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　星暦４０８８年。人類はみずからの過ちの数々により、惑星ＺＩＯＮ（シオン）をのぞく星を失った。そのＺＩＯＮが居住可能になる日がやってくるまで、人類はコロニーでの生活を余儀なくされた。 　それから１０００年ばかりの時がすぎて――。 　人類はヴィクティムという、謎の侵略者と戦っていた。人類を守るのは「女神（イングリッド）」と呼ばれる５体の巨大人型兵器である。 　女神のパイロットを目指す主人公・ゼロは、女神のパイロットを養成する機関ＧＯＡ（ゴア）へと入学するために、ＧＯＡ行きの宇宙船の中にいた。ゼロはそこで自分と同じく女神候補生となるクレイとヒイードと出会う。そこで性格の合わない２人は、早速ケンカをはじめてしまう。 　その頃、ＧＯＡには五機の女神と、そのパイロット達がやってきていた…。

　間違って女神の一機であるイーヴァ・リーナに搭乗してしまったゼロ。だが奇跡的に、女神との神経接続に成功する。しかし、女神との「同調」はどんどん進行し、女神の整備士であるリーナは焦燥を募らせる。あまりにも同調が進めば、ゼロの精神が戻って来ない危険性があるからだ。 　その頃、ゼロはコクピットの中で幻影を見ていた。 　それはゼロが子供の頃、住んでいた辺境のコロニーがヴィクティムに襲われていたときの出来事であった。ゼロはヴィクティムから自分たちを救ってくれた５体の女神に、中でも白い女神エーン・ラティエスに心を奪われた。なぜそのような事を思い出すのか、驚くゼロ。 　すると、ゼロが女神に接続したときに出現した謎の少女が尋ねた。 　「どうしてあなたは私と同じものが見えるの？」 　もしかして、自分とゼロは同じ存在なのではないか……と。

　女神とヴィクティムの戦闘が始まり、ガルイースはイーヴァ・リーナの様子がおかしいことに気付く。 　一方、クレイとヒイードは、かつぎ込まれてくる負傷兵を目の当たりにして、ＧＯＡがどういう場所であるかを実感する。 　リーナから救出されたゼロはまだ夢の中にいた。自分がかつて住んでいたコロニーによく似た、懐かしい場所で、少女に言われる「もういちど、わたしを見つけてね」と。 　意識を取り戻したゼロに、ヒイードがつめよる。ヒイードは自分をさしおいてゼロが女神に乗ったことが気に入らないのだ。ゼロはゼロで、そんなヒイードの高圧的な態度が気にいらなくて、売られたケンカを買ってしまう。まだ戦闘が続いているというのに、乱闘を始める２人。 　教官のアズマは呆れるが、あえて止めようとはしない。ゼロは特殊能力・ＥＸを使って勝負を決めようとするが、ヒイードに難なく止められてしまう…。 　その頃、格納庫では整備士のキズナが練習機に語りかけていた。やがて来る女神候補生への期待に胸をふくらませながら。

　引き続き、攻撃を仕掛けてくるヴィクティムに応戦する５女神。 　ラティエスがとどめをさそうとしたその時、ZIONの近くで衝撃波が放出。アギ・キーマイアが宇宙空間へ飛ばされてしまい、リオリートは右腕を負傷してしまう。 一方、なんとか無事に入学式を迎えることができたゼロ達候補生の、本格的な訓練が始まった。 数々の試験・検査で、ゼロはアトミックで補っている部位がひとつもない完全体“ZENOA”ではないかと推測される。 食事の時間になり、ゼロは、自分自身の声に他の候補生の視線が集中したことで、ここにいる候補生みんながライバルだということを改めて思い知らされるのであった…。

星暦4088年―「星系危機」により住む星を失った人類の最後の希望・惑星ZION(シオン)は、「ヴィクティム」という謎の生物群に狙われていた。 詳細情報 ＜番組内容＞ #06 CURRICULUM 05 コンビネーション #07 CURRICULUM 06 PRO-ING 2000年放送作品【全12話+OVA1話(スペシャルカリキュラム)】 ＜キャスト＞ ゼロ・エンナ：小尾元政/キズナ・トゥリーク：長沢美樹/クレイ・クリフ・フォートラン：吉野裕行/ヒイード・グナー：千葉進歩/ヤマギ・クシダ：陶山章央/ルズ・サワムラ：大本よしみち/アーツ・ウィルニー・コクトー：野島健児/アズマ・ヒジカタ：藤原啓治/ティーラ・ザイン・エルメス：天野由梨、井上喜久子（スペシャルカリキュラム） 他

星暦4088年―「星系危機」により住む星を失った人類の最後の希望・惑星ZION(シオン)は、「ヴィクティム」という謎の生物群に狙われていた。 詳細情報 ＜番組内容＞ #06 CURRICULUM 05 コンビネーション #07 CURRICULUM 06 PRO-ING 2000年放送作品【全12話+OVA1話(スペシャルカリキュラム)】 ＜キャスト＞ ゼロ・エンナ：小尾元政/キズナ・トゥリーク：長沢美樹/クレイ・クリフ・フォートラン：吉野裕行/ヒイード・グナー：千葉進歩/ヤマギ・クシダ：陶山章央/ルズ・サワムラ：大本よしみち/アーツ・ウィルニー・コクトー：野島健児/アズマ・ヒジカタ：藤原啓治/ティーラ・ザイン・エルメス：天野由梨、井上喜久子（スペシャルカリキュラム） 他

