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以武士道为目标，在丛林中与父亲铁剑十郎一起修行剑术的铁刃。某天，他回到日本，开始在父亲十郎的对手峰雷藏及其女儿纱也加家中寄宿。然后，铁刃遇到了后来的宿敌·鬼丸猛。

与鬼丸的比赛以平局告终的铁刃，燃烧着打倒鬼丸的斗志开始了特训。然后，经过艰苦努力，铁刃领悟了心眼。鬼丸对铁刃的心眼束手无策，懊悔不已，在道场大闹……。

被沉睡在地下室的风神剑魔力所迷，鬼丸化身为恶的化身。被逼入绝境的铁刃听说有能对抗风神剑的雷神剑，便前往守护了这把剑400年的怪老人·宫本武藏所在的天狗岳。

鬼丸带着用风神魔力创造出的手下·八鬼，占领了国会议事堂。并将其变成了鬼丸城。然后，作为刺客被派往铁刃那里的蛙男绑架了纱也加。

铁刃等人和被俘虏的蛙男·凯罗左卫门一起待在山间小屋里。这时，一位身穿和服的美女来访。凯罗左卫门对她表现出异常的恐惧。那位美女的真实身份，是鬼丸的刺客之一·蛇女。

在山里求宿的一夜，铁刃等人遭到农民的袭击。原来武藏长期假扮天狗糟蹋田地作物的事暴露了。拼命逃跑的铁刃等人面前，出现了鬼丸的手下·蛞蝓男。

蜘蛛男盯上了铁刃等人总是肚子饿这一点。他用堆积如山的料理引诱铁刃等人，但自己怕大声音的弱点暴露，乘飞艇逃走。铁刃不让它得逞，也登上了飞艇……。

黄昏时分，铁刃等人面前突然出现新的敌人·蝙蝠男。虽然是个爱卖弄英语的装模作样的敌人，但很强，铁刃一不小心就被咬了。于是暂时休战期间，看到满月的铁刃变成了狼人。

得知手下再次失败的鬼丸，派出了海星男、螳螂男、海参男。另一方面，在街上，在蜘蛛男的授意下，鬼丸馒头大流行。吃了它的人就会变成鬼丸的手下，是个可怕的馒头。

前往东京途中，铁刃等人决定顺路去一座小岛。那是为了扫墓武藏曾经的宿敌·佐佐木小次郎。另一边，因手下太弱而愤怒的鬼丸，企图复活小次郎并使其成为手下。

虽然拒绝了成为鬼丸手下，但被蜘蛛男灌输“真正的对手是铁刃”后，小次郎斗志昂扬。收到小次郎挑战书的铁刃，在决斗场上被破了旋风剑。

将玉嵌在剑上，铁刃内心开始了与雷神的纠葛。虽然放电，但不久后恢复理智的铁刃，打败了雷神。虽然还不能自如地操纵剑，但向小次郎挥去的剑上释放出了雷电。

铁刃等人带着秘技·雷神斩，攻入鬼丸城。鬼丸也为了迎击铁刃，复活了四天王。与鬼丸在城内对峙的短暂片刻后，一行人掉入陷阱，落入了地下。

为了打倒新的鬼丸手下，在城内前进的铁刃等人来到了一片森林。在那里，四天王之一的变色龙·波拿巴特正等待着他们。面对拥有长舌、能与周围同化消失的强敌，铁刃等人陷入苦战。

铁刃等人面前出现了新的敌人——超级大猩猩·ブイブイ。虽然身体只有玩具小猴大小，但实力堪比超人。一察觉到己方处于劣势，小次郎就倒戈，把剑指向了铁刃。

下一个敌人是蜘蛛男操纵的巨大龟型机器人——蜘蛛龟蟒。它试图用强大的力量压扁铁刃，但被雷神剑弹开。然而，蜘蛛男用多样的动作玩弄铁刃。

在城楼上，铁刃终于与宿敌鬼丸猛正面对峙。但鬼丸试图拉拢铁刃走上邪道，提出两人联手统治世界。铁刃拒绝了鬼丸的邀请，两人的战斗拉开了帷幕。

铁刃等人出发寻找据说能让人飞行的龙神之玉。途中，在森林深处遇到的巨大猫头鹰似乎知道那颗玉的下落。另一边，鬼丸为了夺取雷神剑，复活了新的敌人。

借助在与三好清海的战斗中到手的水神珠的力量，铁刃等人渡海来到四国。在那里遇到的老奶奶告诉他们，金长狸猫封印了传说之玉。于是，铁刃一行人朝着老奶奶指示的山中洞穴前进。

