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Il capo della squadra Gus si prende la responsabilità dopo che un misterioso missile abbatte un aereo. Intanto, gli agenti a Pine Gap affrontano la vita di ogni giorno.

Gus deve gestire una nuova realtà, mentre le domande sull'attentato rimangono senza risposta. Per scovare una talpa Ethan e Kath devono ricorrere ai vecchi metodi.

Tra Jasmina e Gus sale la tensione, mentre viene messa alla prova la loro lealtà. Kath e Rudi cercano la verità a proposito di una festa della Squadra A.

Jasmina viene scoperta a superare i limiti ed è presa di mira da Jacob. Poi vuota il sacco con Gus. Moses fa un inaspettato collegamento che potrebbe causare problemi.

La situazione precipita mentre la caccia all'hacker s'intensifica. Ethan affronta Kath e Gus rivela le proprie intenzioni. Moses è indagato. Jasmina si sente combattuta.

Scoppiano numerose crisi e la minaccia di una guerra incombe. Mentre un traditore è ancora in libertà, trapela un video imbarazzante e un pilota deve essere recuperato.