　ＧＯＡの演習場で、トップクラスの候補生達のプロイング訓練を見たゼロ達は、その凄さに驚いていた。そしてゼロは、これから行われるプロイングの基本操作訓練を、候補生の中でトップであるアーツと組みたいと、自ら申し出る。 見学を終えたゼロ、クレイ、ヤマギの３人はしゃべりながら通路を歩いていた。突然、ヤマギを呼び止める声に振り向くと、ひょろひょろに痩せたルズが立っていた。３人は、ルズのあまりの変わりようにびっくりしてしまう。そこで、食事になるとルズに無理矢理食べさせようとするのであった。 その夜、ゼロは不思議な夢を見た。遠いコロニーに住む母の姿が見えたが、ゼロはどうしても母の顔が思い出せないのであった…。 　迎えた訓練当日。ゼロとクレイは昨夜の寝不足のせいで、危うく遅刻しそうになる。ゼロ新入達候補生５人とトップ候補生５人のペアも決まり、整備士候補生達も配置について、訓練開始となった！

　ゼロ達の、実技訓練が始まった。特に、ゼロの動きにはアズマ自身も大いなる可能性を感じていた。そのアズマに校長はあることを告げる。それは近々現パイロットに欠員の出る可能性があるという事だった。 ヴィクティムとの戦闘を終えた５女神達が帰還した。アーネストは、戦闘中に勝手な行動をとったガルイースことを責めた。床に崩れこむガルイース。整備士のリーナは、そんな彼を見てどうしていいか分からず、ただ抱きしめることしか出来なかった。 　一人、外を眺めていたアーネストにチューンが話しかけてきた。チューンは躊躇しながらも、アーネストを慰めるのであった。 　一方、ＧＯＡではゼロ達の、激しい実技訓練が続いていた！！

　恐るべき数のヴィクティムが惑星ＺＩＯＮに向っているという報を受け、５機の女神たちが出撃する。 　アーネストをう整備士のチューンは、この戦いが終わったら話したいことがあると、彼に告げる。 　一方、ゼロはアーツと実技訓練での勝負を楽しんでいた。先輩の女神候補生と知り合う。アーツはテレパシストと呼ばれるＥＸ能力者で、人の心を読むことができるが、そのせいでアーツは友達を作ることができず、孤独な思いをしていたのであった。 　だが、二人の勝負の決着がアーツに決まりかけた寸前、彼は心臓を抑えて倒れてしまうのだった。 　そのころ戦場では、アーネストがガルイースをかばって戦死する！！ 　彼の乗る女神・ルーマクレインに、リーダーのティーラは、ルーマクレインの整備士チューンに、新パイロットへの引継作業をはじめるように命令する…。

　アーツを新たなパイロットを迎え、女神ルーマクレインはリネイドクレインという新たなコードネームを与えられる。 　そのゼロは不思議な夢の中で、一度も体験したことのない惑星での光景を見ていた。だが、その夢はクレイとの模擬戦の最中に夢を見ていたのだ。どうして訓練中に寝ぼけられるのかと、みんなはゼロに呆れる。 　ゼロがホームシックにかかっていると言うクレイに、ゼロはムキになって否定しようとする。そんな会話の中で、ゼロは何故自分がパイロットになろうと思ったのか、答えられない自分に気付いてしまう…。一方クレイは、ゼロの妙な夢には、女神の中で得た体験が影響しているのではないかと考え、ゼロを催眠状態におくことで状況を再現しようとするのだが…。

　アーツが女神パイロットとなったことで、新たなトップ候補生が選ばれることとなった。 　次の女神パイロット狙うヒイードは、模擬戦においてＥＸを暴走させ、フォースに全治３週間の重傷を負わせてしまう。 　そのヒイードもまた、自分でＥＸを制御することができず、ＥＸ中和ガスによって暴走を止め、廃人になることを免れる。そんなヒイードを見てイクニは、彼をサポートしきれない自分のふがいなさに悩む。 　一方クレイは、人間がＥＸ能力を手に入れた理由を考え、それは生存本能が導き出した進化なのではないかと思いはじめる。そこでヒイードの過去を探れば、彼の持つＥＸ能力も解析できるのではと、彼の履歴の調査をはじめるのだった。 　その頃、ヒイードは夢の中で、自分がはじめてＥＸ能力を発動させた時の事を思い出していた…。

女神たちの網から逃れたヴィクティムを掃討するため、候補生たちに出撃の命令が下った。だが、完全な実戦ではなく、生還することだけを求められた、訓練の一環としての出撃であった。 　アズマは候補生達に、深追いをするなと命令するが、ゼロやヒイードの耳には入らなかった。 　その頃イクニは、しきりにキズナにゼロの機体の様子をたずねていた。ヒイードのための手助けをしようと、ゼロの機体に細工をしてしまったのだ。しかし、事態はイクニの予想を超えてしまい、ゼロは故障を抱えた機体に乗り込んで戦場へ向かってしまったのである。 　案の定、ゼロはヴィクティムの攻撃を回避することができず、ＧＯＡの通信圏からはじきだされてしまう。クレイたちは焦るが、アズマに持ち場を動くなと厳命されており、下手にゼロを捜して二重遭難になることを畏れ、心配することしかできない。いっぽう戦果を稼いでいるヒイードは、とりのがしたヴィクティムの後を追って持ち場を離れてしまう…。