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唯一の守護者であるメタルポリスのジバンは、邪悪なバイオノイドを阻止するため、圧倒的に不利な戦いに挑む。悪役は日本全体を麻痺させる可能性のある致命的なコンピューターウイルスを盗んだ。国の未来をかけたこの戦いで、ジバンは世界が混沌に飲み込まれるのを防ぐために、鋼鉄の力のすべてを駆使しなければならない。何百万もの人々の運命が、彼の装甲に包まれた手にかかっている。

Doctor Giba infiltrates the police using a Bionoid in order to root out and eliminate Jiban.

When produce begins to come to life and attack humans, Naoto tracks it to a suspicious man preparing to expand the operation for Bioron.

The daughter of a biological scientist takes revenge on those that scorned him, drawing her to the attention of Bioron.

治晩（ジバン）と、誘拐された創造主への復讐心に駆られた知能ロボットが手を組む。そのロボットは非暴力主義を体現しているが、その内部には邪悪な企業「バイオロン」にとって極めて重要な強力なマイクロチップが隠されている。二人は、科学者を解放し、技術が悪用されるのを防ぐため、強大な組織と対峙しなければならない。

奈央人（なおと）は、恐竜の最後の生きている卵というかけがえのない宝物を持っている動物園の園長を守るために立ち上がる。しかし、この発見を知っているのは彼だけではなかった。不気味な企業「バイオロン」も、その卵を狙って狩りを開始し、恐竜を孵化させて邪悪な計画に利用しようと企んでいる。今、奈央人は園長を守り、絶滅危惧種の未来が悪者の手に渡らないようにしなければならない。

ギバ博士は、小さな女の子の悲しみにつけ込み、彼女が失くした人形をバイオノイドに変える。しかし、それはただ命を吹き込まれたおもちゃではない。それは、接触した者をわずか24時間で殺す致命的なウイルスに感染しているのだ。今や、無邪気に見えるバイオノイドは、死をもたらす兵器となった。

奈央人（なおと）は奇妙な事件を調査している。猫のように振る舞う子犬が発見されたのだ。すぐにこれは単なる異常ではなく、企業「バイオロン」の実験の結果であることが判明する。彼らは狂犬病ウイルスを使い、動物の遺伝子を変化させていたのだ。今、奈央人はこの陰謀を暴き、ウイルスが制御不能になる前に恐ろしい実験を止めなければならない。

奈央人（なおと）は、小さな女の子が父親を救うのを手伝っている。本物の父親は姿を消し、その代わりにバイオノイドが居座っている。今、彼は夢を現実にする装置を使って、その設定を悪夢に変えている。奈央人と少女は、バイオノイドを止め、父親を取り戻し、他人の夢を恐怖に変えさせないようにしなければならない。

子供たちを食物に変えるという「バイオロン」の恐ろしい陰謀を調査する中で、奈央人（なおと）は彼を憎んでいると主張する悲しむ少年と出会う。ヒーローはなぜ子供がそのような態度をとるのかを理解しようと試みるが、同時に手遅れになる前に悪党たちを止めなければならない。

思いやりのあるピアニストが、バイオノイドに感染して狼男に変身する。彼の新たな目標は悪を広めることだ。人類を操ることができる強力な曲を作曲しなければならない。今、彼の才能は闇の目的のために利用されている。

母親がジバンと何らかの関係があると知ったギバ博士は、マユミの母親を誘拐します。今、彼女は彼の罠の餌食となり、マユミとナオトを誘い出し、彼らと永遠に決着をつけようとします。

ある少女が偶然にも「バイオロン」の秘密に関わる生き物を発見します。彼女がこの発見のために誘拐されたとき、ナオトは困難な選択に直面します。彼女の命と会社の秘密、どちらがより価値があるのか？彼は、悪役が彼女の発見を利用する前に、少女を見つけて救出しなければなりません。

少年から得た情報をもとに、直人は真由美を探しに出かけます。少年は彼女を見たと主張しますが、直人は彼に隠された動機があるのではないかと疑っています。直人は、少年の本当の意図を突き止め、できるだけ早く真由美を見つけなければなりません。

バイオノイドは才能ある漫画家を誘拐します。彼は、この漫画家を使って、彼自身が真のヒーローとして描かれ、「悪役」であるジバンを倒す漫画を作成できると考えています。

ある事件の後、村松は自分がジバンだと信じ込むようになります。この妄想のため、彼は悪質な計画に彼を利用しようとする「バイオロン」社に誘拐されるターゲットとなります。

バイオノイドはリョウの姿を装い、海外から持ち込まれたモナ・リザを含む日本中の芸術作品を破壊しようと計画します。今、ナオトは偽物であることを暴き、傑作を破壊から救わなければなりません。

