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S. Francisco. Il Detective Jack Hale, tornato in servizio sei mesi dopo la morte della sua collega e compagna, indaga sulla morte di tre donne, stroncate nel sonno da un attacco cardiaco. L'uomo è convinto che gli omicidi siano stati commessi dal medesimo assassino seriale. Grazie all'aiuto della dottoressa Klepp, Hale scopre che poco prima di morire tutte le vittime erano state paralizzate mediante il veleno mortale di un esotico ragno. Affiancato dalla sua nuova collega, il Detective Ava Lyford, Hale si mette sulle tracce di un professore universitario e del complice di quest'ultimo. Nel frattempo, l'uomo riceve una misteriosa missiva con all'interno l'ultimo frammento di una fotografia. Dietro l'istantanea finalmente ultimata si compone così una scritta vergata a mano: "Ti sto guardando".

Hale scopre che la Lyford era un'agente incaricata di indagare sul suo conto, al fine di stabilire o meno la sua idoneità al servizio attivo. Cavanaugh, che ora si ritiene soddisfatto, presenta al detective la sua nuova collega, Danielle Carter. I due iniziano subito ad indagare sulla morte di una ragazza, un tempo non vedente, alla quale sono stati strappati gli occhi. Quando un altro uomo subisce l'asportazione del fegato, gli agenti sospettano che qualcuno stia riappropriandosi per distruggerli degli organi che furono donati da un uomo ucciso in circostanze misteriose che, qualche tempo prima della sua morte, si era reso responsabile di un incidente nel quale una donna perse il bambino che portava in grembo.

Hale e Carter indagano sull'omicidio di un uomo che in passato era già stato accusato di crimini sessuali ai danni di minorenni. Gli investigatori sono convinti che l'assassino sia un uomo che ha voluto fare giustizia da solo. Esaminando il filmato dell'ultimo adescamento compiuto dalla vittima, gli agenti scoprono che quest'ultimo, pochi istanti prima della sua morte, aveva agganciato una bambina che l'assassino potrebbe aver usato come esca. Un secondo omicidio eseguito con le stesse modalità, induce i detective a ritenere che una coppia di pericolosi assassini di pedofili sia entrata in azione. Quando Carter e Cavanaugh scoprono il cadavere di un sospetto, la conclusione più ovvia da trarre è che la bambina abbia sempre agito da sola. L'assassina è in realtà una trentenne affetta da una malattia che le ha impedito il normale sviluppo.

Due gemelle vengono ritrovate assassinate nei rispettivi appartamenti, ognuna adagiata sul proprio letto, ma in posizione identica. Hale e Carter indagano sul duplice omicidio e, grazie ad un testimone, arrivano alla conclusione che a commetterlo potrebbe essere stato Randy Jesker. Ma subito si verifica un problema: il ragazzo si trova rinchiuso in un manicomio da alcune settimane. I detective continuano ad indagare e scoprono che Randy ha un fratello gemello che potrebbe essersi sostituito a lui per permettergli di uscire dall'istituto e commettere i due omicidi. Nel frattempo, Cavanaugh deve risolvere un contenzioso che la figlia Eden ha con la legge: è stata trovata in possesso di un documento falso.

Hale e Carter indagano su di una serie di fatti di sangue che sembrano essere legati con il mondo della mitologia egiziana. Il responsabile della singolare catena di delitti è un uomo molto malato, convinto che realizzare un millenario rituale potrebbe garantirgli l'immortalità. Intanto Carter continua la difficile ricerca di una giusta definizione per "crimine deviante", ma l'impresa si rivela più difficile del previsto.

Il ritrovamento del corpo senza vita di un uomo a cento passi dalla pagina di un libro sulla quale sono state segnate le lettere che compongono il nome della vittima sembra essere una scena del crimine alquanto familiare per Jack Hale. Il delitto ricalca infatti perfettamente le uccisioni compiute da un assassino seriale che al momento si trova in prigione: nientemeno che Robert Harris Hale, il padre del detective. Insieme a Carter e Cavanaugh, Jack tenta di scoprire l'identità dell'emulatore e per questo si reca in carcere per rivedere suo padre, il quale gli consiglia di esplorare in modo più approfondito il suo passato. Il nuovo assassino potrebbe essere una vecchia conoscenza di entrambi.

Il Tenente Cavanaugh deve affrontare la possibilità di aver messo in prigione un uomo innocente. Quest'ultimo è stato poi ucciso nel corso di una rissa in carcere. Ora, insieme alla sua squadra, l'uomo indaga nel mondo dei video game per scoprire quale giocatore sta trasformando in realtà le scene del crimine descritte in un gioco molto popolare su Internet. Il caso diventa di natura personale quando il killer prende di mira lo stesso Cavanaugh e si introduce di notte nella stanza di Eden all'università. Ray decide di sfidarlo apertamente e così l'assassino individua ben presto quale sarà il vero poliziotto che dovrà morire così come accade nel gioco.

Un uomo riemerge dalle acque dell'oceano, salvato da un gruppo di giovani surfisti. Potrebbe essere l'ultima vittima di un serial killer che si accanisce sulle coppie con una robusta catena. Il problema è che la vittima non ricorda più nulla della sua vita. L'auto dell'uomo viene ripescata e al suo interno viene rinvenuto il corpo senza vita di una donna, che però non è la moglie. I detective pensano quindi che l'uomo senza memoria avesse una relazione extraconiugale, confermata dal fatto che un'amica della vittima dichiara che quest'ultima non voleva parlare della sua ultima conquista. Quando un sospetto raffigurato in un identikit si presenta in ospedale per finire il lavoro sul sopravvissuto della sua ultima impresa, questi riesce a sopraffarlo e ad ucciderlo. La Polizia si convince così di aver finalmente risolto il caso del serial killer, fino a quando Hale e Carter non scoprono che cosa contiene uno scompartimento segreto che si trova nel sotterraneo della casa dello smemorato.

Hale e Carter indagano su di un nuovo crimine "deviante": un uomo uccide le sue vittime e poi deposita i corpi senza vita nei luoghi che sono stati epicentro di un terremoto. Gli omicidi sembrano essere collegati con una fantomatica Collina Oscura da salvare, per la quale le vittime si offrono spontaneamente in sacrificio. Inoltre, vicino ai cadaveri vengono rinvenute carte da gioco, pezzi del domino, scacchi e pedine del majong. I detective interrogano alcuni appassionati di terremoti e scoprono che la Collina Oscura è il riferimento ad un terremoto di qualche anno prima che ha causato molte vittime nella baia di S. Francisco. Il killer potrebbe aver perso qualcuno della sua famiglia.

Mentre sta partecipando ad un matrimonio, Carter è la testimone di un'esplosione che uccide la sposa a pochi metri dall'altare. Questo è solo il primo di una serie di omicidi che ben presto coinvolge una donna dell'alta società ed un avvocato difensore dei diritti civili dei gay. Hale e Carter chiedono aiuto a John Moore della squadra degli artificieri, il quale scopre che le esplosioni sono state provocate dallo sfregamento dei vestiti indossati delle vittime, i quali erano impregnati di una sostanza altamente infiammabile. Dopo aver individuato un probabile collegamento fra le vittime, i detective dell'Unità Crimini Devianti scoprono che il loro principale collaboratore potrebbe essere il responsabile di tutti i delitti.