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Tre ragazzi di quindici anni spariscono durante una gita organizzata da una scuola cattolica, la squadra indaga cercando gli eventuali moventi ed indagando sull’insegnante Padre Jonas Alcaraz. Nel frattempo emergono prove che il serial killer Phillip Stroh potrebbe essere tornato a Los Angeles.

Mentre la ricerca dei ragazzi scomparsi continua, la squadra affronta l’inaffidabile Padre Jonas mentre deve lottare con l’FBI che vorrebbe strappare le indagini Ai Crimini Maggiori Rusty sorprende Flynn e Sharon con una richiesta.

Mentre la squadra continua a cercare i due dei tre ragazzi scomparsi, Sharon scopre che un problema di salute può mettere a rischio la sua carriera professionale.

Il tenente Provenza prende in consegna la squadra mentre Sharon viene portata urgentemente in ospedale dopo essere collassata. Quando i ragazzi scomparsi vengono ritrovati in Messico dall’FBI i rapporti tra l’agenzia e la squadra sono sempre più tesi.

Mentre il caso dei tre ragazzi scomparsi della scuola di San Giuseppe arriva ad una conclusione inaspettata, Sharon e il tenente Andy Flynn si sposano davanti all’intera squadra e alla famiglia di Sharon.

Un avvocato nota per il suo lavoro in difesa delle donne oppresse viene trovata morta e tra i tanti sospettati ci sono alcuni familiari, un regista e un ex giocatore di football. Nel frattempo, Rusty e Gus affrontano la crisi della loro relazione.

La squadra indaga sulla morte di un'altra donna legata al caso dell’avvocato uccisa e sviluppa una nuova teoria. La condizioni di Sharon peggiorano mentre Gus ha una reazione inaspettata alla semi-soluzione di Rusty per i loro problemi relazionali.

Mentre indagano su due omicidi apparentemente legati tra loro, i detective scoprono una serie di aggressioni sessuali contro le cameriere della catena Tackles. Mentre si sviluppano nuove teorie un colpo di scena manda la squadra fuori strada.

Mentre viene risolto il caso legato ad alcuni omicidi e alle aggressioni sessuali ai danni delle cameriere della catena Tackles, la salute di Sharon peggiora tanto da essere ricoverata in ospedale in condizioni disperate, nel frattempo la squadra scopre che Phillip Stroh è tornato a Los Angeles.

Dopo la devastante perdita la squadra si rimette a lavora per rintracciare Phillip Stroh che nel frattempo ha fatto un’altra vittima. Stroh con l’aiuto di, Dylan Baxter,un esperto di informatica, cerca di manipolare la squadra per rintracciare la madre.

La squadra, sempre monitorata da Dylan, riesce a rintracciare la madre di Philip Stroh che racconta la storia del primo stupro e omicidio di Stroh quando aveva solo sedici anni. Nel frattempo Rusty è frustrato per la convivenza forzata con Gus.

Buzz capisce che il quartier generale dei Crimini Maggiori è stato hackerato, Dylan Baxter viene identificato e la squadra spera che cada nella trappola informatica messa in piedi per lui. Nel frattempo Stroh è vicino alla sua mossa finale e Rustry trova un indizio importante.

Il tenente Tao è bloccato in una stanza mentre un conto alla rovescia indica la possibilità che una bombi stia per esplodere. Mentre la maggior parte della squadra è altrove, Provenza, Buzz, Rusty e Gus si trovano faccia a faccia con Phillip Stroh per l’ultima volta.