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在一文字博士门下，烈矢和豪树在波尔佐伊学校跑车。但得不到博士认可的豪树离开了学校。此时，一个叫和男的少年出现在豪树面前。

豪树决定住在源先生经营的GEN制作所。以成为世界第一的迷你四驱车手为目标的豪树，为了向胜利队的豪发起挑战，乱入了为参加第二次WGP而踏上旅途的胜利队的壮行会。

豪树离开的波尔佐伊学校的理念是“比赛就是战斗”。坚信“强大才是迷你四驱”的烈矢为了挑战哥哥豪树而寻找他。另一方面，豪树接受了仁志这个少年的挑战……！？

听说仁志他们那里有很强的车手，豪树前往大楼建设工地发起挑战。豪树发现了一条高难度的赛道，立刻让自己的赛车飞驰起来，这时一个名叫玛丽娜的少女出现了。

豪树在GEN制作所过着平静的日子，而烈矢则在波尔佐伊学校接受着严格的特训。成绩A级顶峰的烈矢为了升入S级，与S级的车手进行比赛。

听说波尔佐伊学校的车手们在各地破坏赛道，豪树等人组成了“町内防卫队”。没想到破坏赛道的犯人竟然是烈矢他们波尔佐伊学校的家伙。

豪树知道了GJC冬季赛的存在。要想成为世界第一，首先要成为日本第一！于是他决定参加比赛。大赛当天，会场里也有和男和玛丽娜的身影。然后比赛开始了！！

出现了一个操纵两台赛车打败了波尔佐伊车手的少年！！听到这个传闻的豪树立刻向那个少年一马发起挑战。但见不到本人，豪树把挑战书交给了他的弟弟力。

波尔佐伊学校主办的首届比赛“波尔佐伊公开赛”即将举行。在比赛开始前的一个月里，S级车手们将用特别的项目重新锻炼。

波尔佐伊S级顶级车手左京回来了。烈矢立刻向他发起挑战，但对MAX破坏者更感兴趣的左京没有应战。左京去见豪树，提出了比赛申请。

输给左京的豪树决心用MAX破坏者创造出必杀技。他立刻在赛车上安装了火箭，但轻易地失败了。另一边，烈矢向左京发起挑战，但被轻易拒绝。

终于创造出必杀技“MAX风暴”的豪树，以在波尔佐伊公开赛中获胜为目标努力特训。另一边，神秘少女玛丽娜也被邀请参加比赛，发誓要打倒波尔佐伊。然后比赛当天……！？

比其他车手晚出发300秒的玛丽娜、大善兄弟、左京以及烈矢和豪树。虽然努力追赶前方集团，但初速较慢的MAX破坏者被浊流吞没了。

波尔佐伊公开赛也迎来了高潮。争夺领先的是玛丽娜和左京。另一边，烈矢和豪树也展开了激烈的较量。烈矢试图用擅长的等离子攻击打败豪树，但赛车发生了故障……！？

在波尔佐伊公开赛上展现了MAX风暴威力的豪树。输给豪树的烈矢再次向他发起挑战。在仁志等人的注视下，烈矢的复仇赛开始了！

厌倦了制作所后面赛道的豪树等人决定自己制作赛道。新成为GEN制作所寄宿者的烈矢也来帮忙，一条惊人的赛道完成了！大善兄弟、玛丽娜也加入其中，一场大赛开始了！

在波尔佐伊公开赛上输给豪树的左京，再次向豪树发起挑战。得知此事的烈矢瞒着豪树去了比赛场地，向左京发起挑战。比赛被左京压倒性地领先，烈矢对自己的跑法感到焦虑。

专注于改良暗影破坏者的烈矢，用力过猛把浴室弄坏了。GEN制作所的大家只好去公共澡堂。但不知误会了什么，烈矢和豪树在澡堂里开始了比赛。

一个破烂的假Z-3被送到了在GEN制作所生活的烈矢那里。赛车上附着一张写着“三天后”的纸条……。诡异的赛车和纸条每天都会送来，豪树他们对看不见的对手感到不安。

烈矢的Z-3被神秘少年渐打得破破烂烂。他试图自己修理，但车身碎裂，电气系统也故障了，以烈矢的力量似乎无法修复。看到这一幕的豪树想要帮忙……！？

在渐与豪树的战斗现场，烈矢出现的那一瞬间，渐随着烟雾消失了。修好赛车后再次发起挑战的豪树，再次被两台赛车玩弄。豪树和烈矢以为是渐的那个少年，其实是……！？

输给草薙兄弟后，豪树又发了高烧卧床不起。另一边，烈矢试图向草薙兄弟挑战复仇战，但意识到一个人不行，便向玛丽娜提出组成搭档……！？

烈矢使出的新必杀技击中了火焰毒针，玛丽娜的赛车被撞得七零八落。另一边，得知烈矢和玛丽娜要与草薙兄弟对决的豪树，出现在了决斗地点。

战胜了草薙兄弟的豪树和烈矢。两人的面前出现了新的敌人！神秘的波尔佐伊车手本杰明和查理向豪树等人发起挑战，但不知为何他们的速度慢得可怕。

GEN制作所来了一位新女员工！这位名叫小百合的女性让制作所的众人大喜！某天，豪树收到了一封自称“原GJC冠军”的神秘人物寄来的挑战书。

