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Quinn et Hynek se rendent à Roswell, N.M., avec le général Harding. Un citoyen local inconnu menace de révéler les preuves associées à un atterrissage en catastrophe extraterrestre qui a eu lieu il y a six ans et de faire connaître son existence au monde.

Quinn et Hynek sont sur le point d'atteindre un coupable potentiel, ce qui pourrait les amener là où ils doivent être pour découvrir la vérité derrière le célèbre incident de Roswell.

Hynek et Quinn enquêtent sur les rapports d'un soldat qui aurait été pris dans une soucoupe volante sur une base militaire éloignée du Nevada, où ils apprennent par la suite les différentes raisons pour lesquelles les secrets contenus dans la zone 51 ne devraient pas être divulgués.

Une supposée entité extraterrestre envahit une maison rurale du Kentucky, ce qui incite la CIA à donner à Hynek et Quinn l'accès à leur programme top secret connu sous le nom de MK Ultra, qui affirme que l'attaque extraterrestre a le potentiel d'être le début d'un plan plus vaste.

Le mystérieux Homme en noir kidnappe Hynek, qui envoie Quinn en mission avec la CIA pour le suivre et sauver Hynek.

Tout en se remémorant le tournage de "Rencontres du troisième type", Hynek raconte ses expériences avec l'infâme Robertson Panel et un homme excentrique contacté extraterrestre pour qui il a tout mis en jeu.

Hynek et Quinn visitent un ranch dans l'Utah pour en savoir plus sur les affirmations particulières d'une jeune famille concernant un phénomène inconcevable et potentiellement dangereux.

Hynek et Quinn enquêtent sur le vol de matériel sensible pris à Gens. Harding et Valentine, mais ils découvrent bientôt que leur coupable potentiel réside près de ce qu'ils imaginaient en plus des preuves concluantes d'un complot extraterrestre.

Lorsqu'un étrange avion disparaît dans la nature canadienne, Hynek et Quinn partent à sa recherche et récupèrent sa cargaison manquante, mais ils rencontrent plusieurs dangers potentiels en cours de route pour s'assurer que la cargaison ne soit jamais retrouvée par des personnes extérieures.

Hynek et Quinn font face à l'énorme pression de la prévention d'une éventuelle troisième guerre mondiale lorsqu'une série d'objets volants et submersibles non identifiés sont découverts lors d'un exercice naval à grande échelle qui a lieu près des eaux russes.