所有分集

开发入道沼的工人们一个不剩地消失了。是因住处被工程破坏而愤怒的仰望入道所为。仰望入道连目击事件的小学生村上祐子也掳走了。祐子的同班同学通过妖怪信箱向鬼太郎求助。感到再次开工的工地现场有妖气的鬼太郎，与仰望入道对决。然而巨大化的仰望入道，连鬼太郎也轻易吸了进去。

看家姐弟的卧室里出现了大量眼球。是附在家中的妖怪·目目连。赶来的鬼太郎也遭袭击，但与姐弟合作用烟熏攻击击退。目目连出现在人烟之地的原因是，姐弟的父亲进入了目目连的住处木连里，建造了别墅。来到街上的目目连，因都市的污浊空气失去理智更加狂暴。接着附身卡车，开始朝小学暴走！

鼠男被抬进了医院。治疗无效，被夺走灵魂的鼠男死去了。那时，同样被夺走灵魂的孩子们也陆续被抬进医院。得知事件原因是夜叉后，鬼太郎前往灵魂被夺的孩子们倒下的公园。追踪妖气，目击了鼠男的灵魂从地下飞出。虽然将夜叉逼进地铁站内，但被吉他的音色催眠。

祐子的同班同学翔太失踪了。其他孩子也接连失踪。眼球老爹看破是住在镜中的妖怪·镜爷爷所为。鬼太郎找到了镜爷爷的所在，反被镜爷爷关进了镜之国。镜爷爷在镜之国是无敌的。苦战的鬼太郎，被关的镜子被清洁业者运走，最终掉在地上摔碎了。再也无法出去的镜爷爷，企图吸取鬼太郎的灵魂……

鼠男开张的宝石店生意兴隆。追查神秘失踪事件的鬼太郎，怀疑鼠男可疑。追踪举动可疑的鼠男，鬼太郎到达了废墟。鼠男和能将人类欲望变成钻石的妖怪·轮入道联手。不使用镜子就不可能战胜轮入道。但轮入道破坏了废墟里所有的镜子。面对轮入道的强大力量，鬼太郎逐渐被逼入绝境。

独断专行的社长在牛鬼岩钓鱼，唤醒了可怕的牛鬼。鬼太郎好不容易将其退治，但牛鬼附身于鬼太郎，将鬼太郎自身变成拥有无敌力量的牛鬼而复活。为争取让岛民避难的时间，眼球老爹挡在牛鬼面前。无法反击的眼球老爹，锐利的爪子迫近……千钧一发之际，鬼太郎的心在牛鬼体内苏醒，传说中的守护神迦楼罗大人仿佛回应他的祈祷般现身。

镇上的人类接连被偷走脸。是在无面妖的荞麦面店被吃掉了脸。鬼太郎来到有问题的荞麦面店，长着鼠男脸的主人突然袭击鬼太郎。主人熟练操控厨房工具，避开鬼太郎的攻击。他的真身是画着鼠男脸的无面妖。鬼太郎追踪无面妖前往工地现场，那里却设有陷阱。

河童渊的河童们开始袭击人类。似乎是淋了奇妙的白色泡沫后凶暴化了。受担心的子河童们所托，鬼太郎前往河童渊。被拖入海底的鬼太郎，遇到了喷出问题白色泡沫的妖怪·蟹坊主。蟹坊主操纵河童们，企图向破坏住处的人类复仇。面对存活了2000年的蟹坊主的妖力，连鬼太郎也陷入大危机。

西洋吸血鬼·皮将鼠男和死胡同村的村民变成了吸血鬼。他打算以这个小村为据点，最终让全日本充满吸血鬼。察觉异变的鬼太郎到来，却遭到变成吸血鬼的鼠男袭击。虽然勉强击退，但被皮欺骗最终还是变成了吸血鬼。接着，载着恶魔化的鬼太郎和村民们的列车，向邻镇驶去……

开始做房地产生意的鼠男，为如何处理会出现竹人的鬼屋而困扰。他拜托鬼太郎和客人一起去调查，却遭到袭击变成了竹人。另一方面，在宅邸内调查的鬼太郎，发现了少女手绘的奇妙图画。根据画中的提示，发现了地下蔓延的万年竹的住处。鬼太郎得知了万年竹愤怒的悲哀理由。

因恶德大臣和社长的阴谋，神圣的灵山建起了高速公路。不知是否是愤怒灵山的作祟，发生了巨大骷髅袭击经由高速公路涌来的人类的案件。鬼太郎看出是咔嚓骷髅所为尝试说服，但失败被擒。被带到森林深处的鬼太郎，被动物们和妖怪·毛羽毛现包围。这时鼠男出现，开始讲述毛羽毛现愤怒的理由。

祐子的朋友次郎被猫袭击后失踪。赶到的鬼太郎目击了惊人的景象。城镇被弃猫支配，宠物店里卖的不是动物而是人类。那家宠物店的主人自称“大黑猫”，向鬼太郎诉说人类是如何残忍对待猫的。接着由猫进行的审判开始，次郎因遗弃猫的罪行将被审判。

