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2017年7月25日。羽田国际机场上空突然出现神秘巨大立方体，即将起飞离陆的客机连同乘客一起被吞没。那架客机上，偶然坐着外务省的王牌交涉官·真道幸路朗。

从神秘巨大立方体·卡多中出现的雅哈库伊扎修尼纳与外务省交涉官·真道幸路朗。得知雅哈库伊扎修尼纳希望经由真道进行直接交信后，日本政府将目光投向了一位国际交涉官。

从巨大立方体·卡多中再次现身的神秘存在·雅哈库伊扎修尼纳与外务省交涉官·真道幸路朗，首次与国际交涉官·徭沙罗花进行了交谈。在向媒体全面公开的情况下，人类与雅哈库伊扎修尼纳的对话开始了。

被卡多吞没的乘客们开始获释。与此同时，雅哈库伊扎修尼南向日本政府提供了能无限产生电力的物体·瓦姆。获得了超越人类技术的瓦姆的日本政府，吸引了全世界的目光。

被提供给日本政府的异方物体·瓦姆。联合国安理会主张由联合国主导对瓦姆进行严格管理，并以制裁为要挟要求日本立即交出。站在岔路口的首相犬束构造面前，真道提出了某个方案。

应雅哈库伊扎修尼纳和真道幸路朗的请求，理论物理学家品轮彼方掌握了瓦姆的制造方法。犬束首相向全世界公开了该方法。在世界哗然之中，真道等人开始着手解决占据羽田机场的卡多。

在瓦姆制造法公开导致社会动荡之中，真道幸路朗致力于卡多的转移计划。在各方的协助下，卡多顺利转移到了狭山湖，但喘息未定，雅哈库伊扎修尼纳便向真道展示了新的异方物体。

言野匠在卡多内部目睹了给予人类异方感觉、甚至使睡眠不再必要的装置·桑萨。另一方面，交涉官徭沙罗花向真道幸路朗表达了自己的愿望：“想让雅哈库伊扎修尼纳回到异方”，然而……

SETTEN的言野匠与雅哈库伊扎修尼纳一同向全世界播出了异方装置·桑萨的影像。另一边，徭沙罗花想要守护人类与世界尊严的想法传递给了真道幸路朗，真道朝着卡多内部而去……

在瓦姆和桑萨席卷世界之时，雅哈库伊扎修尼纳向真道幸路朗展示了更进一步的异方物体，并坦白了异方存在的本质欲望。然而，国际交涉官徭沙罗花对过于急促的人类进化提出了异议……

为了阻止扎修尼纳的阴谋而施展力量却败北的徭沙罗花，一边治愈真道幸路朗的伤口，一边坦白了自己降临这个宇宙的心意。另一方面，扎修尼纳与复制真道一同开始将纳米斯海因向人类扩散。

为了阻止企图将人类异方化的雅哈库伊扎修尼纳，真道幸路朗等人借助品轮彼方等人的力量暗中准备。“实现双方的愿望”——真道如是说。在卡多开始扩张、世界陷入混乱之中，最后的交涉开始了。