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众羊去冰极考察，发现了考察队的营地（是假的），后来掉在了遗迹的大日晷中，后来发现了挑起狼羊和平的小狼人，喜羊羊先要抓住他，已免在挑起争端。小狼人在引诱喜羊羊撞碎冰梯后逃脱了，然后产生一种神秘的异状，就在这时出现了一只大恐龙，大家该怎么应对呢？

灰太狼与喜羊羊想合力打倒霸王龙反令它失控遇险，多亏两女羊及时救回反令它变得听话。但是当他们以为危险都解决时，却发现沸羊羊和慢羊羊在遗迹中离奇失踪了。在大家一轮搜索后，发现遗迹里竟有一个神秘的空间。

众羊狼为寻找消失的慢羊羊和沸羊羊进入时空门，竟发现里面是个时空隧道挤满了时空迷失者。喜羊羊自责，主动帮时空守卫者——逗逗把时空迷失者送回正确的时空，却发现有一批时空迷失者跑出去青青草原，众羊狼必须把他们找回来。

灰太狼救了一只陌生小羊，谁知小羊误以为灰太狼一家是坏人，总是千方百计想要逃出狼堡，但总是受挫。而正跟伙伴在寻找时空迷失者的喜羊羊收到灰太狼的通知，过来认领小羊。结果当他赶来时，陌生小羊也逃出狼堡，两人相撞。

喜羊羊把上集捡到的笔记本还给智羊羊，却发现自己把笔记本搞掉了几页，喜羊羊与智羊羊到处寻找都找不到。喜羊羊让灰太狼帮忙，谁知道却让智羊羊误会遭遇危险，最后喜羊羊和灰太狼合力解救，误会解开。

小智羊羊回到羊村觉得充满新奇，喜羊羊因此发现小智羊羊不是这个时空的小羊。与此同时，小狼人潜入羊村，不知情的小智羊羊遭受利用，险酿大祸。最终小智羊羊与村长相认，喜羊羊惊讶得知小智羊羊原来就是自己的爸爸。

小智竟然就是喜羊羊的爸爸，而他的梦想就是制造水火箭。喜羊羊想帮助智羊羊完成梦想，却被慢羊羊告诫不能相助，只能让智羊羊自我完成。最终，智羊羊在与和喜羊羊的玩乐中成功领悟到制造水火箭的关键，完成了梦想。

喜羊羊与小智临别之际，来到游乐园共度最后一日。通过小智的行动，喜羊羊明白到做错事不可怕，重要的是要重新振作起来，弥补过错。最后，喜羊羊与众羊一起救下了脱轨而出的过山车，破灭了小狼人的阴谋，逃过一劫。

小狼人扮成懒羊羊的样子跟着喜羊羊送小智回去。当喜羊羊发现他的真面目时，小狼人已将雷霆号撞进错误的时空，打算将喜羊羊他们永远困在那里。好在喜羊羊和小智发现及时，最终打败小狼人，挫败了他的计划。

喜羊羊在过去时空收到了小智羊羊为自己准备的“生日礼物”后，感动地返回现代。喜羊羊与大家合力阻止小狼兵逃跑，却因为美羊羊的一时害怕而失败。当大家回到羊村时，更发现过去时空的潇洒哥竟偷偷走上飞机跟出来了。

黑大帅和潇洒哥全部来到了这个时空，小羊们兵分两路，一边去寻找黑大帅，一边则让美羊羊看守潇洒哥。在潇洒哥的鼓动下，美羊羊为了做出自己的贡献也出发寻找黑大帅，但潇洒哥贪图享乐，还不慎捣乱，导致黑大帅逃走。

黑大帅与众羊狼大战失去电力，于是仓皇夺过霹雳号逃走，不料美羊羊躲在车内。期间，美羊羊想办法去抓黑大帅，反被黑大帅。黑大帅横生一计利用美羊羊威胁众小羊给自己充电，眼见黑大帅要得逞，潇洒哥乌龙出场竟把黑大帅撞飞。

黑大帅来到狼堡，不仅折磨灰太狼，更大肆破坏狼堡内与水有关的一切，甚至利用小灰灰威胁灰太狼。灰太狼想方设法通知小羊，信息却一直意外被潇洒哥阻断。等小羊们赶到狼堡时，黑大帅已因为小灰灰的一杯西瓜汁而被扳倒。

众小羊与灰太狼准备将潇洒哥与黑大帅送回自时空，不料中了小狼人的调虎离山之计，让潇洒哥兄弟得以借故逃脱。幸好关键时刻众人及时发现端倪，赶去抓住一直在互相争斗的兄弟俩，成功将他们制服，踏上归途。