鼠男企图利用鬼太郎他们大赚一笔。鬼太郎为了抱怨而前往妖怪宅邸，那里不信妖怪的人类正在大闹。对他们的傲慢态度忍无可忍的鬼太郎，召集伙伴妖怪，让他们从心底感到恐惧后赶了出去。但只有太郎少年，无论怎么吓唬都面不改色。太郎的父亲向鬼太郎讲述了儿子失去感情的原因。

连续加班疲惫不堪的健吾父亲面前，出现了一位神秘老人，将他带去了蓬莱岛。担心父亲失踪的健吾找鬼太郎商量。鬼太郎从蟹坊主那里听说了蓬莱岛的事，决定带健吾去看看。一行人在奇妙的雾中发现了蓬莱岛，却被自称徐福的老人关入壶中。另一方面，抢先登陆的鼠男发现了闪闪发光的石头，企图私吞……

祐子的朋友祥一消失了。确信是妖怪·枕返所为的鬼太郎，前往枕返的住处梦之世界。然而遭到反击陷入绝境。眼球老爹让鼠男投掷岩盐渡过危机，救出祥一从梦之世界逃脱。预感反击的眼球老爹，用带回来的枕返手臂作诱饵，制定了一个作战计划。

鼠男肮脏不堪的家里，住进了妖怪·垢尝和白涡。鼠男非但不害怕，反而企图利用二人做生意赚大钱。这缺德买卖很快被鬼太郎知晓，无奈将白涡放入河中流走，也与垢尝分别。然而，因河水污染导致白涡巨大化，开始在镇上四处散布污秽。鼠男想在鬼太郎退治他之前尝试说服，但……

酷似鬼太郎的冒牌货开始在沿海村庄贩卖人鱼的孩子。为抓住冒牌货前往天狗岩的鬼太郎，救助了受伤的人鱼孩子。人鱼孩子请求鬼太郎救出被妖怪·蝶妖鬼囚禁的同伴。鬼太郎答应请求前往蝶妖鬼的藏身处，却被突然卷起的大漩涡吞没。醒来时身体无法动弹，冒牌鬼太郎正站在旁边。

鼠男带着一反木绵去了南方岛屿寻宝。担心的猫娘找鬼太郎商量。据说那片海域会出现化鲸。鬼太郎和猫娘随后追赶。那时，潜入寻宝旅行船的鼠男到达了遇难船。那里是化鲸守护的鲸鱼墓场。现身后狂暴的化鲸，似乎是对人类随意投弃废弃物感到愤怒……

祐子的朋友晴美找鬼太郎商量。说最近父亲变得非常没有精神。鬼太郎跟踪一看，晴美的父亲正在童年回忆的世界里玩耍。那里正是黄泉世界。眼见着没有精神，是因为吃了黄泉世界的食物导致灵魂消瘦。不救出来的话，最终会死去。然而在鬼太郎眼前，晴美的父亲被某人掳走了。

为查明潜水员频繁遇难事件的真相，鬼太郎他们前往绝海的孤岛。然而，突然发生的大海啸将他们吞噬，以凄惨的状态被冲上岛。重整心情开始冒险，但岛屿本身仿佛有意识般将鬼太郎吸入洞窟。另一方面，在洞窟中与潜水员们重逢的鼠男，直觉有宝藏而向更深处前进……

鼠男在兜售可疑的白粉。因使用该白粉的人类脸孔消失，鬼太郎怀疑是无面妖。但货物的出处并非无面妖。连砂婆婆她们的脸也被夺走后，无面妖感到责任协助寻找犯人。从好不容易抓住的鼠男的话中，查明妖怪·白粉婆是黑幕。鬼太郎制定作战计划，利用自己的脸找出白粉婆的所在。

来乡下爷爷家玩的直也，和在田里遇到的泥田坊的孩子成了朋友。然而，因开发导致作为住处的田地被削去，泥田坊的父母非常愤怒。他终于忍无可忍，开始袭击人类。鬼太郎试图说服也不听，当人们用消防车喷水想溶化他时，他因含水变得更加巨大。直也和泥田坊的孩子两人，试图设法阻止暴行。

风吹岭频繁发生司机失踪事件。父亲失踪的晴夫向鬼太郎求助。询问派出所警察后，鬼太郎得知自从岭上通了公路就开始发生事件。鬼太郎他们和其他司机一样开车前往风吹岭，突然遭到狂风袭击。是降雨天狗掀起风，吹飞经过山岭的汽车。鬼太郎发射遥控木屐击退降雨天狗，但……

饥饿的鼠男倒在地上，被一位叫小百合的亲切女性救起。据说独自守护着破败寺庙的小百合，向鼠男求婚希望他成为寺庙继承人。鼠男欣喜接受，享受着幸福的新婚生活。鬼太郎他们也赶来祝贺婚礼，但鼠男从附近村庄的居民那里得知了难以置信的事实。小百合是早已离世的死者……