铁刃等人为了寻找龙神珠，一路前往九州。但街道已被鬼丸征服日本的手下控制。然后，在蜘蛛男的花言巧语下被拖住脚步的温泉旅馆里，铁刃等人听说传说之玉隐藏在阿苏山。

前往阿苏山火山口的一行人面前出现了一家茶馆。迎接他们的，是辞去了鬼丸手下工作的海星男和他的妻子美穗林。听说铁刃在寻找红龙之玉，他主动提出担任向导。

前往下一个目的地奈良的一行人面前，出现了一个自称六卫门的男人。他们决定暂时与他同行，让他加入队伍。然后到了夜晚，大家都安静下来后，他试图偷走传说之珠的地图……。

铁刃等人乘着被僧正的咒文驱动的大佛额头，前往五右卫门等待的大阪鬼丸城。另一边，大阪鬼丸城也变成巨大的机器人应战。在此之中，铁刃与五右卫门的战斗也拉开了帷幕。

在某座城镇，出现了一个神秘的武士。那个打败小次郎后正要离开的武士，铁刃向他发起了挑战。正要使出雷神斩时，摆出二刀流架势的男人，正是武藏曾经的弟子·柳生十兵卫。

明明即将迎来川中岛的决战，武藏不知为何却开始宴会。但十兵卫在酒席上也毫不失态。于是强行让他喝酒，结果出现了喝醉变成狼的十兵卫。

变身为巨大熊的五右卫门用特大手裏剑压制铁刃。但势头过猛打晕了纱也加。愤怒的铁刃跳上旋转的手裏剑，从极近距离喷出火焰，让五右卫门升天。

铁刃与十兵卫一起被吸入了暗之玉中。然后，在凯罗吉告诉他的玉的出口处，遇到了巨型河童·凯罗介。他试图击碎河童的弱点——头上的盘子，但完全不是对手，陷入苦战。

铁刃创出新必杀剑·风车，向巨型河童发起挑战。然后漂亮地击败敌人，向出口走去。另一方面，在弹壳外，瞄准传说之珠的弁庆向纱也加袭来。千钧一发之际，铁刃冲了出来……。

铁刃注入力量后，剑尖刮起了猛烈的暴风雪。那颗珠子是冰之玉。集齐六颗传说之珠的铁刃等人，为了寻找第七颗龙神珠而到达东北。那里出现了一个老人……。

被鬼丸复活的芭蕉企图集齐七颗传说之珠夺取天下。伙伴们被变成猴子的芭蕉吹箭射中，接连变成石头。剩下的铁刃独自战斗，但脚终于也被刺中……。

终于到手的第七颗传说之珠。铁刃将玉嵌在剑上注入力量，玉突然说起话来。据玉说，龙神珠在富士山，要得到它需要至今从日本各地收集来的七颗宝珠。

铁刃等人被中奖珠引导，来到龙神珠沉眠的富士山。在那里，宿敌鬼丸猛完成了必杀剑·龙卷斩，正等着他们。轻松避开铁刃攻击的鬼丸，夺走了雷神珠。

为了寻找沉睡在富士山地下深处的龙神珠，铁刃等人突入地下。然而，涌来的岩浆吞没了没能及时逃走的庄之介。失去同伴的打击让铁刃暴怒……。

铁刃等人挑战龙神的第三个试炼·智慧回廊。但前方全是死胡同，完全迷了路。还设有很多危险的陷阱，完全无法前进。此时，铁刃想起了龙神的话。

在孤身一人留下的铁刃面前，龙神终于现身，说出了最后的试炼。那便是决定是按照愿望获得龙神珠，还是拯救至今失去的伙伴们的“心灵歧路”。

