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高句麗の栄留王は、国を脅かす唐への対応や世継ぎの人選を巡り、淵蓋蘇文（ヨン・ゲソムン）将軍と対立している。淵蓋蘇文の庶子ヨンチュンは、初めて父との面会を果たすが冷たく突き放される。王女ムヨンと出会い、王宮武士になるという野望を抱く。

栄留王と淵蓋蘇文将軍との溝は深まり、穏健派の大対盧へ・テスが暗殺される。新大対盧には淵将軍の側近が選出されたが、王側に寝返った。王宮武士に応募したヨンチュンは、最終試験の最中に海で溺れかけるが、王女ムヨンに助けられ首位で合格する。

淵蓋蘇文将軍の側近は、太子と王女を消すため刺客を送り込む。王宮武士となったヨンチュンが刺客の動きを察知して２人を守ったが、父である淵将軍をかばうため、王室には暗殺未遂について隠し通した。逆に、以前ヨンチュンが人質を殺したことがばれ、斬首刑を言い渡されてしまう。

真相を知った王女は、ヨンチュンを救うため奔走する。だが王は、淵蓋蘇文の息子を死刑にする意志を変えなかった。結局、ヨンチュンは斬首刑ではなく絞首刑に処されてしまう。一方で淵蓋蘇文は、王族のジャンを味方に引き入れようと画策していた。

ヨンチュンは絞首刑に処されたが、ジャンの小細工により一命を取りとめた。父である淵蓋蘇文から、王室との縁を切るよう迫られたが拒む。一方、涙に暮れていた王女は、ヨンチュンの生存に気づき希望を抱いた。クムファ団のシウは、淵派の謀反計画の盗聴に成功した。

謀反の動きを知った王室は、太子冊立式で淵派を一網打尽にする計画を立てる。だが、王女を守るためにヨンチュンが王宮に侵入し、淵派の計画を妨害した。一方、陰謀により王子が落馬して重傷を負い、冊立式自体が延期となる。ヨンチュンの身を案じる王女の元へ、彼本人が現れた。

冊立式での謀反を妨害するため王宮に侵入したヨンチュンを、ジャンと王女がこっそり脱出させた。淵蓋蘇文はヨンチュンに、閲兵式での謀反に加勢して王女の首を取るよう求める。落馬した王子に回復の見込みがないため、栄留王は別の後継者を立てることにした。王の甥である王室護衛隊長ジャンが本命と考えられていたが、王が指名したのは、なんと王女だった。

閲兵式の日に淵蓋蘇文が反乱を起こし、王と王子をはじめ穏健派の貴族ら百名以上を殺害した。王の後継者になり損ねたジャンが淵派側に寝返ったことが、謀反の成功を決定づけた。一方、王女を救うため、父に従うふりをして王宮に来たヨンチュンを見て、王女は裏切られたと憤慨する。

王の殺害現場に来たヨンチュンは、淵蓋蘇文の喉元に剣を突き付けて王女たちを逃がす。王女は山に逃げたが、崖から川に転落してしまう。元クムファ団員である傘職人により命拾いした王女は、卒本へ行き、クムファ団員との接触を図る。一方、淵蓋蘇文は栄留王の罪をねつ造して謀反を正当化し、ジャンを王位に就かせた。

卒本でクムファ団員と再会した王女は、偽装工作により淵蓋蘇文やヨンチュンに自分は死んだと思い込ませる。そして自ら、今後はムヨン（無影）と名乗ることを宣言した。淵蓋蘇文を討つため、彼を恨むヨン・ジョンモと組むことにする。かたや王女の死により自分の無力さに絶望したヨンチュンは、力を得るため淵家に戻ることを決意し、父・淵蓋蘇文の護衛役となった。

王女とクムファ団は、ヨン・ジョンモと組んで淵蓋蘇文を討とうとしたが失敗に終わる。淵蓋蘇文は自ら大莫離支（テマクリジ）という新たな官職に就き、軍・人事・国政すべての権力を握って王を無力化させた。数年間、武術の鍛錬を積んだ王女は、大莫離支直属の情報機関である趙義府（チョイブ）に男のふりをして志願する。

男装した王女は、狙いどおり趙義府に採用された。だが国王ジャンは、王女だと見抜く。趙義府の総官ヨン・ナムセンは、異母兄である副総官ヨンチュンに「淵蓋蘇文の長男」の座を奪われ、対抗意識を燃やすのだった。

趙義府の副総官ヨンチュンは、新人のソ・ムヨンを王女ではないかと疑うが証拠をつかめずにいた。王女は淵蓋蘇文を討つため、国王ジャンと手を組む。新たな大対盧の座を巡り、淵派の大臣やヨン・ナムセンらがしのぎを削るなか、自己アピールの一環として淵蓋蘇文の功徳碑を建てようとしたヤン・ジヌクが、除幕式で死体となって見つかった。

クムファ団は趙義府の地下牢に火を放ち、収監されていたソサボン団長を脱獄させた。廃王の残党の本拠地情報を得たナムセンは、部下を引き連れて乗り込むが、わなにかかったことを知る。王女は現場に来たヨンチュンを斬ろうとするが躊躇し、逆に彼をかばって矢を受けてしまった。

クムファ団のわなにかかったナムセンは、責任を問われ趙義府の副総官に降格となる。代わりにヨンチュンが総官となった。ソ・ムヨンが女性と知ったナムセンは、彼女を使ってヨンチュンの弱みを握ろうとする。ヨンチュンは、王女と判明したムヨンを説得して逃がそうとするが、彼女は復讐をやめようとしない。

王女を救出するため、クムファ団はヨンチュンの母親を拉致した。人質交換要求を受けたヨンチュンは、１人で王女を連れて出る。だがクムファ団は約束を破り、ヨンチュンを捕らえたのだった。失望した王女は、ヨンチュン母子の救出に向かう。他方、淵蓋蘇文はナムセンから、ソヒ王女が趙義府に潜入していたことを知らされた。

王女は、ヨンチュンが３年前に自分の逃亡を助けていたことを知り衝撃を受ける。ヨンチュンは、クムファ団との内通の疑惑を払しょくするため、モソルとの縁談を受け入れた。反乱計画を変更した王女は、国王ジャンの協力のもと、自ら淵蓋蘇文を斬る機会を得た。だが、とどめを刺す前にヨンチュンが現れ、妨害される。

淵蓋蘇文の暗殺に失敗した王女は趙義府に追われるが、ヨンチュンの助けにより逃亡に成功する。だが結局は、ヨンチュンの母親をかばって捕らわれの身となった。母親はナムセンに殺されてしまう。クムファ団との関係を疑われたヨンチュンは、疑念を晴らすため王女を拷問しなければならなくなる。

淵蓋蘇文は王女に死刑を言い渡すが、「ヨンチュンを悲しませたくない」と本心をほのめかす。チャン教官らの手助けにより、王女は牢から脱出した。父に見放されたナムセンは、国王ジャンや大臣らを抱き込んで謀反の準備を始める。王女に淵蓋蘇文を殺させて即位させ、自らその夫になるという企てだった。

ナムセンは閲兵式の場で反乱を起こす。だが王女は淵蓋蘇文を刺さず、血で血を洗う復讐劇の終わりを告げて自害しようとした。それを、瞬時に阻止したヨンチュン。国王の裏切りを知り、激怒したナムセンは王女を刺そうとする。身を挺して彼女を守ったヨンチュンは致命傷を負ってしまった。それを見た王女は、わざとナムセンに刺され、ヨンチュンに寄り添うようにして息絶えたのだった。