某町频繁发生汽车事故，即使采取措施也毫无效果而困扰。直觉是妖怪所为的鼠男，企图赚钱而巴结市长。但他也遭遇了事故。是妖怪·胧车所为。听闻消息来到町上的鬼太郎，追踪暴走的胧车，却在山中跟丢了。那时，决定拆除的民族博物馆里，发现展示的牛车不知为何沾满了泥。

鼠男为自己的生日庆祝，邀请鬼太郎和猫娘去轻石泽的高级别墅区。以为能难得放松一下，别墅却被警察包围。被带走的鬼太郎他们被怀疑绑架了住在别墅的千金百合香。审讯开始，但过程中妖怪·天邪鬼突然闯入带走了鬼太郎他们。被扔进洞窟的鬼太郎，发现了被囚禁在那里的百合香。绑架她的是天邪鬼，似乎打算迟早吃掉她！

祐子的朋友淳不擅长整理。某日他发现了一个奇妙的洞。碰巧来到那里的鼠男得知那洞能吸入任何东西，开始利用洞口收大件垃圾的生意并大受欢迎。但淳开始担心进去的东西会怎样。他的不安应验了，洞里出现巨大的妖怪，开始随意吸入周围的东西。奇妙的洞正是封印了妖怪·野槌的野槌冢。

因工作疲惫的工薪族跟踪公园的野猫后失踪。担心的家人找鼠男商量，鬼太郎决定出动寻找去向。鬼太郎他们如同消失的男子一样跟踪猫，不知不觉来到了一个奇妙的城镇。那是猫居住的猫町。一进城镇，鬼太郎和鼠男就变成了猫的样子。另一方面，得知鬼太郎进入猫町的猫娘……

海水浴场出现巨大的眼球，人们陷入恐慌。企图大赚一笔的鼠男从大太神社偷出封印钥匙，复活了大太法师。鼻子、嘴巴、头部，大太法师的部件接连出现。鬼太郎试图阻止鼠男，但徒劳无功，大太法师复活了。苏醒的大太法师开始吞食日本的国土。纷争不断的日本正是大太法师最爱吃的食物！

鬼太郎在旧书店店员花子周围，感受到奇异的花之影像。拜访她的房间，那里盛开着南国的花朵。与花子同住的祖母在三年前突然失踪。鬼太郎通过妖怪新闻收集全日本妖怪的信息，寻找花子祖母的下落。线索留在了某古董商那里。花子祖母珍藏的信匣被拿出来卖，里面装有和年轻时的祖父拍的照片。

鼠男在煤矿遗址遇到了妖怪·伞妖。鼠男扮成仙人欺骗单纯的伞妖，唆使他变成人类就能成为富翁获得幸福。并撒谎说为此需要鬼太郎的背心，让伞妖袭击鬼太郎。鬼太郎苦战于伞妖的攻击。鼠男趁机如计划偷走了背心。然后将伞妖变成死去的富翁男子，送进他生前居住的宅邸。

利用积雨云进行化学实验时，直升机坠落。乘坐的科学家们失踪了。日本各地接连发生雷击事故，受害者都像科学家们一样消失。着手调查的鬼太郎查明事件背后有电气妖怪·雷神作祟。追踪雷神操纵的巨大积雨云，鬼太郎发现了浮在空中的巨大岩石，得知失踪的人们被囚禁在那里。

鼠男让落魄歌手忧歌团听了皿小僧的歌《ぺったらぺたらこ》。鼠男把乐谱交给他们，劝他们唱这首歌。目的当然是通过歌曲走红来大赚一笔。鼠男再三嘱咐绝对不要唱第四段。《ぺったらぺたらこ》如预想般大热。然而，得知自己的歌被擅自演唱的皿小僧愤怒地绑架了忧歌团。

因深山里居住的人减少而孤立的小豆洗，向妖怪信箱求助。鼠男将小豆洗作为淘洗小豆的工匠介绍给和果子店。因有妖怪工作，和果子店生意兴隆。听闻评价的妖怪·小豆秤也来了。得益于搭档的妖怪工匠，店铺大受欢迎，甚至引来电视台采访。但因游客增加过多，妖怪搭档开始和店里的人吵架……

鬼太郎他们正在拉面店吃饭时，被通缉的暴力拆迁户大黑和手下闯入。大黑毫不在意地开枪射向正要离去的鬼太郎。鬼太郎从店里逃出，眼前突然出现巨大的钻石被吸了进去。大黑在钻石内的世界里滚动土地大发横财。然而，那里是鬼太郎准备好的地狱。鬼太郎给大黑他们最后的机会：若舍弃恶心，就放他们回外面的世界。

列举鼠男恶行的信被寄到了妖怪信箱。鬼太郎追问，鼠男却一味装糊涂。结果，恶行的真凶另有其人，但那男子一见到鼠男就抓着手哭起来，说是失散多年的弟弟。初次拥有亲人的鼠男大喜，让男子住进了砂婆婆建造的妖怪公寓。然而自此之后，公寓的住客接连神秘失踪。

因过劳死去的丸田在彼世后悔没能履行带儿子去兜风的约定。遇到夜行先生的他，借来妖怪汽车想实现约定。与夜行先生的契约有两条：在天亮前归还妖怪汽车，以及绝对不能拔出钥匙。若无法履行约定，重要的儿子就会被带走。丸田发誓一定遵守契约，但兜风途中遇到了鼠男。

