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Natsu e Happy si sono riuniti con Lucy un anno dopo lo scioglimento della gilda. I tre iniziano la ricostruzione di Fairy Tail, iniziando dalla ricerca dei loro compagni.

La gilda Orochi's Fin ha lanciato un raid notturno rilasciando un grande gruppo di mostri sulla città di Margaret. Wendy e Sheria si precipitano nel cielo per colpire la forza principale del nemico.

Natsu, Lucy, Wendy, Happy e Charle incontrano Juvia nel villaggio Pioggeterna e scoprono che Gray è scomparso da sei mesi.

La Gilda oscura Avatar pianifica una strategia di purificazione. Alla ricerca di Gray, Natsu, Lucy e Happy, raggiungono la sede della Gilda, e si infiltrano nella base nemica.

Credendo che Zeref apparirà nel luogo in cui accadranno diverse morti, la gilda oscura, Avatar, sacrificherà un'intera città. Per fermare il piano, Natsu e gli altri raggiungono la città di Malva.

Proprio quando la sua sconfitta sembrava certa, Arlock riesce ad evocare Ikusatsunagi, un imponente dio della guerra che inizia a massacrare tutti, compresi gli uomini di Avatar. Con orrore, Natsu scopre la vera natura del piano di purificazione.

Circa 400 anni fa, un ragazzo che ha perso la sua famiglia, ha continuato la sua ricerca proibita ed è stato maledetto dal Dio Ankhselam.

Dopo aver ricevuto le lettere di Lucy, tutti i vecchi membri di Fairy Tail si riuniscono a Magnolia per la rinascita della gilda.

Sotto il comando di Elsa, i membri di Fairy Tail che hanno visto Lumen Histoire, partono per Alvarez per salvare il sesto master, Makarov.

Brandish, dell'esercito di Alvarez, incontra Natsu e gli altri nell'isola di Caracol. Il suo potere è così forte da fare sparire l'intera isola. Intanto, ad Alvarez, l'imperatore Spriggan torna all'impero.

I maghi di Fairy Tail dopo aver recuperato Makarov, devono scappare dall'impero di Alvarez. Uno dei 12 Spriggan però, Ajeel li ha seguiti.

Mavis rivela i segreti sul suo passato, inclusa la sua connessione con Fairy Tail, Zeref e il suo peccato.

Il "miracolo" che Mavis e Zeref hanno creato si è evoluto in una potente forma di magia che deve essere tenuta segreta. Mavis è ancora dispiaciuta per il suo peccato, ma i membri di Fairy Tail cercano di rincuorarla.

Prima che la battaglia per l'esistenza di Fairy Tail inizi, i membri della gilda passano la notte a riflettere.

Gray, Juvia, Elfman, Mirajane e Lisanna si ritrovano a dover combattere contro i soldati di Alvarez, mentre Elsa continua il suo scontro con Ajeel. Lucy, si ritrova faccia a faccia con Brandish, scoprendo con sorpresa che hanno una conoscenza in comune.

Ajeel dei 12 Spriggan è stato sconfitto, mentre il gruppo di Gray si ritrova a combattere contro dei nemici che conoscono le loro debolezze. Intanto il Commando del Dio del Fulmine cerca a tutti i costi di proteggere Fried.

I maghi delle gilde di Fiore si uniscono a Fairy Tail nella battaglia contro l'esercito di Alvarez. Intanto, Natsu e Happy si recano a ovest per sconfiggere Zeref una volta per tutte.

Zeref, sentendo vicina la sua morte, rivela il segreto dietro la nascita di Natsu. Dopo aver sentito la verità, Natsu decide di effettuare l'attacco decisivo. Intanto i maghi di Fiore iniziano la battaglia contro l'esercito di Alvarez e gli Spriggan 12.

Mentre continuano i combattimenti in tutta Fiore, a Fairy Tail Lucy ascolta quello che Brandish le ha da dire su sua madre Layla.

God Serena sconfigge i Quattro Imperatori di Ishgar e la battaglia a est sembra essersi conclusa. Intanto Gajeel, Elsa, Luxus e gli altri membri di Fairy Tail partono per supportare le altre gilde nella battaglia.