美羊羊送潇洒哥和黑大帅回去时被食人鱼攻击掉落错误的时空，再次潇洒哥和黑大帅无意打破蜂蜜，两人为了不改变时空决定去偷蜂蜜，谁知道导致美羊羊遭遇危险，最后潇洒哥和黑大帅承认错误救回美羊羊

狼羊们将潇洒哥和黑大帅送回他们所在的时空，却不慎将过去的灰太狼弄晕导致历史改变。为了让历史回到正轨，现在的灰太狼扮演过去的灰太狼去应付黑大帅，却始终无法成功，好在最终在喜羊羊的指挥下，终于让历史恢复正常。

小羊们为了营救灰太狼被古古怪界时期的美羊羊抓住，独剩现代的美羊羊躲过一劫。现代美羊羊鼓起勇气，运用霹雳号的装扮功能，在黑大帅大本营上演了一出“真假美羊羊”，骗过黑大帅，用自己的勇敢与智慧救出了小伙伴们。

暖羊羊看到小狼兵拖着当年救过自己的机械羊离开。喜、暖合力救下机械羊，机械羊表示自己的兄弟还被困在冰极。喜、暖急忙带着机械羊去找他的兄弟。谁料这一切都是圈套，机械羊来到目的地，竟一反常态推喜羊羊和暖羊羊进冰窟。

被小狼人改变了程序的机械羊为了阻止喜羊羊和暖羊羊逃出洞底，跟他们发生争执，结果过程中机械羊被冰块砸晕。结果小羊不计前嫌带着他继续探索出路。最终。他们利用洞底的喷泉，将他们冲出地面，成功得救。

机械羊被他的“敌人”——小羊们带回了羊村。慢羊羊发现他身上被人动了手脚，于是大家使尽办法想让机械羊恢复记忆，却因此给了他逃跑的机会。但是面对着小羊们对自己的善意，机械羊开始对小羊们“敌人”的身份感到疑惑。

通过小羊的细心照料，机械羊的伤势得以康复，而他也渐渐改变了对小羊的看法，与小羊交好，面对小狼人的捉羊命令竟表现出了异于机械的情感。当小狼人得知了这一切。就在大家一心以为可以帮机械羊恢复记忆时，他失踪了。

小羊顺着油渍进入左侧分叉路寻找失踪的机械羊，不料最终没找到羊，却发现了他漂浮在海上的眼镜。就在众羊都以为机械羊凶多吉少时，灰太狼发现了端倪，带着众人回到右侧分岔路寻找，果然找到了机械羊，但却发现他却变了。

因为小狼兵的缘故，机械羊突然发狂，四处破坏。小羊们和机械羊大战，试图给机械羊装上芯片让其恢复正常，却没想到小狼兵从中捣乱，无意之间朝机械羊发炮，关键时刻，暖羊羊为机械羊挡住炮弹，竟意外唤起了机械羊记忆。

大家在过去时空中，飞机意外被七大恶狼霸占了。灰太狼挺身而出，要用狼的身份悄悄把飞机夺回来。但是他却处处出糗，不但没夺回飞机更害小羊被抓。关键时刻，喜羊羊出手救下了大家，灰太狼想起了黑大帅的话感到不忿。

慢羊羊怀疑花羊羊成为时空迷失者中的一员，独自寻找花羊羊的下落，并在森林中偶遇了一个怪人。相处中慢羊羊怀疑怪人有问题，但因为小狼人的出手令慢羊羊解开误会。最终慢羊羊与怪人逃出生天，怪人告诉慢羊羊，自己叫花羊羊。

众羊想尽各种办法帮助怪人花羊羊恢复原样，但都失败。就在花羊羊绝望之际，慢羊羊发明出了可以恢复原样的药水，但却被一直暗中观察的小狼人给拿走，众羊赶紧抢夺。谁知虽然小狼人被赶跑了，但药水却被摔碎了，只剩下最后一滴。

遗憾当年没跟花羊羊好好告别，慢羊羊陪伴花羊羊去找年轻的自己。然而，与年轻的慢羊羊擦身而过，慢羊羊还是没能促成两人见面。万幸的是花羊羊发现老慢羊羊的真实身份，慢羊羊以烟花送行，总算为这段漫长的告别写下完美的句号。

懒羊羊护送蕉太狼回去正确的时空时无意让刀羊也跟着去，刀羊恨狼入骨，刀羊一直想打败刀羊可总打不过，最后灰太狼回到家捉住了懒羊羊和小刀羊，在蕉太狼的帮助下，刀羊使出“绝招”成功打败灰太狼。

