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フェアリースターの王子さま・星の子チョビンがここ地球のトンカラ森にやってきた。チョビンの目的は悪の首領ブルンガを倒し、生き別れたママを探すこと。チョビンとトンカラ森の愉快な仲間たちの冒険が今始まる！

チョビンが腕に付けている星のしずくは、フェアリースターに再び光を取り戻すアイテムだった。星のしずくを欲しがるブルンガの刺客に勝利したチョビン。チョビンには、実はとんでもない潜在能力がある事がわかる。

ママがいる森の夢をみたチョビンは、トンカラ森の仲間たちと夢にみた森探しの旅に出る。ブルンガが送り込んだ新たな刺客をやっつけたチョビンは、仲間の大切さと、王子だからといって威張ってはいけない事を学ぶ。

ママを探すチョビンは、トンカラ森の巨大なあり地獄にはまってしまう。脱出の途中でチョビンの手から離れた星のしずくを狙うブルンガの手下たち。森の仲間の助けもあって、チョビンは敵を倒し星のしずくを取り戻す。

森の仲間チロチョンがチョビンにお星さまをプレゼントして欲しいと言う。それを知ったブルンガは星形をした敵デビヒトデンをトンカラ森に送り込む。敵を倒したチョビンは、チロチョンの瞳の輝きは星のようだと言う。

チョビンがルリと泉に水を汲みに行くと大きな食虫植物が生えていた。翌日には更に大きくなる植物。実はブルンガの手下が栄養を与えていた。ルリと博士を食べようとする食虫植物を、チョビンは森の仲間と共に倒す。

ママを探しに人間の街に行きたいチョビンは、ルリに街が見える丘に連れていってもらう。チョビンのルリへの振る舞いが理解できないチョビン。待ち伏せていたブルンガの刺客にチョビンは勝利するが、女心は理解できない。

街に行ったルリがチョビンにおみやげを買う。それが人形だったため捨てるチョビン。捨てられた人形はブルンガに改造される。その人形と戦い、勝利するチョビン。チョビンはルリにお詫びにプレゼントのお返しをする。

満月の夜、トンカラ森に王者クマゾンが帰ってきた。チョビンはクマゾンと仲よくなり、人間の街に連れて行ってもらう約束をする。しかし、ブルンガの新たな刺客が登場したチョビンにたかる。なんのために旅に出たのか。

トンカラ森にキザリという名の動物が飛んでくる。ブルンガの手下に捕まれていたキザリはチョビンたちの仲間になる。やがてチョビンがブルンガの新兵器で危機に陥るが、仲間たちの協力とキザリの勇気で一騎やっつけて、キザリと飛び立つ。

ママを探すために街へ行きたいチョビンだったが、森の友達はみんな反対する。チョビンの気持ちが伝わらず悩んだ末に、ルリはついに一緒に街へ行くことを決意する。チョビンは勇気をふりしぼり、空を飛んで出発する。

嵐の次の日の朝、チョビンたちは森で鳥の卵を見つける。嵐に巻き込まれ巣が飛ばされてしまったらしい。チョビンは新たにできた刺客との戦いの中で卵を守るチョビン。守り通した先にあった、可愛い鳥の赤ちゃんが生まれ、感動するのであった。

ブルンガの岩牢にいるチョビンのママ。極楽鳥に託されたママの歌を聴き、近くにいる事を知ったチョビンだったがブルンガ一味の罠にはまって洞窟におびき出される。敵の罠を知り、チョビンは洞窟から何とか脱出する。

森の仲間に仲間外れにされたチョビン。一方ブルンガは秘密兵器ファイヤーンを完成させ、攻撃に出る。火事になる森。仲間たちは力を合わせ助け合う。ファイヤーンを倒したチョビンは森の仲間をルリに紹介し友達になる。

クマンどんの演説で森の仲間は団結し、チョビンのママ探しを手伝う。この団結を恐れたブルンガは偽クマンどんを作って森の仲間を攻撃する。偽クマンどんを見破ったチョビンが戦いに勝ち、森の仲間は再び団結する。

ママ探しを続けるチョビン。ある日アカベエの息子ケロが付いてくる。途中ではぐれたケロは、ブルンガの手下が操るカプセルの中に閉じ込められる。ブルンガの刺客を倒したチョビンたちは、カプセルからケロを救出する。

チョビンとルリちゃんが喧嘩をする。家を飛び出したチョビンは森で1人で生活する事にする。1人ではご飯も見つけられないチョビン。ブルンガの刺客をやっつけたチョビンは反省しルリちゃんと仲直りをして家に帰る。

トンカラ森の山が爆発し、眠っていた原始怪獣親子が目を覚ます。本当は大人しい性格の原始怪獣だがブルンガに改造され凶暴になる。森は荒らされるが、チョビンの活躍で原始怪獣の性格は元に戻り、親子は山に帰る。

ブルンガの基地を探すため、手下のレーダーこうもりを尾行する事にする森の仲間たち。こうもりを追って基地を見つけるが、実はそれはブルンガの罠だった。円盤に閉じ込められるチョビン。間一髪で脱出に成功する。

トンカラ森の側に人間のダムが完成する。ブルンガはコンクリートを破壊する刺客クレバレスンを送りこみダムを破壊する。ダムの先にママがいるとかんがえたチョビンはダムの崩壊の洪水に巻き込まれるが下流で救助される。

トンカラ森の古い地図を見つけたチョビン。森の深くに入って行くが、そこは底なし沼があってとても危険だった。ブルンガはママの幻影を使ってチョビンを沼に落とし込むが、森の仲間の助けでチョビンは沼の敵を倒す。

旅を続けるタヌキの兄弟。途中でブルンガの刺客に助けられる。恩義を感じた兄はチョビンが悪者と聞いて倒そうとする。しかしチョビンが悪者でないとわかる兄。チョビンは刺客との戦いに勝ち、兄弟は旅を再開する。

星のしずくが欲しいブルンガは、熱の光線を出すコロナン円盤と、氷の光線を出すフリージング円盤を送り込む。一度は星のしずくを奪われそうになったチョビンだったが、2つの円盤を相討ちにさせて危機を乗り切る。

空からブルンガのコンテナカプセルが落ちてくる。その後をこっそり付けると、むっくり岩が動き、地下からブルンガの秘密基地が現れる。基地に潜入するチョビン。刺客を倒したチョビンは仲間と共に無事地上に戻る。

フェアリースターからショッキンというチョビンそっくりな少年がやってくる。星のしずくでフェアリースターを明るくしようとするショッキンだったが、ブルンガの手下にやられてしまう。逃げ切ったチョビンは復讐を誓う。

ブルンガの本拠地に乗り込んだチョビン。決闘の末ブルンガを打ち破り、囚われていたママとついに再会する。ロケットも見つかり、森の仲間、ルリや博士にさよならを言って、チョビンはフェアリースターに帰っていく。