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Alors qu'il regarde sa série préférée « Mon ami Kumbo » avec Isidore et Iris, le Marsu se fige lorsqu'à la fin de l'épisode, Kumbo le gorille protecteur des animaux est capturé par un braconnier et finit ses jours dans un cirque. Le Marsu est inconsolable et commence sérieusement à déprimer.

Les Vanderstad sont en proie à la nouvelle Marotte d'Isidore : la magie. Ce dernier s'est mis en tête de devenir le prochain David Copperfield et utilise les Marsupilamis comme assistants pour répéter inlassablement les mêmes tours à ses sœurs, au grand dam de Sarah. C'est alors que débarque Bring M. Backalive.

Iris et Isidore rapportent à Bernard un couple de piranhas à damier menacés de disparition. Investi de LA mission suprême, Bernard se met en tête de sauver l'espèce ! Alors qu'il se dépense sans compter pour ses piranhas, ses enfants, se sentant abandonnés, vont trouver refuge chez les Marsus !

L'un des trois petits Marsupilamis, Bobo, se met en tête d'apprendre à voler dans le ciel. Évidemment, ses tentatives sont autant d'échecs et les retours sur terre sont de plus en plus en durs. Bobo a beau prendre des cours de vol avec ses amis les oiseaux, rien n'y fait. Heureusement, Iris décide de l'aider et lui construit un cerf-volant.

Les trois petits Marsupilamis découvrent un œuf et décident de le déposer dans un nid d'oiseaux. Mais les oiseaux ne veulent pas de cet œuf ! Ils le jettent par dessus bord et voilà l'œuf qui perce le toit du nid des Marsupilamis.

Le Marsupilami a avalé par mégarde la toute petite antenne satellite de la famille Vanderstad. Dès qu'il éternue, il fait zapper la télévision ou interfère avec l'Internet. Quelqu'un téléphone ? Le Marsupilami se met à danser la gigue au rythme de la sonnerie ! Le petit animal est vite épuisé par ces interférences... Pire : il se met à attirer les moustiques.

Mamie Rose et son fidèle chat Gri-Gri arrivent en Palombie. En moins de deux, les Marsus sont éjectés de la maison : fini les jeux avec Isidore et les fruits en rab au dessert ! Quand Gri-Gri disparaît, il n'y a qu'un seul responsable pour Mamie : ce gros « chien » de Marsu !

Sarah est dans tous ses états : son peintre préféré, Augusto Warul, a lancé un grand concours sur Internet pour dégoter la future star du pinceau. La jeune fille peint jour et nuit mais ne tarde pas à attirer la curiosité du Marsu qui va se mettre à barbouiller des toiles à sa manière.

Isidore et le Marsu surprennent une espionne en train de voler un drone expérimental échoué dans la jungle. Le garçon prend l'appareil pour un OVNI, et la femme pour un extraterrestre qui a pris forme humaine. Isidore essaie donc maintenant de convaincre sa famille que « l'Envahisseuse » a débarqué, empêchant par la même cette dernière de récupérer l'appareil High-tech...

C'est bientôt l'anniversaire de Bernard et les enfants lui cherchent un cadeau sur Internet. En faisant leurs recherches, ils découvrent que leur père faisait partie d'un groupe musical quand il était jeune. Les enfants ont trouvé le cadeau idéal : ils vont reformer «Les Marie-Fraises ! ».

Sarah est aux anges ! Son père vient de lui ramener un colis dans lequel il y a ses céréales et ses biscuits préférés. Malheureusement, ses précieuses gourmandises disparaissent dans la nuit... Ses soupçons se dirigent vers le Marsu qui, il faut bien l'avouer, se comporte étrangement depuis quelque temps. En effet il effectue de curieuses escapades dans la jungle...

Pour ne pas céder aux sirènes de la consommation, Bernard propose une nouvelle façon de fêter Noël à ses enfants. Chacun devra trouver un cadeau « naturel » pour celui ou celle qu'il aura tiré au sort. La quête des enfants Vanderstad intrigue leurs amis Marsupilamis, qui vont les assister... ou plutôt leur mettre involontairement des bâtons dans les roues...

Iris se souvient de l'arrivée de la famille Vanderstad en Palombie. Alors que son père s'attelle à la construction de leur maison, la petite fille cherche des preuves de l'existence des Marsupilamis. Ces derniers, méfiants, observent la famille de loin... Ils font surtout tout pour faire cesser les bruits des travaux.