孩子们接连失踪。嗅到赚钱气味的鼠男拜访孩子们的家，却被鬼太郎他们发现并教训了一顿。这时一架载着孩子的模型飞机飞来。吃惊的鬼太郎乘上一反木绵追赶。那时，猫娘和砂婆婆对送来的模型飞机感到疑惑。试着玩闹坐上去，那飞机竟飞上了天。降落地点是弥漫妖气的研究所。

食品公司社长桥本后悔16年前与白山坊定下的约定。他曾发誓将当时刚出生的茜在16年后交给白山坊。白山坊如约前来带走茜，但因茜受发饰保护无法下手。于是命令弟子金太去夺发饰。金太得知白山坊想吃掉茜，决心阻止。但白山坊转而向金太露出獠牙……

喜欢妖怪但不擅长运动的正光，拜托降雨小僧让小学运动会因雨取消。回去路上在墓地，正光目击了妖怪运动会的练习。次日，正光邀请不信妖怪存在的朋友去观看妖怪运动会。会场聚集了以鬼太郎为首的妖怪们，正享受一年一度的大型活动。然而此时，降雨小僧开始降雨。并要作为降雨的代价，夺走正光的灵魂。

鼠男开始了新买卖。打算贩卖妖怪ほうこう制作的腌菜来赚钱。据ほうこう说，要让腌菜更美味需要从鬼太郎身上榨取的妖怪精华。被鼠男诱骗来到腌菜店的鬼太郎，遭到ほうこう袭击被做成了腌菜。赶来救助的子泣爷爷也被变成了腌菜石。受眼球老爹求助的砂婆婆将ほうこう封入壶中，但……

鼠男在经商旅途中，遇到了妖怪·岩木小僧。尊敬鼠男的岩木小僧为款待他，邀请至河童村。但一进村，就遭到河童们袭击。原来村子正被叫一目入道的粗暴妖怪盯上，处于警戒状态。重情义的岩木小僧主动提出为村子退治一目入道。鼠男给鬼太郎送去求救信，但一目入道先发制人袭击了鬼太郎。

信也少年的祖父去世，举行了葬礼。当晚，去世的祖父出现在信也枕边，嘱咐要将祖传的草鞋供于墓前。信也依言急忙赶往存放古草鞋的土仓。然而古董已全被鼠男回收变卖。不值钱的破烂似乎被扔在了垃圾场。包含在破烂中的古草鞋变成了化草鞋，开始向人类复仇。

西洋恶魔贝利亚尔。他在140年前随黑船来到日本时，被乌鸦天狗封印了妖力。鼠男误将从乌鸦天狗那里偷来的地图当作藏宝图，打碎了封印贝利亚尔力量的宝玉。取回魔力的贝利亚尔，开始为向乌鸦天狗复仇和征服日本的野心行动。他先将乌鸦天狗关入魔法阵，然后变成巨大龙卷风袭击砂婆婆的妖怪公寓！

明明亲生母亲去世，却以工作忙为由连守夜都不参加的三兄弟。他们接连被某人掳走的事件发生。是名叫火车的妖怪，想将不孝的三兄弟与母亲的灵魂一起做成饼吃掉。火车想在自己腹中让兄弟三人聆听母亲的怨恨之声。鬼太郎受那位母亲的孙女法子所托，正在寻找火车的下落。就在火车要捣饼时，鬼太郎现身阻止。

阎魔大王厅严密封藏的地狱绘卷被公之于众。据说公开有鬼太郎协助。逮捕令立刻发出，鬼太郎被天狗警察们带往妖怪法庭。大天狗审判长主持的审判开始。鬼太郎一方的证人无一出庭，而鬼太郎至今退治过的妖怪们则作为检方证人陆续到来。自然都是不利证言，鬼太郎转眼间被判有罪。

眼球老爹被天狗警察扣作人质，鬼太郎为证明自己的清白开始寻找真凶。在猫娘和砂婆婆的帮助下，鬼太郎查明一系列犯罪是受百百爷爷委托的鼠男所为。鼠男向百百爷爷索要报酬，反遭灭口。其实事件背后还有更强大的妖怪存在。代替爱子走上处刑台的眼球老爹。死刑执行的时刻正一刻刻逼近！

猫娘为救小猫冲上马路。开车的里子为避让引发事故受伤住院。猫娘每日都去探望，不知不觉与里子成了好友。里子有个叫玛莉的不良少女女儿。即使被猫娘劝说，玛莉也绝不去探望母亲。其实玛莉患有严重的心脏病。猫娘为救母女二人，抱着必死的决心前往阎魔大王处。

凉子转学到了祐子的班级。凉子以前在北方生活时，与水之精·赤舌成了朋友。某日，凉子被卷入银行抢劫事件成了人质。沉睡中的赤舌感知到朋友的危机而苏醒，一边破坏城镇一边向东京移动。鬼太郎拼命试图阻止，但怒气未消的赤舌将险些从大楼坠落受惊的凉子吞下，消失在地底。

