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古代秘宝的线索中断，Joker一筹莫展。这时，看到电视上播出的俄罗斯研究所宝石“红色彗星”而兴奋不已的霍西，Joker立刻前往那家研究所。看到同一新闻的赤井翼也前往研究所，但那里有企图捕捉外星人的疯狂科学家尼奥博士在等待。

Joker和八为寻求古代秘宝的线索来到广袤沙漠，偶然遇到了为夺取宝物“法老的假面”而来的Queen。然而那里是法老统治的王家沙漠。

Joker他们接下来为追寻古代秘宝的线索，来到印度寺院寻找“伽楼罗像”。在那里，被称为拥有神之眼的少年查帕正在为村民们创造各种奇迹。

来Spade的飞艇上游玩的Joker和八，发现了年幼偶像的演唱会照片。那竟是Dark Eye小时候的样子“Pretty Eye”。Joker和Spade还是怪盗见习生时，在为宝物潜入的演唱会会场遇到了她。

为了疗养平日寻宝的疲惫，Joker四人来到了金有家的豪华温泉。他们打算顺便也拿走温泉里的“特大豪华钻石”。但鬼山警部、恶魔之牙的怪盗丘比特，甚至女雇佣兵皆子也闯入其中，演变成四方大混浴，不，大混战。

Joker等人认为与卑弥呼不老不死传说有关的宝物“命之壶”中藏有古代秘宝的线索，便前往甲贺之里。得知此事的里中隐居者命令百鬼丸保护壶，但壶却被尼奥博士率领的机器人军团夺走。

Joker和Spade收到了Silver Heart的紧急联络求助。她为了夺取“紫水晶地球仪”潜入其中，却动弹不得。而那里竟是世界VIP们聚集的国际宇宙会议。

Shadow·Joker向Joker发来了挑战书。Joker虽然感冒了，但不想被Shadow小看，于是用遥控操纵的迷你Joker人偶与八一起参战。

Joker和八为了寻找古代秘宝的线索前往南方岛屿。Queen也为别的宝物而来，但这座岛屿被禁止男子入内的亚马逊一族“虎之乙女”统治着。

Joker被总统D率领的恶魔之牙趁虚入侵了空中飞艇的系统，飞艇被夺走。那里保管着“剑齿虎的冷冻木乃伊”。

中了尼奥博士的诡计，Joker等人连同飞船一起被葬送海底，恶魔之牙的成员们举杯庆祝。尼奥博士宣布正式开始菲尼克斯捕获作战，而此时一封预告状送到了总统D手中。

在与恶魔之牙的激战之后，Joker虽然夺回了空中飞艇和剑齿虎的冷冻木乃伊，但菲尼克斯被尼奥的部下“狙击手幻魔”的凶弹击中倒下，被尼奥博士囚禁。

彗星进一步接近地球，担忧撞击的世界各国开始用导弹准备迎击彗星。但那颗彗星，其实是菲尼克斯与霍西一同乘坐而来的宇宙飞船。