Isidore a commandé une « poudre magique » sur Internet censée le métamorphoser en super héros. Une fois le colis reçu, il se prépare à boire la potion, mais il se fait devancer, et celle-ci se retrouve tout droit dans le ventre de Sarah, et de Marsu ! Leur ventre se met à gonfler, gonfler... Et ils sont pris de flatulences aussi gênantes qu'imprévisibles !

Caroline a débarqué en Palombie ! Les Vanderstad et les Marsupilamis se préparent à aller l'accueillir à l'aérodrome. Mais, pendant le trajet, Backalive kidnappe les bébés Marsus ! Une poursuite s'engage, grâce à l'aide de Tutprenpourfangio, un Indien qui conduit comme un fou...

Les Vanderstad et les Marsus ont réussi à rattraper Backalive, mais celui-ci n'a plus les bébés Marsus. Hypnotisé par Tavumonplumo, le braconnier finit par avouer qu'il a livré les petits animaux à Jean-Pierre Pierre, un milliardaire qui a besoin d'eux pour trouver un fabuleux trésor. Nos héros font route vers sa villa, dans l'espoir de récupérer les bébés.

Jean-Pierre Pierre et Barney se sont enfuis avec les bébés Marsupilamis. Heureusement, ils ont perdu la carte du trésor de Patalaxostomatl, ce qui permet aux Vanderstad de connaître leur destination : une très ancienne pyramide précolombienne...

Bernard s'est absenté pour la journée, et a laissé les enfants au campement sous la surveillance de Sarah. Quand tout à coup, Bébé Zoé se met à baver partout : mais qu'est qu'il lui arrive ? Il faut l'avis de Bernard ! Mais pour le retrouver au campement indien : il faut traverser la jungle !

Barbara, aussi charmante que mystérieuse, est depuis peu la nouvelle voisine de la famille Vanderstad. Tout est prétexte pour venir faire le siège du cabinet vétérinaire de Bernard. Les enfants et les Marsus se sentent à l'écart. Iris et Sarah se demandent même sérieusement si cette encombrante jeune femme n'a pas l'idée folle de remplacer leur maman dans le cœur du vétérinaire!

Bernard est au téléphone avec Caroline. Cette dernière est surexcitée : elle vient de recevoir les résultats exceptionnels d'un test de Q.I. pratiqué par l'école sur Isidore avant son départ en Palombie. Bernard n'en revient pas : notre fils est un génie ! A partir de là, toutes les élucubrations d'Isidore prennent un sens nouveau : et si il avait raison ?

Les enfants Vanderstad font face à une nouvelle liste de corvées toujours plus longue, et cette fois-ci, ils ne se laissent pas faire et s'insurgent contre l'amoncellement des tâches. Ils ne sont que des enfants et ils n'ont pas demandé à fuir la civilisation comme leurs parents !

Dans la jungle, Iris et le Marsupilami recueillent un adorable petit coati malade. Inquiets, ils l'emmènent chez le père d'Iris : le vétérinaire les rassure, le coati ne souffre que d'une indigestion. Dès le lendemain, ce gros gourmand de coati prend ses aises chez les Marsupilamis et chez les Vanderstad.

Le Marsupilami apprend de nouveaux tours à ses petits : en équilibre sur sa queue, il tourne sur lui-même comme une toupie et s'enfonce sous terre. Épatés, ses petits l'imitent et s'amusent à faire des trous tout autour de la maison des Vanderstad.

Un matin, le Marsu assaille chaque membre de la famille Vanderstad en effectuant de drôles de gestes paniqués. Mais les humains, très occupés, le repoussent gentiment, pensant qu'il veut jouer avec eux. Plus tard, découvrant le nid abandonné, les Vanderstad réalisent qu'ils ont du vexer le Marsu et qu'il a déménagé avec toute sa famille !

Les Vanderstad sont invités par Tavumonplumo à participer à la Cérémonie du Totem. Le sorcier indien révèle à chacun d'entre eux son animal totem, animal auquel il sera désormais lié. Et l'animal totem de Sarah n'est autre que... le Marsu ! Mais depuis quelque temps, la jeune fille, en bonne ado qui se respecte, ne supporte plus le comportement du Marsu.

Au fond de la jungle, les oiseaux rares et les petits singes finissent dans de sinistres cages que d'affreuses mains poilues referment. Le sinistre braconnier Bring M. Backalive est de retour mais termine son odieux trafic en écrasant son avion dans la jungle Palombienne.