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内医院、最高の遊び人医官チェ・ウォン（イ・ドンウク）は仮病を言い訳に仕事をさぼり、ただひたすら娘のラン（キム・ユビン）の病気の治療にだけ没頭する。ある日、中宗（王様）の病状が危篤になると、世子のイ・ホ（スロン／2AM）はウォンに王様の治療を命令するが、ウォンはこれを拒否する…。

ソユン派のたくらみで東宮殿（※世子の部屋）に火災が発生、診察のために来ていたウォンがイ・ホを救出する。イ・ホはこの事件を不問に付すこととし、ウォンをたずねていって娘の治療を助ける代わりに自分の側で自分を守ってほしいと依頼するが、最後までにウォンはイ・ホの願いを拒絶する。

ウォンはミン・ドセンの殺人犯として捕まり義禁府の役人イ･ジョンファン（ソン・ジョンホ）に拘束され、ウォンの家族はばらばらに。病気のランの容態も深刻になっていき…。一方、ダインはチェ･ウォンがあれほどに探していた命の恩人であることを知る。

ウォンはコチルを救おうとするファジョクペ（※民衆グループの名前）の助けにより脱獄する。すぐに家にかけつけたウォンはランを連れて逃走し、その後をイ･ジョンファンが追撃。ウォンはイ･ジョンファンと官軍に追われる途中で絶壁から落ちて…。

ウォンはダインがノリゲを持っていた事情と、彼女が探していた恩人が自分であることを知り、患部を手当てする彼女の手つきに真心を感じ取って誤解を解く。ダインはウォンにイ･ジョンファンが再捜査を約束したことを伝え、ウォンはすぐに濡れ衣は晴れるだろうと希望を抱く。

「亀」がドクパルであると信じて追いかけていたウォンは、コチルの容体悪化により医院を訪れていたソベクとコクチョンによりサンチェ（※地名）に引っ張られていく。 ウォンの知らないうちにこっそり逃亡したドクパルは、腹部の傷で危篤状態の臨月の妻と一緒に再び捕まっており、ウォンはドクパルの妻までも助けなければいけない状況に。

ドクパルを通じてミン･ドセンの死の真実を知ったウォン。ドクパルは証人になろうと立ち上がり、ダインは危険を承知の上でウォンとイ・ホに会う方法を何とか探そうとする。いっぽう、文定王后はイ・ホが逆党であるムリと内通した証拠があるとして中宗（※王様）に知らせ、激怒した中宗の禁足令によりイ・ホは、真実を明かすというウォンとの約束を果たせなくなる危機に陥るのだが…。

ウォンはドクパルが破傷風だという知らせを聞いて、必ず助けなければいけないと思い針で顔を変形させて宮殿に潜入。ダインはウォンのためにキム･チヨン側の部下のふりをしてドクパルの治療時間を稼ぐ。イ・ホがこっそりドクパルの治療を宮殿でしていることを知った文定王后は、イ・ホを刺激するために東宮殿をたずねるが、既に心の中に母親はいないといい、「母上」と呼ばずに「中殿様」と呼ぶイ・ホに衝撃をうけて倒れてしまう。

ウォンはキム・チヨンから、ドクパルの命を助けずに見捨てれば、娘と逃げるのを助けるという提案を受けて葛藤する。ダインは宮中でランを治療しながらウォンの脱出計画をそっと助け、ランが宮殿に入るのをみて疑いを持ったイ･ジョンファンは宮殿の門を監視、ウォンを捕まえることに集中する。

ウォンはミン・ドセンが残した「亀」の字がドクパルではないかもしれないという疑いを抱く。ウォンの主張と少しずつ合っていく情況に、再捜査をしていたイ･ジョンファンはキム・チヨンをたずねて手の傷は自ら傷つけたと考えることができるかどうかをも確認しようとする一方で、東宮殿の医女として配定されたダインは文定王后から、養父チャン･ホンダルの命と引き換えに、世子を毒殺するのに加担せよという命令を受けて混乱に陥る。

