabe à temps. Prisonniers sur cette planète et fous de colère, Valdine et ses hommes s'en prennent au Capitaine Flam...

Un vaisseau disparaît mystérieusement dans l'espace. Il se trouve que c'est déjà le vingt-deuxième vaisseau qui se volatilise entre Jupiter et Uranus ! Puis c'est au tour du vaisseau de patrouille dans lequel se trouvent Johann et Ezla de disparaître !!! Le Gouvernement Intersidéral finit par faire appel au Capitaine Flam pour enquêter...

Flam est conduit au palais, auprès du roi Soryx. Au milieu des courtisans, il retrouve Johann, transformée en Cométienne ! Il court vers elle, pose sa main sur son épaule et reçoit aussitôt une décharge électrique. Il lui demande alors pourquoi elle est devenue Cométienne. Celle-ci lui répond devant la cour que la vie immortelle de Cométien est formidable !!! Curtis, choqué, déclare ne pas croire à une seule de ses paroles...

Flam et les autres assomment les gardes du roi et assistent médusés à la cérémonie, qui consiste à se prendre des décharges électriques sous un générateur. Ils se lancent soudain à l'attaque des Cométiens… Mais Qweldel s'échappe de la bataille et parvient à contacter les Luxoïdes. Ceux-ci neutralisent en quelques instants Flam et les rebelles par leur seule force télépathique…

Les Luxoïdes exigent de Flam qu'il leur révèle toutes ses connaissances scientifiques, sous peine d'être exécuté. Devant son refus, les Luxoïdes tentent de lui subtiliser ses connaissances par leur force télépathique. Excédés par sa résistance, ils lui annoncent qu'ils vont faire venir Johann et la torturer devant lui !!!

Un mystérieux bandit du nom d'Empereur de l'Immortalité fait distribuer aux quatre coins des mondes un élixir de jeunesse très coûteux, pour amasser un max de blé et devenir le maître de l'univers. Mais cet élixir est illégal car il contient des substances très toxiques. Son effet est de courte durée et oblige les utilisateurs à racheter le produit régulièrement sans quoi, ils vieillissent prématurément et meurent en quelques minutes...

Simon, qui n'est pas encore totalement paralysé, saisit le pistolet à protons de Flam, tire et détruit la statue du gardien de la source. L'équipe se rend compte que cette source n'est pas celle qu'ils recherchent...

Heureusement, un générateur atomique permet à Flam d'électrocuter les sales bêtes qui étaient sur le point de ne faire qu'une bouchée de l'équipe. Curtis, Crag et Simon doivent maintenant retrouver Mala et Johann qui ont été amenés auprès de l'Empereur...

Flam se rend dans la ville de Toboru. Dans un bar, il interroge un vieillard à propos de la Fontaine de Vie. Ce dernier lui indique qu'elle se trouve dans la Vallée des Brouillards d'où personne n'est encore jamais revenu et qu'elle est protégée par des gardiens ailés...

Le Cyberlabe part en mission pour Mars où Flam et ses compagnons doivent rencontrer le professeur Chiko Kren, un ami de Simon qui a inventé une machine qui permet de passer d'une dimension à une autre. C'est ainsi que deux jeunes gens Gweldek et sa sœur Kiara, débarquent de la planète Tarust située dans l'autre dimension. Dès qu'ils aperçoivent le Capitaine Flam, ils ont un choc : Curtis présente une extraordinaire ressemblance avec Kafoul, un héros censé sauver Tarust, selon la légende...

Crag se retrouve emmené par les semeurs de givre vers la "planète des neiges éternelles". Ils peuvent vivre sans oxygène, ont la faculté de communiquer par télépathie et de lire dans les pensées. Une fois arrivés sur leur base, ils découvrent que le robot a un cerveau et un potentiel émotionnel fort développé ! Crag s'aperçoit qu'un Tarustien, Vrastok, espionne pour le compte des semeurs de givre...

Nos héros sont emmenés dans la salle d'exécution du châtiment de l'âme abjecte. Ce châtiment consiste à séparer l'âme du corps, grâce à une machine qui ressemble à un cercueil ! Johann est la première à subir le châtiment sous le regard atterré de Curtis, qui lui jure qu'il la sauvera bientôt…

Flam et son équipe se rendent au laboratoire du savant fou qui a inventé les semeurs de givre et cherchent le document qui révèle le point faible. Là, ils s'aperçoivent que l'ouvrage a déjà été emporté. Ils soupçonnent le roi Moor de les avoir devancé…

Flam et son équipe ont entrepris une expédition archéologique sur Titania, l'un des satellites d'Uranus qui comprend de magnifiques vestiges de la civilisation d'Aar qui avait colonisé il y a très longtemps de nombreuses planètes. L'expédition comprend aussi le professeur Winter et Cole Norton, chargé de la sécurité sur leur campement. Flam déchiffre des signes gravés sur un monolithe qu'ils ont découvert. Celui-ci révèle que cette civilisation avait créé autrefois une évolution artificielle des espèces, afin de s'adapter aux planètes qu'ils colonisaient. Le secret de cette évolution est caché dans un lieu appelé la Caverne de Vie…

Flam et ses amis décident de consolider leur vaisseau de l'extérieur, malgré les météorites qui volent autour d'eux. Winter, Norton et leurs prisonniers sont eux, tranquillement arrivés sur Aar mais se font encercler par des barbares à l'air patibulaire : les Humanoïdes. Norton se met à négocier avec eux. Beaucoup plus tard, Flam et son équipe atterrissent à leur tour sur Aar. Ils se font pas attaquer par un homme-tigre...

Grâce à son nouvel ami hybride, Sikin, un homme-condor, Flam apprend où Johann et Ken sont retenus prisonniers par Norton et les Humanoïdes. Ensemble, ils réussissent à libérer Johann et Ken. L'homme-condor emmène Ken à l'abri, mais dans leur fuite, Flam et Johann se font rattraper par leurs ennemis...

Flam et ses compagnons débarquent sur les bords de la Mer Noire et aperçoivent au loin la Montagne de Cristal qui scintille. La Caverne de Vie se trouve là-bas. Nos amis construisent un radeau pour traverser la Mer Noire qui les sépare de la montagne. Pendant la traversée, ils se font attaquer par une sorte de dragon marin qui renverse leur radeau...