圣诞期间东京都内接连发生纵火事件。鬼太郎感觉是妖怪所为开始调查。那时，正在街头售卖圣诞蜡烛的鼠男面前出现了一位和服美女。神秘美女以约会为条件，买下了鼠男所有的蜡烛。鼠男依言点燃蜡烛。但神秘美女立刻吹熄火焰，并开始企图吹灭游乐园里的各种灯火。

鬼太郎他们受邀参加在狐山举行的狐狸幻灯会。三只小狐狸也该来，却迟迟不现身。原来它们捉弄了冬眠中的一本踏鞴，反遭袭击。逃跑的小狐狸们变成路边的地藏，想躲过一本踏鞴的追踪。然而跑累了的一本踏鞴，竟在小狐狸地藏面前打起瞌睡。鬼太郎也没发现地藏的真身，路过的老爷爷还给它们戴上了防雪斗笠。

鼠男免费向孩子们分发陀螺。然而，孩子们却把好不容易得到的陀螺扔掉了。当夜，被丢弃的陀螺从孩子们的耳朵进入体内，被陀螺操控的孩子们离家出走。听闻事件的鬼太郎从祐子持有的妖怪陀螺，看破事件背后是妖怪·尼彦在作祟。尼彦为雪被丢弃陀螺之恨，在沉睡500年后复活了。

妖怪贴纸大卖、手头宽裕的鼠男，难得请鬼太郎吃了晚饭。回去路上，醉汉嘲笑妖怪。鬼太郎警告不信妖怪的醉汉，却被殴打起了包。于是决定施以同等报复。到达车站的醉汉们，尽管末班车已过仍被要求买票，等待临时列车。那列车正是由鬼太郎担任车长的可怕幽灵电车。

鬼太郎收到少年求助信，说村子被妖怪蛤蟆袭击。妖怪蛤蟆出现在到访村子的鬼太郎面前，承诺只要移开祠堂的岩石就停止作乱。然而刚移开岩石，蛤蟆就变成了可怕的妖怪·邪魅，而鬼太郎则变成了蛤蟆的样子。一系列事件是邪魅为解除自己封印的计谋。眼球老爹代替鬼太郎，想让他恢复原样，但……

因人类害怕，座敷童子一直独自住在宽敞的宅邸里。开始做房地产生意的鼠男擅自将房子出租，一个不工作沉迷赌博的男人成了房主。即便如此座敷童子也开始为一家人工作，并与女儿萤成了朋友。但是，终于身无分文的主人将“幸福仙人掌”带进了宅邸。那仙人掌是被妖怪·后神操控、吞噬人类灵魂的植物。

昇少年等人在洞穴深处发现了奇妙的壶并打开壶盖。壶中出现的是妖怪·水虎。虽然鬼太郎一度将其击退，但水虎引发雪崩开始追赶昇。水虎的目标是昇持有的卷轴。卷轴上记载着封印在水坝里的壶的所在地。壶里似乎封印着水虎的妻子。水虎为了在复活自己之后也让妻子复活，奔向水坝。

接连发生精英美女失踪事件。鬼太郎受委托保护美女研究员绫子。那时，鼠男被擅长催眠吉他的吸血鬼精英接近。吸血鬼精英利用鼠男，成功诱拐了绫子。追踪的鬼太郎发现了深山的藏身处并闯入。然而吸血鬼精英已利用鬼太郎的头发，准备了针对鬼太郎的催眠曲等候着。

鼠男偷看了妖怪信箱里寄来的信，冒充鬼太郎去了北海道的雪山。那里正多发由冷冻妖怪·雪童子造成的失踪事件。鼠男为赚钱去抓雪童子，反被冻成冰块。随后到达的鬼太郎，在追踪半夜叫卖冰棍的声音时，也被雪男和雪女伏击冻住。冷冻妖怪们是在向在山中杀害动物的人类复仇。

妖怪·欧巴里永出现在真奈美面前招手示意。似乎有什么想告诉她。此事传到母亲耳中，真奈美被严厉斥责不得与妖怪扯上关系。真奈美的母亲坚信自己的妹妹是因妖怪而死。担心的朋友向妖怪信箱投信，鬼太郎便来到真奈美处。但真奈美的母亲想赶走鬼太郎。此时欧巴里永再次出现，向真奈美招手。

半鱼人袭击了正在调查海难事故的鬼太郎，将其沉入海底。这是涂壁的指使，想让妖怪乌贼吃掉鬼太郎，得到妖怪珍珠。妖怪珍珠是为妖怪灯塔点火所必需之物。涂壁计划用妖怪灯塔支配全世界的妖怪。眼球老爹为救鬼太郎，对涂壁进行伏击。但鼠男背叛，反而抓住了眼球老爹。

妖怪厌恶出现在镇上，收集人们的“笑气”。他想在体内积蓄笑气，成为落语的真打。被厌恶吸走笑气的人，一律变得性格凶暴。鬼太郎赶往厌恶出演的演艺场，却反被击败吸走了笑气。性格大变的鬼太郎宣称不再帮助人类。眼球老爹为让鬼太郎恢复原样，带他前往金比罗岛的净化之泉。