ウォンはミン･ドセンが残した世子毒殺の決定的な証拠と陳述書があるという事実を確認、真実を明らかにする希望を抱く。イ･ホはウォンの逃走の知らせを聞いて、ソユン派の補償を間違いなく受けたのだと断定、誤解は深まるばかり。チャン・ホンダルを通して牡丹の花の真実を知ったダインは誤解を解くためにウォンに会いに行こうとするが、自分を尾行する存在に気付いて絶望する。

ウォンはダインが送ってくれたクムゲプヨンバンによりランの治療のペースを上げていき、養父と自分との間で苦境に立たされているダインに対する切ない思いが大きくなる。ウォンから処方箋をとって消えたマクボンがチャン･ホンダルに捕まっているという知らせを聞いたイ･ジョンファンは、明（※中国）に売られていく直前のマクボンを目撃する。

ダインはどこにもウォンが見えないためウォンが死んだのだと考えショックで倒れる。後になってその事実をしったウォンはダインを治療し、自分のせいで病に苦しむダインの姿に心を痛め、イ･ジョンファンと一緒に陳述書を取り戻したチャン･ホンダルを捕まえるがダインのことを思うと気が重い。

ウォンはチャン・ホンダルの命を守るというイ･ホの直筆の手紙により陳述書を手に入れるが、自分のせいで養父チャン・ホンダルの意思にそむいたダインをみて心が痛む。イ･ホは自分を説得するためにたずねてきた文定王后の本心を見破り、逆に、罪を認めて命乞いでもすれば、と文定王后をとがめる。

ウォンはチャン･ホンダルの死で悲しみにくれるダインと一緒に過ごしながら彼女を見守り、ウォンがダインを想っていることを知ったソベクはダインのようにスカートをはいたり髪留めをつけてみたりと努力してみるが、ダインだけを見つめるウォンに涙を流す。

ウォンは王様に陳述書を捧げ、ミン･ドセン殺人事件の真実を明らかにする。ウォンとダインは未来を約束し、濡れ衣を晴らす未来を夢みてドソン（※地名）へ旅立つ。イ･ジョンファンは王様の命令で尹元衡（※文定王后の弟）まで牢獄に閉じ込め、本格的に文定王后を追い詰め、窮地に追いやられた文定王后はシムゴクチサの名簿を根拠にミン･ドセンとウォンが趙光祖（※儒学学者、政治家）を追従する逆党であるとして反撃。

ウォンは王様の赦免命令により、それまでの間のすべての心配事がすべて解消。ダインとラン、イ・ジョンファンとウヨンのみんなが一緒に楽しいひとときを過ごす。イ･ホは弟である慶原大君のためにもと考えて文定王后に、許しを請うようにすすめるが、文定王后は反省どころかもっと不道理なことをして毒気をさらし、さらには王様を殺すまでに及ぶ。

ウォンは襲撃にあって廃墟になったサンチェを人々の隠れ場所にし、負傷者たちを治療する中、コチルを捕まえていこうとするイ･ジョンファンとばったり出遭う。文定王后はイ･ホの即位前に宮殿内で血なまぐさい事件を起こすようソユン派に命令する。イ･ホの保護の下、ダインと一緒に宮殿内で生活していたランは偶然出会った慶原大君と一緒にその事実を聞き、イ･ホとウォンを殺そうとする話に驚く。

ウォンはイ･ホの即位により罪を赦免され、失った財産も取り戻す。しかしすべてが元通りになった今、これ以上一緒にはいられないと別れを告げるダインを引き留められずに送り出し、心が痛い。文定王后と慶原大君に死薬の命令をくだすべきだという上訴が相次ぎ、イ･ホは苦悩に陥り、文定王后は命をつなぎとめるためにシムゴクチサの首長チョンボンに隠密に提案をする。

ウォンはソベクとイ･ジョンファンを治療するために忙しく、自分の傷のほうに気を向けられなかったところに、イ･ホの命令でたずねてきたダインから治療を受け、変わりない愛を確認する。文定王后がイ･ホを再び殺害しようとしている事実を知った慶原大君は二人の間で葛藤し、その事実を知らないイ･ホは、自分から王位継承権を剥奪してほしいと請う慶原大君を哀れに思い、秘密裏にウォンに治療を依頼する。