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형사 중에서도 정예군단이 모이는 경시청 수사 1과, 그리고 그 안에서도 제1계의 계장으로 차기 1과 과장으로까지 촉망받던 코사카 신이치로는 수사 중의 작은 실수와 상사의 배신에 의해 엘리트 코스에서 제외, 경시청의 관할서인 시바 경찰서로 좌천된다. 때마침 시바 경찰서 관할 내에서 일본 최대 IT기업 Gone Bank 사의 사장인 나카타 카즈마사가 유괴되는 사건이 발생하며 수사본부가 꾸려지지만 관할서는 경시청의 지시만을 따르면 된다며 번번이 수사를 방해받게 되는데...

관할서의 형사로 수사1과장 오노다와 싸울 각오를 다진 코사카는 ‘곤 뱅크’ 사장 유괴 사건 뒤에 아직 뭔가가 더 있다고 생각하고 카자미 쿄코 자살에 대한 수사를 위해 자살 현장인 ‘나카타 일렉트로닉스’ 사의 빌딩을 찾는다. 그곳에서 빌딩의 방법 관리 담당자인 나호로부터 새로운 사실들을 알아가게 되는데...

코사카는 카자미 쿄코를 살해한 진범을 이케자와 나호에게서 알아내려 하지만 조사 과정에서 나호가 외부의 압력에 의해 진술을 번복하며 진상 규명에 큰 타격을 입는다. 이에 사건 해결을 위해서라면 수단을 가리지 않는 오노다 1과장은 관할서와 함께 합동 수사 본부를 설치하는데...

코사카와 야마다는 손을 잡고 카자미 쿄코 살인 사건의 주요인물인 야마모토 아리사와 접촉하려 하지만 코앞에서 기회를 놓치고 만다. 경찰 내부에 내통자가 있다는 것을 깨달은 두 사람은 이 사건의 배후에 오노다 수사 1과장이 관여해 있다는 생각을 하고 맞불 작전으로 그를 자극하며 수사망을 좁혀가는데...

코사카는 야마다와 함께 경찰 내부의 내통자를 알아내기 위해 힘쓰고 그 결과 내통자가 자신의 은사인 미카사 서장이었다는 사실을 알게 된다. 하지만 그 사실을 100% 확증할 수 있는 증거를 찾지 못해 애를 먹던 중, 미카사 서장이 서장실에 카자미 쿄코 살해에 관련된 증거품을 숨겼다는 사실을 알게 된 코사카 일행은 그가 자리를 비운 사이 서장실을 뒤지기 시작하는데...

수사 정보를 신문사에 흘린 것에 대한 처분으로 토요스 서에 이동하게 된 코사카. 그곳에서 일본 내 명문 교육기관으로 명성이 자자한 소메이 학원에 근무하던 경리과장이 실종된 건을 조사를 하던 중 그 사건이 단순한 실종 사건이 아닌, 큰 암흑이 배후에 있다는 것을 알게 된다.

카네자키 이사장과 토미나가 전무가 경영하는 소메이 학원의 부정을 폭로하기 위해 염탐 수사를 하던 전 수사2과 형사 에구치가 살해당했다. 그리고 그 현장에서 도망간 야마다가 용의자로 수사1과의 후지쿠라에게 체포되는데...

코사카는 에구치 경부를 살해한 게 소메이 학원의 토미나가 전무라 확신하지만 오노다 1과장은 토미나가 전무를 쉽게 풀어준 뒤 새로운 증거가 나왔다며 코사카 일행의 추측이 틀렸다고 질타한다. 새로운 증거를 토대로 수사를 이어가던 중 경찰 측에선 주요 용의자의 아내를 이용해 용의자와 연락을 취하려 하지만...

코사카와 토요스 서의 경찰들은 고생 끝에 전 수사 2과의 에구치 경부를 살해한 것으로 추정되는 요코자와 유이치 용의자의 신병을 확보하지만 잠시 한눈을 판 사이에 야마다와 함께 용의자가 자취를 감추고 만다. 그에 오노다 수사 1과장은 크게 격분하고 코사카는 야마다와 공범일 가능성이 있다며 자택 근신 처분까지 받고 마는데...

전 수사 2과 에구치 형사 살해 사건의 진상을 파헤치던 코사카는 사건의 열쇠를 쥐고 있는 요코자와 유이치의 신변과 소메이 학원의 비밀장부를 오노다 수사 1과장 쪽에 빼앗기고 만다. 코사카는 이 사건이 17년 전의 사건과 관계가 있다고 생각하고 오노다를 추궁하지만 17년 전 사건에서 카네자키 레이코에게 뇌물을 받은 인물들을 적어둔 장부에서 자신의 아버지의 이름을 목격하고 마는데...