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A vida de Kirsten Clark se equilibra quando a equipe Stitchers trabalha para recuperá-la no mundo real depois que ela ficou presa em um stitch tentando encontrar sua mãe. Alimentado por seu amor por Kirsten, Cameron encontra uma maneira de trazê-la de volta à realidade, mas isso pode custar-lhes o relacionamento deles. Enquanto isso, o laboratório Stitchers está bloqueado, deixando Linus incapaz de verificar a condição do seu pai após a cirurgia. Mas, à medida que a equipe se prepara para ser reatribuída após quebrar o protocolo, o diretor da NSA, Mitchell Blair, surpreende a todos exigindo um stitch de emergência que traz novas informações chocantes.

A equipe Stitchers investiga o caso de uma jovem encontrada morta na piscina do namorado rico. Enquanto isso, Linus sente uma conexão com Ivy, Cameron tem uma preocupação crescente pela vulnerabilidade emocional de Kirsten e Camille está intrigada com uma atraente médica legista (estrela convidada Anna Akana, “Miss 2059”) que gosta de se encontrar em lugares incomuns.

Um renomado advogado é assassinado e a equipe Stitchers tem uma grande quantidade de suspeitos. Enquanto isso, Linus descobre a causa dos problemas que estão acontecendo nos stitchers, o que afeta diretamente Kirsten e Cameron.

Quando um agente do MI6 é encontrado morto, Kirsten luta para entender suas memórias devido aos códigos visuais que o espião costumava usar para manter segredos. Enquanto isso, Linus e Camille vão em um encontro duplo, mas não um com o outro.

O estranho pai de Cameron, que atualmente está na prisão por crimes de colarinho branco, é acusado de assassinar um guarda prisional. Indo contra o protocolo, Kirsten investiga o caso.

Depois que um engenheiro acabar morto, seu colega e rival de trabalho se tornam suspeitos. No entanto, ao examinar alguns stitches, Kirsten e a equipe descobriram que ele fazia parte de um clube de jogos subterrâneos. A equipe corre para salvar um satélite que cai, enquanto Cameron anda no lado selvagem quando tenta se aproximar de outro suspeito.

Quando Kirsten descobre que todos no laboratório de stitch, exceto Cameron, estão perdidos, os dois pesquisam em todos os lugares, mas apenas encontram uma série de pistas misteriosas. Kirsten é forçada a enfrentar suas próprias emoções sobre seu relacionamento com Cameron.

A equipe investiga o assassinato de um ex-oficial da Força Aérea que é encontrado morto, e as pistas levam a um ex-colega de trabalho e renomado especialista em ovnis. As memórias nos stitchers levam a equipe a se perguntar se os OVNIs e os seres extraterrestres realmente existem.

Uma série de assassinatos, incluindo um jogador profissional de voleibol, levam a equipe Stitchers a procurar os cantos mais sombrios da Internet. Enquanto isso, Kirsten dá a Maggie um ultimato.

Kirsten’s father Daniel Stinger shows up and Kirsten must perform the most important stitch of her life.