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中城市博物馆争取到一件珍贵的文物来该馆展出。消息传出后，几个大盗准备联合将它盗走，尽管警方布下层层防线，但是盗贼们还是对博物馆的情况了若指掌。警官巴里与他的搭挡胡里奥对此展开了一场艰苦的调查，发现了盗贼们安插在博物馆的内线。

卡尔是一个非常有才华的生物工程学生，又是巴里的好朋友蒂娜的大学同学。最近他也来到中城市进行科研，可是自从他来之后，城里的流浪汉接连失踪，巴进而对他产生怀疑，可是蒂娜却不以为然。后来，巴里终于找到证据，原来卡尔为了自己的科研成果不惜在流浪汉身上做实验。

腐败的地方检察官卡斯特罗雇佣了一位名叫梅根·洛克哈特的私家侦探来查明闪电侠的身份，并威胁巴里为他工作，否则他会揭露他的秘密。

在中央城博物馆安排安保工作时，巴里与一位老女友和一位前导师重逢。

有人四处散布涂鸦和信息，要求在教堂与“闪电侠”见面，巴里应约去了教堂。但不久之后，他开始出现昏厥和失忆的情况。

一名银行劫匪越狱。他回到中心城取回钱财，并向逮捕他的警察亨利·艾伦（巴里的父亲）进行报复。

一名孤儿掌握的信息指出20世纪60年代的一位邪教人物正试图重出江湖。

法官福斯特和他的夫人在剧场被人谋杀，此后，司法界又有名人物被接连杀害，巴里的上司加费德也受到袭击。巴里对此事展开了调查，他发现被袭击的目标都与当年的同一件案子有关。

卢塞尔自称为城市幽灵，在1955年被称为夜影的鲍维尔医生打败后，在1990年又再次出现，这次他占据了城市的数据网络...

科学家吉顿对于政府研制的神经毒气恨之入骨，他发明了一种可以隐形的装置，闯入星星实验室盗走了毒气。他并不知道，这里面还有更大的阴谋。

胡里奥的一位爵士音乐家朋友即将被处决。行刑前一小时，一位朋友打来电话说他有证据可以证明这位朋友无罪。巴里还没来得及联系他，他就消失了。他们只有不到一小时的时间来拯救这位死刑犯。

巴里的朋友梅根遭到了一个魔术人的追杀，这个魔术狂人自称为魔术师，他自认为爱上了梅根，就想办法要把她弄到手。

巴里近一段时期，总是能梦见蒂娜向他表白她的爱慕之情，这使他经常失眠。蒂娜为他治疗失眠症，没想到仪器出了故障，蒂娜的大脑受损，使她加入了犯罪团伙。

年轻女人史黛西在街上遭人绑架，被巴里救了出来，但她对为何遭人绑架的原因却一直不肯说出口，巴里在经过一番调查之后发现，她所做的一切全都是为了她年幼的女儿莉莉。

黑帮头子派克由于涉嫌杀害巴里的哥哥而被送上法庭。可是由于证据不足，他又被当庭释放。巴里心灰意冷，不想再当闪电，准备出门旅行。派克想用一颗导弹把他炸死，没想到却把巴里送进了未来。这时候，巴里看到了派克掌权的中城。

克特的父亲曾经是一个黑帮头子，克特对他父亲的罪行深恶痛绝，于是，崇拜夜骑士的他就装成夜骑士干出一系列以消灭黑帮为目的的谋杀行动。但由于他滥杀无辜，巴里和鲍维尔决定阻止他。

炎热的夏夜，中城市四个黑帮头目被冻死在同一间屋中。巴里经过调查得知，作案者是个叫寒冷队长的职业杀手，他是准备在中城市发展的另一个黑帮头目特里的雇佣杀手。

科学狂人杰森用巴里的一滴血克隆出另一个巴里。克隆巴里和真巴里一模一样，而且也具有闪电的功能。杰森想依靠这项先进技术挣大钱，可是克隆巴里想脱离他的控制，自己来了街上...

沙姆和斯塔莎偷走了星光实验室的一块水晶和一个电池，于是围绕着这块水晶，沙姆和斯塔莎展开了一系列勾心斗角和秘密活动，为了躲避沙姆的追杀，斯塔莎找到了她的老同学巴里。

巴里的同学罗泽尔发明了一种催眠机器，于是，哈里和斯坦就利用催眠机器来做案，一个上边派来的叫杰克的警察怀疑巴里跟这件事有关，他把巴里给关了起来……

美国国家科技情报站总署研制出新一代智能机器人阿尔法。拥有了智能的阿尔法不甘受他人摆布去充当杀人的机器逃了出来。总署的人前来追赶，巴里了解了真情后，和蒂娜一起千方百计对阿尔法进行保护。最后，他们的勇敢和智慧终于战胜了科技情报总署。

在对魔术师进行审判的时候，一个名叫佐伊的女疯子，把他给救了出来，在他们抓住巴里之后，魔术师给巴里进行了洗脑。于是，魔术师利用巴里对这个城市进行了疯狂的报复。