鼠男乘坐的出租车撞上了一只野猫。然而，那辆出租车被一辆诡异的卡车追尾。鼠男患上了一种叫“猫击症”的怪病。猫击症患者与日俱增。生病的都是汽车驾驶员。鬼太郎为查明诡异卡车的真面目，向夜行先生借了轮入道的妖怪汽车。开始调查后，目标卡车果然出现了。

冲绳的酒店向鬼太郎发来了求助信。似乎因为妖怪出现，客人减少困扰不已。妖怪们好像住在13楼。酒店经理金城反对驱赶，认为即使是妖怪也是客人。其实是因为开发被赶出森林的シーサー和キジムナー等冲绳妖怪逃进了酒店。鬼太郎与金城经理合作，开始执行某项计划。

富士山麓回响着爆音。集结世界各国妖怪举行的妖怪拉力赛即将开始。优胜奖品是传说中能实现任何愿望的妖怪石。鬼太郎担心妖怪石落入其他妖怪之手，决定参赛。那时，妖怪公寓收到了一台寄件人不明的电视机。屏幕上正播放着妖怪拉力赛的实况转播，看着它的子泣爷爷突然开始暴走。

从寒武纪岛走私来的猛犸花种子被鼠男误食。鼠男的身体迅速诡异变化，最终变成了巨大的猛犸花。开始一边破坏城镇一边移动的猛犸花。鬼太郎想方设法制定对策，从黑洋博士那里询问猛犸花在东京扎根的原因。但为时已晚，自卫队开始攻击。鼠男变的猛犸花也被火焰包围。

鼠男解除了妖怪城的封印。接着，针对儿童的诱拐事件接连发生。开始调查的鬼太郎，扮成孩子埋伏等待诱拐犯。在公园潜伏时，鼠男出现了。但他并非主犯，一系列事件是妖怪·坦坦坊在背后操纵。鼠男是为坦坦坊掳走孩子们的。计划被鬼太郎妨碍的坦坦坊，这次转而掳走大人们带往妖怪城。

闯入妖怪城的鬼太郎，与守护城堡的三只妖怪苦战。眼看就要败北时，因天亮而九死一生。鬼太郎想暂时撤退向砂婆婆等人求援，但白天的妖怪城与外界隔绝无法逃脱。而且城堡企图以鬼太郎和猫娘作为活祭品，完全复活。砂婆婆和子泣爷爷为救鬼太郎他们前往妖怪城，但……

来海边写生的孩子们发现了一个古旧的小祠堂。接着矶女出现，孩子们一个不剩地被掳走了。因为传说失传，他们没能意识到危险。接到消息赶来的鬼太郎面前，矶女现身。鬼太郎试图说服她归还孩子，却被矶女的孩子抱住沉入海底。接着，被矶女一口吞了下去！

涂壁带着陌生的妖怪来找鼠男。被那妖怪握住手，鼠男的身体发生了怪事。自己的手违背意志开始自行活动！妖怪名叫布埃尔，是从西洋来的恶魔，擅长夺取他人的手。布埃尔连砂婆婆和猫娘的手也操控，将鬼太郎逼入绝境。他从涂壁那里听说鬼太郎会灭绝恶魔族，于是想在大祸酿成前铲除灾厄之源。

鬼太郎和猫娘享受巴士之旅时，巨大的黑云正逼近日本。黑云笼罩之处，红绿灯失常、汽车自行启动等怪现象接连发生。如今唯一平静的，只有妖怪漫画家水木先生的家。受困于创作瓶颈的水木先生，看到来取稿的鼠男，为见到真妖怪而大喜。然而在怪气象中图谋不轨的妖怪·元兴寺之鬼，也闯入了水木先生的家。

鼠男被水獭欺骗，好不容易赚到的钱被抢走了。看中水獭能力的涂壁，想让他协助筹措资金。水獭立刻开始做生意，利用鬼太郎的人气制造名为“鬼太郎Z”的饮料大赚一笔。狡猾的他甚至欺骗涂壁卷款潜逃，躲进一位独居老人的家里。误以为水獭是自己孙子的老人，正被黑道逼迫还债。

发生了百货商店整个消失在地下的怪事。被困在消失建筑内失踪的人群中，也包括了兼职保安的鼠男。鬼太郎赶赴现场，发现建筑消失的大洞散发着奇异的光芒。想跳进那光里，却被奇异的力量阻挡。正疑惑的鬼太郎，被百货店前社长·三高松藏搭话。据说他家留有记载天狐传说的狐文字古文书。

水库管理员因干旱储水量减少，被土转的灵魂附身。接着原因不明的停电事故开始蔓延，连运转中的机场也电源中断。鬼太郎用吊桶火引导飞机，总算使其安全着陆。然而停电的扩大无法遏制。原来是土转在吸取电力。鬼太郎试图阻止，愤怒发狂的土转开始破坏火力发电站。