铁刃面前出现了新的敌人。那是憎恨龙神、为征服地球而从月球前来侵略的辉夜姬。于是，铁刃与辉夜姬的壮烈战斗开始了，但此时辉夜姬身上突然发生异变。

在富士山，辉夜姬与鬼丸展开壮烈战斗。鬼丸打算连续战斗24小时，不给辉夜姬提取精华的机会。另一边，不知此事的铁刃正在修炼熟练使用龙神剑。

辉夜姬企图洗脑鬼丸使其成为手下，想带走被碳冻结的鬼丸，但被铁刃夺回。在母船上吸收精华恢复原形的辉夜姬，为了再次引诱铁刃出来，向手下满月下达指示。

铁刃在与龙虾合体的满月面前陷入苦战，但用炎之玉直接击中，将满月分离。恢复原形的满月为了封印铁刃的炎之玉，这次又与煤气罐合体。

击败满月后，铁刃等人在纱也加家举行庆功宴。大家热烈谈论着与鬼丸的相遇、得到雷神剑乃至龙神剑的艰辛历程。并且，他们对与辉夜姬等月星人之间刚刚开始的战斗燃起了斗志。

铁刃等人乘坐金棒博士制造的潜水艇潜入辉夜姬的母船，试图救出女孩子们。此时，在辉夜姬的母船上，败给铁刃的满月被辉夜姬消灭，新的刺客接到了命令。

纱也加等人顺利来到了女孩子们所在的地方。大家都扮成兔子想从辉夜姬的母船逃出，却被辉夜姬等人包围。另一边，铁刃在苦战后击败了满月和新月。

吃饭时间，十兵卫兔偷偷在锅里放了药。但被影虎发现，暴露了真身。铁刃等人得知纱也加被掳走，惊愕不已，也不知该如何处置十兵卫兔。

1000年前，辉夜姬与龙之巫女合体，被龙神变成了无法分离的身体。能够恢复原本蕴藏巨大力量的身体的，只有龙之巫女的后裔。那就是纱也加。辉夜姬无论如何都想得到纱也加的精华。

铁刃用金玉变成纱也加的样子，漂亮地骗过了月牙。败北的月牙解开了魔王剑的封印，这把剑拥有曾将月球变成死亡之星的巨大力量。辉夜姬禁止月牙使用魔王剑……。

铁刃正面承受了半月剑的能量球，被打得破破烂烂。月牙想把纱也加带到辉夜姬那里。铁刃拼命阻止，月牙向他发出了致命一击。

成功复活的鬼丸一看到铁刃就发起攻击，但铁刃劝说一起战斗而不反击。正好这时，得到魔王剑的月牙开始破坏街道。见此情景，鬼丸决定与铁刃联手。

铁刃和鬼丸好不容易躲开了半月剑。但在魔王剑面前，两人的剑完全不是对手。此时，金棒博士带着秘密武器“风雷火箭炮”现身，据说装上雷神珠和风神珠就能使用。

辉夜姬吸干了纱也加的精华，使其变成了老奶奶。愤怒的铁刃立刻前去攻击辉夜姬。他再次与鬼丸联手释放风雷破，但对化为巨大怪物的辉夜姬无效……。

雷神剑被辉夜姬吞下，铁刃束手无策。然而，铁刃手中还留有龙神珠。从这颗龙神珠中，初代龙神的亡灵浮现，留下遗言：“没有龙神珠就无法打倒辉夜姬。”

与从剑中飞出的白龙合为一体的铁刃，其力量与辉夜姬不相上下。然而，辉夜姬通过积蓄能量使力量进一步增强，超越了白龙铁刃。鬼丸将魔王珠投向辉夜姬……。

铁刃的反击也徒劳无功，与地球合体的辉夜姬一度将陆地沉入海中，试图杀死所有地球人。在此之中，白龙铁刃面前出现了初代龙神，开始讲述龙神剑的真正力量。