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L'excès de confiance fait en sorte que l'Équipe Bee est non préparé quand ils font face à un Stunticon qui leur tire des missiles téléguidés dans un désert au-dessus d'un site d'élimination de déchets nucléaires.

Le Stunticon est plus dangereux et astucieux que l'équipe Bee aurait pensé, utilisant ses missiles téléguidés menacer un site d'élimination des déchets nucléaires.

Grimlock demande à Drift, qui est réticent, d'apprendre de nouvelles techniques de combats et les met en action quand les Autobots se rendent rapidement en Antarctique pour combattre le Decepticon Prong, un monstre tout juste dégelé d'un glacier dans lequel il était prisonnier.

Après que ses actions irréfléchies est causé l'évasion d'un Sharkticon dangereux, Sideswipe se donne du mal pour recapturer le Décepticon et prouver sa valeur à l'équipe, craignant d'être remplacée par un plus jeune et plus rapide, le nouveau venu, Rescue Bot Blurr.

L'Équipe Bee découvre un mystérieux artefact qui a un effet étrange sur le cerveau des Transformers, rendant les TF l'un contre l'autre. Donc l'Équipe Bee doit garder éloigné Springload le chasseur de trésor hanté de détruire accidentellement la ville Crown City.

Bumblebee, essayant de prouver qu'il peut être aussi cool queS ideswipe et son stagiaire Blurr, lutte pour mener les Autobots contre deux Stunticons qui ont volé une caravane pleine d'armes Cybertronien.

Après s'être combinés en fusionneur d'Équipe Ultra Bee, les Autobots constatent que Sideswipe s'est divisé en deux individus. Maintenant, les deux Sideswipe doivent surmonter leurs différences et apprendre à marcher ensemble alors que l'Équipe Bee poursuit le Stunticon Drag Strip.

Strongarm utilise ses talents de policiers pour résoudre une série de vols par les Décepticons; elle pourait devoir prendre les devant à ses coéquipiers pour traduire ce voleur en justice.

L'Équipe Bee apprend sur le passé de Drift quand son ancien mentor "Shadow Raker" arrivent sur Terre pour récupérer quelque chose que Drift lui a pris: Slipstream et Jetstorm.

Une expérience pendant leur union cause accidentellement une échange des personnalités entre les Autobots. Coincé dans des mauvais corps, l'équipe doit agir dans une mission pour contrer les Stunticons dans une course automobile.

Strongarm s'inquiète que ses collègues de classe académique aient une toujours une rancune contre elle, mais quand un adversaire puissant se dirige vers un de ses vieils ami, Strongarm et l'Équipe Bee font tout pour la protéger.

Un ancien signal cybertronien envoie Bumblebee et la cavalerie en simple mission de reconnaissance sur une île anglaise éloignée. Mais la mission tourne rapidement en une aventure pour notre duo...

Grimlock acquiert une vitesse incontrôlable, ce qui s'avère un problème lorsque les Autobots doivent faire face à une revanche de Simocore et son armée de clones MiniCons...

L'équipe de Bee se lance dans une course afin d'empêcher les Stunticons de dérober un moteur de train en fusion, et de l'empêcher ensuite d'entrer en collision avec la gare de Crown City...

En pensant que les autobots ont besoin de perfectionner leur jeu, Bee insiste pour que ses instructions soient appliquées à la lettre. Mais cette nouvelle façon de manager est mise à l'épreuve lorsque Motormaster et les Stunticons suivent un plateau de déflecteur de météorites. L'équipe de Bee se retrouve à devoir improviser ensemble...

Optimus Prime recrute Drift pour une mission spéciale, suscitant une concurrence entre Sidewipe et Strongarm qui se disputent la légitimité de la place de Drift. Pendant ce temps, les Autobots s'aventurent vers la lune pour récupérer une arme dangereuse avant Motormaster et les Stunticons...

Steeljaw et sa meute reviennent et lancent une attaque contre Scrapyard, forçant les Autobots à abandonner leur base. Par conséquent, la peur de l'abandon de Sideswipe menace l'équipe de Bee lorsqu'elle fait de nouveau face à ses ennemis au barrage de Crown River...

L'étroitesse des cavernes oblige tout le monde à se mettre au bord. Bee part donc en mission se faire capturer par les Decepticons de Steeljaw, qui capturent également Sideswipe et Strongarm. Fixit fait de son mieux pour garder les Decepticons et Seeljaw à distance dans le passage souterrain alors que tous les Autobots capturés commencent à se libérer et battre les Decepticons...

L'équipe de Bee rencontre des difficultés pour récupérer une boîte de produits radioactifs appartenant à Steeljaw et son équipe. Grimlock lutte pour apprendre à différencier travail et jeu...

Strongarm aide l'équipe de Bee à empêcher Steeljaw et sa meute de faire des ravages à la centrale nucléaire...

Soundwave s'échappe finalement de la zone fantôme et installe un générateur balistique avec l'intention de convoquer Mégatron! Tandis que l'équipe de Bumblebee le confronte sur un gratte-ciel, Optimus Prime confronte Laserbeak dans les cieux sur de la ville de Crown Cité, Sideswipe tire une leçon des conséquences de ses actions.

Quand Underbite mange une partie du Pont terrestre, l'équipe de Bumblebee doivent poursuivre Underbite vers un désert, une forêt et même l'espace!

Après que Wingcode infecte d'un virus les Autobots, Bulkhead se joint à Grimlock à la chasse contre le Décepticon.

La poursuite de Steeljaw par les Autobots amène une surprise inattendu quand le Détective Dropforge, ancien mentor de Strongarm, arrivent de Cybertron avec l'ordre d'arrêter l'équipe de Bumblebee.

Optimus revient avec de vieux amis et de terribles avertissements concernant une invasion Cybertronienne de la Terre, et les Autobots doivent défendre leur ancienne et nouvelle maison. Steeljaw offre de l'aide, mais peut-on lui faire confiance...

La bataille finale commence: l'équipe de Bee lutte pour libérer Cybertron et celle d'Optimus retient une invasion Cybertronienne de la Terre.