涂壁拿到了复活八岐大蛇所需的草薙剑。只要用剑解开钟乳洞中隐藏的八处封印，可怕的大蛇神就会复活。正在钟乳洞探险的祐子等人，偶然听到了涂壁的野心。试图逃跑的祐子等人被朱盆追赶。从ゲジゲジ处得知危机的鬼太郎乘上一反木绵前往钟乳洞。他能救出祐子他们，阻止大蛇神复活吗？

鼠男在跳蚤市场得到一面奇妙的镜子，发现镜中关着一位少女而大吃一惊。向鬼太郎求助时，眼球老爹看穿这是妖怪·云外镜所为。要救少女需要照魔镜。然而去据说展示着照魔镜的博物馆时，发现早已被某人盗走。鬼太郎折返时，少女身影消失，取而代之的是鬼太郎被关进了镜中。原来少女正是云外镜！

明明是梅雨季却持续干旱，酿酒兴盛的村庄苦不堪言。旅行中的子泣爷爷来到该村，因饥饿过度昏倒，被酿酒世家所救。听说干旱原因是妖怪后，子泣爷爷叫来鬼太郎想退治妖怪以报恩。那时，鼠男乘着奇妙的云屋出现，告知要向山间祠堂供奉“真正的酒”。异常气象的原因，是旱神对酿酒现代化导致酒味改变感到愤怒。

海难事故频发，海边村庄决定举行镇魂仪式。鬼太郎怀疑事故是船幽灵所为，乘坐夜行先生制造的妖怪潜水艇前往遇难现场。那时，正在慰灵中的船只遭到了船幽灵袭击。而且，附近出现了海图上没有的岛屿。击退船幽灵后，妖怪·海和尚从海中现身，瞬间将鬼太郎拖入海里。

鬼太郎突然失踪已过三日。担心他安危的眼球老爹等人面前，出现了涂壁。据说鬼太郎被涂壁欺骗，被混凝土封住了。涂壁和同伴蛇骨婆为此大喜，以为自己的天下即将到来。然而某夜，鬼太郎的木屐袭击了二人。 1997年07月13日

中国妖怪·琦为了征服日本、建立自己的王国，渡海而来。鬼太郎为对抗琦，集结了日本妖怪。得到琦正在建造城堡的情报后，他独自闯入城内。然而，在琦奇妙的法术面前苦战连连。猫娘他们也因鼠男的背叛而落入陷阱。

鬼太郎被琦的妖术变成了布匹。日本妖怪军也在中国妖怪军团面前濒临崩溃。眼球老爹他们潜入琦的城堡，救出了变成布匹的鬼太郎。要让他恢复原样，只能询问古井底的井户仙人。千年前来到日本的井户仙人，也是和琦一样的中国妖怪。

鼠男开设了托儿所。因为提供24小时托管婴幼儿的服务，深受有婴幼儿的母亲们欢迎。少年健太的弟弟妹妹也入了园。其实那家托儿所，负责照看孩子的是妖怪·产女。非常喜爱孩子的产女，将聚集来的孩子们带去了自己的住处。

鼠男在河边钓鱼钓起了一个骷髅头。当晚，一位少女来到他的房间。说是有关于钓起的骷髅头的请求。第二天鼠男就消失了，镇上出现了诡异的骷髅集团。骷髅集团吹着笛子，开始聚集人类以制作人肉罐头！

工地现场发现了巨大的柱子。涂壁看穿那是妖怪·逆柱，削下一部分做成了木屐。然后偷出鬼太郎的遥控木屐，用逆柱做的妖怪木屐调了包。被引诱出来战斗的鬼太郎，妖力被逆柱木屐吸走，无法使用特殊能力。

鼠男将砂婆婆作为模特介绍给了住在郊外洋馆的画家。砂婆婆一进画家的房间，就被装饰着的肖像画吸了进去。鬼太郎从鼠男那里问出画家的事，前往有问题的洋馆。但是，鬼太郎刚被邀请进画室，也被吸进了肖像画中。

强盗犯被警察追赶，逃进了有土蜘蛛妖怪栖息的深山。土蜘蛛被强盗犯射出的子弹打中后，变成幼小的孩子试图疗伤。感到妖气的鬼太郎来到山里，但警察不愿相信妖怪的存在。那时，土蜘蛛袭击了寻找强盗犯遗留金块的鼠男。

没有实体的妖怪·魍魉，一直等待着怪兽电影演员长岛死亡，以得到他健壮的肉体。某天，长岛因心脏病发作死去。但他似乎对现世仍有留恋，迟迟不肯成佛。鬼太郎从鼠男那里问出情况，前往电影制片厂寻找魍魉。

一个叫村上的男子曾因事业失败，企图自杀进山时遇到了妖怪·仓坊主。他从仓坊主给的奇妙茶碗中恢复了元气，新开创的事业大获成功。听说此事的男子安田也想见仓坊主，拜托鼠男帮忙，一起前往深山，但……

鼠男挖出了妖怪·袋提。袋提吞下鼠男后，开始不断吸入人类的愿望和欲望，变得越来越巨大。鬼太郎为了阻止它，扮成辣妹引诱袋提。然而本想达到无欲无求的状态，却因怀有“想帮助大家”的愿望而……