Mentre combatte Wall, Luxus perde le forze quando le particelle anti magia nel suo corpo raggiungono un livello critico. Wendy e Shelia combattono contro Dimaria, ma il suo potere sembra incontrastabile.

Wendy vuole usare la Third Origin per sconfiggere Dimaria, ma il suo utilizzo ha un prezzo: non potrà più usare la magia. Intanto, un altro membro dei 12 Spriggan attacca la base di Fairy Tail.

Mentre combatte contro Jacob, a Lucy viene un'idea per liberare i suoi compagni. Intanto ad Hargeon appare un nuovo nemico.

Neinhart grazie alla sua magia fa apparire i vecchi avversari, che attaccano i maghi presenti ad Hargeon. Elsa si trova a combattere contro tre di loro e ben presto si ritrova immobilizzata.

Il gruppo di Natsu, insieme a Brandish, si reca ad est per negoziare con August, il Re dei Maghi. Intanto, Sabertooth e Blue Pegasus tornano a combattere dopo che il gruppo di Gajeel li ha salvati.

Gajeel riesce a sconfiggere Bloodman, in un ultimo sforzo per salvare Levy. Ad est Brandish cerca di negoziare con August. Da qualche parte, Irene e Acnologia si ritrovano faccia a faccia.

La magia di Irene, Universe One, cambia la forma dell'intero regno di Fiore. Tutti i maghi di Ishgar sono stati spostati in modo casuale rispetto a dov'erano prima. Intanto alla gilda, Mavis dopo essere tornata nel suo corpo, incontra Zeref.

Mirajane sconfigge i suoi due potenti avversari, ma viene catturata da Irene prima che ci sia tempo per festeggiare. Altrove, le varie squadre di Fairy Tail cercano di raggiungere la gilda per salvare Mavis, ma il nemico è più potente di prima e li aspetta a Fairy Tail.

Gildarts fa un ritorno a sorpresa e affronta God Serena sul campo di battaglia. Natsu e gli altri continuano la loro avanzata verso la sede della gilda, ma presto si rendono conto di quanto siano veramente terrificanti gli Spriggan 12 quando sono tutti insieme.

Invel prende il controllo delle menti di Gray e Juvia. Nonostante siano amici intimi, i due sono costretti a detestarsi e combattere fino alla morte. Mentre la lotta procede, Juvia ascolta i suoi sentimenti per Gray e resiste in un modo che solo lei può fare.

Proprio mentre Gray scopre la vera identità di E.N.D., Lucy affronta Brandish. Lucy cerca di evitare lo scontro, ma le sue suppliche disperate rimangono inascoltate.

Natsu e Gray si scontrano, incapaci di frenare l'odio che si è impadronito di loro. Nel frattempo, il gruppo di Elsa lotta per superare l'enorme esercito nemico. Dopo che Irene utilizza la sua magia sui soldati, Mavis e Makarov intervengono per salvare la situazione.

Le lacrime di Elsa fermano lo scontro tra Gray e Natsu. Nel frattempo, i restanti membri dei 12 Spriggan iniziano un feroce assalto a Ishgar. August affronta Crime Sorcière mentre Larcade scatena un attacco che colpisce allo stesso modo amici e nemici.

Sting si precipita in aiuto mentre Larcade continua il suo implacabile attacco al gruppo di Kagura. Nel frattempo, Natsu perde conoscenza e si risveglia nella sua mente. Poi rivisita i ricordi perduti che fanno luce sul suo passato.

Sting assorbe il potere di Rogue e travolge Larcade con la tecnica del drago bianco d'ombra. In risposta, Larcade scatena il letale incantesimo Rest In Peace. Altrove, dopo un'intensa battaglia, Irene rivela a Elsa un segreto sul suo passato.

Irene condivide la storia del suo passato, compreso il segreto della nascita di Elsa. Rivela anche l'origine della magia del Dragon Slayer, la sua connessione con Zeref e il triste destino dei Dragon Slayer. Nel frattempo, Natsu continua il suo viaggio nella sua mente.