ギバ博士に信じられないほど似た男が、マーシャとカーシャの計画を混乱させます。姉妹は誤って、ボスのために盗んだエイリアンのサンプルを彼に渡してしまいます。今、彼女たちは、ギバと間違えた男がそれを自分の目的のために使用する前に、サンプルを取り戻さなければなりません。

ジバンは、少女の父親を救うために山地まなぶと協力します。彼の精神は忍者バイオノイドに盗まれていました。今、彼らは力を合わせて悪役と対峙し、彼の個性が完全に消去される前に男性の精神を取り戻さなければなりません。

ジバンは、その本質に反して、害を及ぼすのではなく癒す謎のバイオノイドを擁護します。バイオロンがこれを知ったとき、彼らは自分たちの創造物を破壊することを決定します。今、ジバンはユニークなバイオノイドを自身の創造者から守らなければなりません。

新たなエイリアンの生命体の発見は、ジバンがバイオロンとコスモス女王という2人の強力な敵の悪意ある意図からそれを守らなければならないという決定的な戦いにつながります。今、ヒーローはエイリアンの存在を救うために二つの戦線で戦う必要があります。

ジバンの死と日本中で暴れ回るバイオロンの後、柳田は希望を捨てず、彼を復活させるための準備を進めます。しかし、プロジェクトを完了するには、依然として行方不明になった真由美の助けが必要です。ジバンがもはや守ることができない今、柳田はヒーローを復活させるために真由美を見つけなければなりません。

直人は、子供たちを洗脳するバイオノイドを追跡します。悪役は、自分を偉大で高貴なサムライだと想像し、今、この新しいイメージを利用して子供たちに彼に従うよう説得しています。彼はさらに大きな害を及ぼす前に、彼を止めなければなりません。

コスモス女王は、人間の美しさの概念を理解するために、服を盗み始めます。その間、直人とバイオロンは、それぞれの目的を追求しながら、独立して彼女の正体を解き明かそうとします。

清四郎の弟が謎のままに警察の職を辞して故郷に戻ったとき、清四郎は彼の後を追います。弟が「バイオロン」が仕掛けた罠の餌でしかないことを彼はまだ知らず、今、彼は悪役と対峙しなければなりません。

バイオロンは真由美の脆弱性につけ込むことを決定します。彼らは、ジバンを一度限りで排除する唯一の方法だと信じて、彼女に爆弾を仕掛けます。今、ジバンは罠にかからずに真由美を救わなければなりません。

警察官で法的な問題を抱えているヨーコの友人が、思いがけず「バイオロン」の科学者と対立することになります。科学者は、彼女が守ることを決めた致命的なウイルスを奪うために彼女を追跡します。今、彼女はどちらの側に立つかを選択しなければなりません。

ブレイクを夢見る若いロックバンドは、街中のエネルギーをギバ博士のために集めているバイオノイドを破壊するために、ジバンと力を合わせます。バイオノイドが街からエネルギーを吸い取っている間、ロックバンドはジバンを助けるためにコンサートを開きます。

バイオノイドは、ヨーコに宇宙ウイルスを感染させます。彼の目的は、彼女を利用してウイルスをジバンに感染させ、彼のすべての機械システムを破壊することです。ジバンは、致命的な感染症にかかることなく、ヨーコを救う方法を見つけなければなりません。

コスモス女王が街に眠り病をもたらしたとき、「バイオロン」はそれを自分たちの目的のために使用する治療法を入手することを決定します。この作戦中、開発を担当していた科学者の脳は、皮肉なことに自分自身を天才と信じている彼のファン自身の脳と入れ替えられます。

ある少年に触発され、「バイオロン」はユニコーンのバイオノイドを作成します。彼らの創造物が破壊されないように、彼らはその中に少年を閉じ込めます。今、ジバンは中に子供がいるため、バイオノイドを攻撃することができません。

二人のカメラマンは、偶然「バイオロン」の秘密研究所を見つけてトラブルに巻き込まれます。彼らは自分たちの発見を証明しようとしますが、何もできません。今、彼らは会社とその秘密の実験についての真実を明らかにする方法を見つけなければなりません。

ギバ博士は、真由美の感情を利用して、ジバンの基地がどこにあるかを思い出させようとします。その後、彼は敵を一度限りで排除するためにそれを破壊しようとします。

直人はついに、彼と真由美を結びつける真実を知ります。同時に、バイオロンは彼の正体であるジバンを暴き、それを自分たちの利益のために利用することを決定します。今、直人は会社のでっち上げた計画から自分自身と真由美を守らなければなりません。

「バイオロン」が世界征服の準備を進める中、直人は最後の戦いの準備をします。彼は、最も邪悪な敵を倒すために大きな犠牲を払わなければならないことをまだ知りません。これは、世界の運命を一度限りで決定する決定的な戦いとなるでしょう。

最後の戦いで、ジバンはギバ博士と「バイオロン」の全戦力と戦います。世界だけでなく、妹の真由美の命もかかっています。今、ジバンは彼女を救うために敵を倒さなければなりません。