猫娘被在镇上遇到的神秘女性带着，走进了小巷里的咖啡馆。正要喝咖啡的她遭到长发般妖怪的袭击而逃出。不久后，鬼太郎收到了猫娘的召唤信。鬼太郎前往指定的咖啡馆，发现长大成人的猫娘正带着诡异的笑容等在那里。

深山岭道接连发生失踪事件。经营旅馆的正广少年的父亲也在去接客人的途中消失了。原来是妖怪·抖抖怪为了吃人类的恐惧心以延长寿命。赶来的鬼太郎也被抖抖怪的妖气吞噬，陷入绝境。千钧一发之际天亮，抖抖怪力量消失，鬼太郎开始反击。

地狱的阎魔大王那里不再有死者灵魂到来。受托解决的眼球老爹推测灵魂的通道有异变，带着鬼太郎和猫娘开始调查。跟着路过的灵魂，他们到达了一所有着诡异结界的医院废墟。在院内的鼠男告诉大家，百鬼夜行之鬼是事件的黑幕。

住在妖怪公寓的百目的孩子失踪了。原来是迷路到了人类居住的城镇。碰巧路过的鼠男保护了他，并想利用百目特有的远目能力赚钱，使出惯用的坏主意。使用能力后，百目的孩子看到的是涂壁秘密培育的妖怪树之花。

妖怪·桂男在满月之夜将巨大的昆虫送入城镇。为了让月之使者月女返回故乡，他打算破坏城镇，熄灭所有人工灯火。若错过800年才有一次的今夜，月女将徒然消失。得知情况的鼠男向砂婆婆求助，鬼太郎则试图阻止破坏城镇的桂男。

钓鱼的少年面前出现一位神秘老人，用鱼眼丸药丸换走了他钓的鱼。吃了鱼眼丸的少年全身长出鳞片变成了鱼。眼球老爹为了救少年，将从井户仙人那里得到的鱼眼丸给鬼太郎他们喝下。鬼太郎他们变成鱼，潜入海中寻找少年。

鼠男发现了一个旧釜。那正是妖怪·釜鸣。釜鸣唆使鼠男引出鬼太郎，吸走了其妖力源泉的头发，还夺走了背心和遥控木屐。获得了鬼太郎全部妖力的釜鸣，开始大闹要收拾掉其他所有妖怪。

妖怪·咔嚓骷髅在北海道出现，开始挖掘地面寻找某物。全国各地也出现其他妖怪，同样在寻找着什么。日本妖怪们被西洋妖怪操纵，正在寻找涂壁为了复活妖怪岛所需的封印之镜。终于找到镜子的涂壁，以妖怪王之姿出现在鬼太郎面前。

复活的妖怪岛上耸立着诡异的妖魔城。而且涂壁已与西洋妖怪的帝王·バックベアード联手。鬼太郎面前出现了西洋妖怪四天王之一的蝙蝠猫，挑起战斗。鬼太郎在激战中被吸走全部妖力，猫娘他们为了送他去医院而开动妖怪巴士，但……

鬼太郎好不容易击退了西洋妖怪军的刺客，吹起陶笛呼唤日本全国的妖怪告知危机迫近。然而，日本各地早已异变频发。鬼太郎在海上发现巨大流冰时，遭到西洋妖怪布伊的袭击。为拯救鬼太郎的危机，日本妖怪们抱着必死的决心迎战布伊。

登上妖怪岛的鬼太郎面前，站着西洋妖怪四天王中最强的巨人。苦战的鬼太郎切断了巨人妖力源泉的胡须，取得了胜利。不容喘息，妖怪王涂壁出现，将所有背叛者抹杀。接着，鬼太郎与涂壁史上最大的战斗开始了！

妖怪·影女接连掳走对社会心怀不满的人类。偶像千里也因讨厌工作而逃跑时被影女带走。开始调查的鬼太郎因为没有不满，无法引出影女。但是，被猫娘他们抱怨的鼠男的影子中出现了影女，绑架了鬼太郎。

言灵使·一刻堂面前出现了涂壁，委托他祓除鬼太郎和同伴们。不久后，祐子的小学接连发生异变。前来调查的鬼太郎遭到一刻堂的式神·瀬户大将等人袭击。鬼太郎虽勉强击退式神，却被一刻堂的五芒星阵困住。一刻堂使用言灵，开始抹去鬼太郎他们的名字。

被封印的中国妖怪·刑天的木乃伊被盗。中国的茶伊那道士为夺回刑天来到日本，拜访眼球老爹。另一方面，苏醒的刑天为寻找宿敌茶伊那道士，在海边村庄大肆破坏，并查出道士正逗留在鬼太郎家中。被变成僵尸的猫娘正向鬼太郎家逼近！

猫娘在森林里看到鼠男，觉得他样子与往常不同便跟踪他。来到街上的鼠男开始免费分发小白鼠。他完成任务后返回的废寺，已被无数的老鼠淹没。鼠男的灵魂被妖怪·旧鼠夺走，正被随心所欲地操控着。