豪树等在制作所后面的赛道上飞驰，但烈矢依然不加入他们的圈子。烈矢一个人在空地的赛道上跑车，遇到了几个刚开始玩迷你四驱的孩子们。

今年GJC夏季赛的季节也到了。这次比赛的地点是九州。豪树立刻和源先生、南等人一起前往九州。旅途中，豪树遇到了名古屋的少年们……！？

被源先生开导后，豪树决定帮助惠一他们，于是前往惠一等人那里。在那里，惠一他们正苦战于粉碎者队。没想到赛道上竟然装了跷跷板。

到达大阪的豪树一行人陷入了大堵车，完全动弹不得。豪树忍不住要上厕所，从车上跳了出来，遇到了一个叫龙平的少年。在龙平的安排下，他们得以参加大阪地区预选赛。

豪树一行人终于到达了九州，但在途中的山路上车子抛锚了。在源先生去取汽油的时候，豪树遇到了一个当地参加夏季赛的少年大吾。

GJC夏季赛终于开幕！！以豪树为首，众多豪强齐聚九州，但会场上却没有波尔佐伊车手的身影……。豪树等人怀着一丝不安，激烈的战斗开始了！

GJC夏季赛被波尔佐伊劫持了！被卷入第二届波尔佐伊公开赛的豪树等人被困在地下隧道里，接连袭来的陷阱让他们陷入苦战。

因不知道赛道而困惑的豪树等人面前，出现了一个神秘少年，主动提出为他们带路。豪树等人决定跟着这个少年走。虽然平安回到了地面，但那赛道却是通向火山的！

与幻影刀锋互相抵消、被劈成两半的Z-3。烈矢迟迟无法振作起来。另一边，南等人正为打不开一文字博士的神秘手提箱而苦恼。

烈矢的新赛车指节破坏者终于完成了！为了让一文字博士看看赛车的性能，烈矢前往波尔佐伊学校。但博士被软禁在波尔佐伊，无法见面。

美国的迷你四驱大赛“超级国家冠军系列”的决赛最终阶段决定在日本举行，豪树等人也决定参加。烈矢也打算用指节破坏者挑战，但……！？

输给美国车手后，豪树等人为了下一场比赛，一心投入到赛车的行驶练习中。豪树和玛丽娜一起练习赛车的同时，烈矢则拼命想要掌握Z-1的跑法。

由于烈矢的失误，一文字兄弟把重要的东西掉进了下水道！两人立刻装上摄像头和头灯开始搜索。南等人听说是在寻找宝藏也跟了上去，但这次连赛车都跟丢了！！

川下模型店10周年纪念大型迷你四驱赛车比赛即将举办。热衷于比赛实况解说的小百合立刻向全国的车手们发出了邀请函。豪树等人顺利通过了预选赛。

波尔佐伊的孙子尼禄来到了日本。在前往波尔佐伊住处的途中，尼禄遇到了仁志，并帮他改造赛车。仁志立刻用那辆赛车向豪树他们发起挑战，并用必杀技取得了胜利。

出门买东西的南偶然遇见了一文字博士。她感到可疑，联系了波尔佐伊学校，得知博士已经离开了波尔佐伊。另一边，玛丽娜被黑衣男人们带去了波尔佐伊学校……！？

大神博士在波尔佐伊·尼禄的带领下继续研究。尼禄试图制造出兼具速度和力量的究极赛车。大神博士命令玛丽娜“去摧毁豪树他们的Z赛车”。

尼禄的新赛车迪奥马斯终于完成了。另一方面，豪树和烈矢正拼命修理在与玛丽娜的比赛中损坏的MAX破坏者。然而，由于豪树的疏忽，赛车变得无法修理。

让重生的新MAX破坏者飞驰的豪树面前，突然出现了一个少年。与MAX破坏者并排飞驰着崛起闪电的，竟然是胜利队的鹰羽凉！！

秋季赛开幕！豪树、烈矢、尼禄等人用各自的赛车展开了激烈的较量。但比赛途中，尼禄的赛车发挥了恐怖的力量，连赛道本身都崩塌了！！

为了M1锦标赛开幕，来自全国的强豪车手们集结一堂，龙平、大吾等人也涌到了豪树身边。从一万人中能进入正赛的只有五人！！豪树他们能顺利通过预选吗？

M1锦标赛也进入了尾声。但领先集团正苦于草薙兄弟的妨碍。豪树与突然加入比赛的左京一起，以领先集团为目标冲向终点。烈矢也设法通过了第一轮预选。

确定进入决赛的豪树、烈矢、仁志、龙平、左京、大吾五人，为了一周后的比赛进行准备。另一方面，大神博士在草薙兄弟的赛车上搭载了MG之石，正在进行最后的调整。

M1锦标赛决赛终于开幕！跑在最前面的是尼禄。豪树等人受到草薙兄弟的阻碍，无法顺利前进。跑在最后的玛丽娜用强化后的赛车与草薙兄弟对决。

M1锦标赛进入中段，各选手开始进行赛车保养。玛丽娜在调整赛车时，脑海中不断回响着龙平和左京的话。完成保养后，玛丽娜从赛车上取下了危险装置。

M1锦标赛也迎来了决出胜负的时刻！跑在最前面的是尼禄。其后紧跟着豪树和烈矢。终点附近，烈矢超越了尼禄跃居首位，但豪树也不甘示弱地紧追不舍。胜利究竟会落入谁的手中……！？