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Kaz e Oliver finiscono imprigionati nel Mighty Max. Nel frattempo l'Annientatore e Skylar, divenuta malvagia, complottano per impossessarsi dapprima dell'ospedale e poi del mondo intero.

Oliver e Kaz cercano di entrare nel covo dell'Annientatore per sottrargli la collezione di superpoteri e restituirla ai supereroi. Intanto, Alan vuole partecipare alla sua prima Normo-festa di Halloween.

I ragazzi notano che alcuni eroi si stanno comportando in modo insolito, più precisamente: in modo malvagio. Sospettano così che all'interno dell'ospedale si annidi una talpa che collabora con l'Annientatore.

Kaz e Oliver temono che Skylar stia tramando qualcosa contro di loro, ora che conoscono la sua mutata natura. Ma le cose si complicano quando Skylar invita Oliver al ballo della scuola. Intanto, Alan è vittima di uno scherzo.

Oliver e Kaz partono per il pianeta d'origine di Skylar, Caldera, alla ricerca di Hapax il Vecchio, il mentore dell'Annientatore. Dovranno scalare il più alto vulcano del pianeta per sconfiggere un mostro.

Skylar e l'Annientatore scoprono il piano dei ragazzi, ma Skylar prende coscienza che i suoi poteri sono più forti di quelli dell'Annientatore e quindi non vuole più prendere ordini da lui.

Un uomo proveniente dal futuro fa visita ai ragazzi, rivelando di essere Kaz tra 25 anni e afferma anche di essere venuto per avvertirli che prossimamente ci sarà un malvagio che porterà distruzione: Oliver!

Oliver lascia il Mighty Med per partecipare ad un progetto scolastico insieme a Skylar, Alan e Gus. Intanto, Kaz è lasciato da solo a badare a un eroe malato, spiato da Oliver tramite una telecamera.

Horace abbassa gli standard richiesti per diventare un supereroe e Kaz lo aiuta nelle selezioni dei nuovi aspiranti al ruolo. Nel frattempo Oliver porta Skylar a una gara di ballo per fare impressione su di lei.

Oliver dovrà prendersi cura delle uova dai superpoteri di una supereroina incinta, portata al pronto soccorso. Kaz aiuterà Oliver a nascondere il suo "stato interessante" a scuola.

Kaz chiede a Spark, una giovane e coraggiosa supereroina, di diventare la sua ragazza. Intanto Skylar pensa a mezzi di sicurezza più efficaci per tenere lontano i "cattivi" dal Mighty Med.

Oliver vuole riabilitare Wallace e Clyde, mentre Kaz cerca di ottenere dei superpoteri con l'aiuto di Skylar.

Un supereroe decide di cedere i suoi poteri e Skylar e Kaz litigano per chi, tra loro due, dovrà ottenerli. Intanto, Oliver iscrive sua madre a un sito per incontrare l'anima gemella.

Due ragazzi Gulliver e Chaz scoprono il Mighty Med e Horace li assume, minacciando Oliver e Kaz. I due nuovi dottori però stanno cercando di usare i poteri di Caduceo per resuscitare un cattivo. Intanto Skylar installa un box per i suggerimenti per aumentare il morale dello staff.

Jordan è sicura che i supereroi esistano nella realtà, mentre Stefanie scopre che Skylar ha una falsa identità.

Oliver fa un sogno che gli ispira un fumetto con protagonista Tecton. Nel frattempo Alan aiuta Horace a organizzare il matrimonio.

As Kaz stands by the Bionic Academy's dying Chase Davenport in the superhero emergency room, Oliver and others seek to stop Incapacitator before he incapacitates the planet.

Kaz, Skylar e Oliver stanno cercando una chiavetta USB che contiene informazioni molto importanti. Intanto Alan ospita una sessione di consulenza famigliare.

Kaz e Skylar sono alla ricerca del super potente Arcturion. Nel frattempo, Oliver recluta un improbabile candidato che lo protegga da Mr. Terrore.

Oliver è alle prese con un conflitto interiore mentre accompagna sua madre all'altare. Nel frattempo Kaz e Skylar lottano per proteggere l'Arcturion dai cattivi che vogliono impossessarsene.

Oliver vuole trovare il supercattivo Mr.Terrore.