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Quand la classe est invitée à participer au jeu télévisé préféré de Thomas, le bus ramène le petit groupe au temps de la préhistoire à la découverte des fossiles.

Des griffures sur les murs aux pepperonis manquants sur la pizza, la classe de science est un vrai bazar, et tout semble accuser Martine la Pie, l'oiseau de Véronique.

Véronique a été tellement occupée par la préparation de la fête d'automne qu'elle en a oublié la nourriture ! Son seul espoir repose sur une ferme apparemment hantée.

Mademoiselle Bille-en-Tête et sa classe s'aventurent sur Internet pour retrouver un Arnaud numérisé avant que la grand-mère de Jyoti ne le supprime pour toujours.

Quand Arnaud perd malencontreusement Ratasha, le rat de Carlos, et le rend invisible, les élèves doivent apprendre à voir le monde à travers les yeux d'animaux.

Jyoti et ses camarades apprennent à faire face aux déconvenues en tentant de fabriquer une astromobile capable d'explorer une planète lointaine.

Une course entre Carlos et Mikey entraîne les deux frères et leurs amis au sommet d'une montagne de pâtes où le petit groupe en apprend davantage sur les mécanismes.

En partant à la recherche de la pluie pour tester l'Auto-parapluie, la dernière invention de Jyoti, les élèves se retrouvent pris au piège dans une tempête.

Les mathématiques aident Raphaël à réaliser des calculs complexes en plein vol lorsque ses cousins le recrutent pour leur numéro de cirque aérien.

Raphaël refuse de croire Thomas qui prétend que les arbres peuvent communiquer. Mademoiselle Bille-en-Tête décide alors d'emmener la classe dans la forêt.

Tout le monde fait caca, même les animaux, mais la classe a du mal à croire que cet "or brun" a autant de valeur que le prétend le célèbre oncle d'Anne-Sophie.

Le bus emmène la classe de Mademoiselle Bille-en-Tête dans l'organisme de Janet, la cousine d'Arnaud, pour en apprendre davantage sur les gènes et l'hérédité.

Une excursion au cœur du Soleil prend un tournant inattendu quand Monsieur Réglo, le directeur de l'école, très à cheval sur la sécurité, décide de participer au voyage.