Irene ed Elsa si affrontano in una battaglia epica. Quando Wendy aiuta Elsa, Irene capisce una cosa che segna un destino immediato per Wendy.

Irene scatena Deus Sema, un potere oltre la comprensione umana. Con il solo braccio destro, Elsa combatte l'incantesimo che minaccia l'intera area. Nel frattempo, Natsu è costretto a prendere una decisione importante che cambierà per sempre il suo destino.

Magnolia ritorna alla sua forma corretta dopo la sconfitta di Irene. Come rappresaglia, August si prepara a distruggere la città e tutti coloro che vi abitano. Altrove, Gray raggiunge Zeref ed è il primo a conoscere il suo vero obiettivo.

Gray fa la scelta definitiva di sacrificare la sua vita e la sua stessa esistenza per intrappolare Zeref nel ghiaccio per l'eternità. Nel frattempo, il potente Acnologia raggiunge finalmente Magnolia e provoca grande preoccupazione per entrambe le parti della guerra.

August cerca di capire l'amore che è condiviso tra genitore e figlio. Quando minaccia di uccidere Cana, Gildarts risponde con rabbia. Nel frattempo, Natsu e Zeref continuano la loro epica battaglia, ma quando arriva Larcade si sviluppa una nuova situazione.

Larcade si acciglia di dolore dopo che Zeref lo rifiuta come figlio. Nel frattempo, August inizia a lanciare un potente incantesimo che minaccia di distruggere tutta Magnolia, insieme a se stesso. Altrove, Elsa e Wendy si trovano faccia a faccia con l'onnipotente Acnologia.

Il gruppo di Elsa incontra una donna misteriosa con un piano che può distruggere completamente Acnologia. Nel frattempo, Lucy, Gray e Happy cercano di scoprire la connessione tra la vita di Natsu e il libro di E.N.D.

Anna, Blue Pegasus e il gruppo di Elsa tentano di distruggere Acnologia usando una spaccatura temporale nascosta. Altrove, Zeref ottiene finalmente tutto ciò di cui ha bisogno per resettare il tempo e rivivere la sua vita 400 anni prima, prima di diventare immortale.

Zeref ottiene il potere di un dio, un potere che trascende anche il tempo. Natsu ribolle di rabbia ardente mentre tiene tra le braccia l'inconscia Mavis. Nel frattempo, Acnologia continua ad attaccare la nave di Blue Pegasus mentre Anna lotta per riaprire la spaccatura temporale.

Fairy Tail e Blue Pegasus continuano a combattere Acnologia. Con il varco temporale ora aperto, sono costretti a prendere una decisione difficile. Nella sala della gilda, Natsu si riprende miracolosamente e affronta Zeref un'ultima volta.

Mavis affronta Zeref da sola nella sala della gilda di Fairy Tail. Mentre rivela i suoi sentimenti contrastanti e la chiave del suo piano, Zeref fa un'improvvisa realizzazione. Nel frattempo, il gruppo di Lucy osserva il libro di Zeref di E.N.D. che inizia a svanire.

Zeref è sparito e Acnologia è ora intrappolata in una spaccatura nel tempo. Proprio quando sembra che sia ora di festeggiare, nel cielo appare una crepa minacciosa. Inoltre, tutti i Dragon Slayer svaniscono improvvisamente nel nulla. La battaglia non è ancora finita!

All'interno della spaccatura temporale e con il destino del mondo in bilico, i sette Dragon Slayer combattono contro Acnologia. Al di fuori della spaccatura, la forma fisica di Acnologia continua la devastazione. La situazione sembra senza speranza, fino a quando Lucy non escogita un piano disperato.

Il piano di Lucy per fermare la forma fisica di Acnologia è immediatamente rovinato, ma tutti si uniscono per mantenere viva la speranza. All'interno della spaccatura temporale, Natsu e gli altri Dragon Slayer affrontano la forma spirituale di Acnologia in un'epica battaglia sette contro uno.

Usando il potere di tutti e sette i Dragon Slayer, Natsu scatena un ultimo attacco pieno di sentimento su Acnologia. Un anno dopo, Lucy rivela tutto quello che è successo dalla battaglia.