懒羊羊巧遇三恶霸最近收养的羊宝宝，于是说服三恶霸去寻找宝宝的亲生父母。期间，小狼兵为了报复小羊沿路设下各种陷阱，都被宝宝识破。小狼兵怒，抢走宝宝威胁懒羊羊，懒羊羊和三恶霸合力救回宝宝，宝宝因此对懒羊羊萌生好感。

因为受小宝宝喜爱，在大家寻找他父母时懒羊羊要帮忙照顾小宝宝。过程中，懒羊羊对这屡屡给他找麻烦的小宝宝产生了好感，更舍身保护了他。原来小宝宝是迷失者，但检查器却被他弄坏不能马上送走，只有懒羊羊在偷着乐。

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懒羊羊偶然见到宝宝站起来，要证明给小羊们看时总是不成功，小羊们认为懒羊羊把梦当真。小狼人设下陷阱掳走了宝宝和族长，懒羊羊只身前去营救，却因此被置于危机之中，最终因为宝宝站起来重启了飓风号，三人顺利脱险。

被检测出是宝宝的爸爸的懒羊羊，跟身为人父的灰太狼分别用自己的方式来带小孩。结果宝宝和小灰灰因为他们的疏忽被小狼人抓走。为此，他们拼尽全力，打败小狼人，救回孩子们。最终，大家也发现懒羊羊不是宝宝的爸爸。

众人回到羊村刚建立的时代为宝宝寻亲，不料中途发现一羊被狼抓。众羊一心想救羊，却不慎全身被武大狼抓进牢笼。灰太狼想方设法从狼群中救下宝宝和众羊，最终成功逃出狼营，将宝宝交还。不料，宝爸另有其人

大家遇到软绵绵时代的族长，这才发现原来小宝宝竟然是未来的族长，而刚刚带走他的是小狼人。于是大家努力追击小狼人，最终在众人努力下，成功抢回宝宝，将其交给了真正的父亲。于是，宝宝父子得以真正团聚。

喜羊羊在中转站追逐小狼兵，灰太狼忽然来电，老婆红太狼跟小白狼跑了，就连小灰灰都不见了，灰太狼妻离子散。为了找出真相，狼羊回到过去时空，最终灰太狼战胜了以前的自己，用真爱挽回了红太狼，历史恢复正轨。

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众羊狼以为过去喜羊羊是易容的小狼人，合力将其抓住。不料小狼人使计劫走，然而过去喜羊羊识破其奸计逃离。众小羊一路追捕，几经波折，终于发现过去喜羊羊的真实身份，却没料到，这时候小狼人出现把过去喜羊羊抓走。

过去的喜羊羊被小狼人所抓。众羊为尽快将其救出，配合喜羊羊设计引小狼人出现。一切都按计划进行，但不料中途发生意外，导致两个喜羊羊同时被抓。为挣脱小狼人，两个喜羊羊默契配合，智斗小狼人，最后成功逃出。

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大家将过去喜羊羊送回他所在的时空，谁知小狼人捣乱将过去的喜羊羊给藏了起来。过去的喜羊羊危在旦夕，导致现在的喜羊羊竟然也虚弱无比。大家寻找过去的喜羊羊不果，但他们赶回羊村时，发现现在的喜羊羊逐渐失去意识。

现代喜羊羊的铃铛出现冰极的图案，众羊狼跟着线索找到冰洞，救出过去的喜羊羊。小狼人又前来阻止众羊狼，更是恩将仇报，将刚救出自己的羊狼们推入险境。过去喜羊羊的得救让现代喜羊羊顺利恢复，危急时刻赶到救了大家。

灰太狼在大家的庆功宴上表现怪异，原来他把黑太狼藏在了狼堡。为了不让黑太狼被发现，黑太狼接受着他的严厉训练，没想到却引起了小羊们的担心。最后在灰太狼的努力下，终于成功将事情掩埋过去并通过了黑太狼的训练。

黑太狼想去捉羊，可如果黑太狼的身份暴露会引起严重的后果。所以灰太狼代替黑太狼去捉羊，可灰太狼为了不让黑太狼失望，又不伤害小羊，因此屡屡装作操作失误而失败，令自己受伤，显得小羊厉害，却令黑太狼对他失望。

灰太狼不想训练，向黑太狼说出想法。黑太狼竟把训练的目标转向了小灰灰，还让他受伤了，灰太狼因此和黑太狼吵架。灰太狼暗自抱怨黑太狼的行为，却发现了他所不知道的真相。悔疚的灰太狼向黑太狼道歉，两人最终和好。

黑太狼想出去捉羊，小狼人为了阻止黑太狼出门，只好委屈自己成为黑太狼的下属，借口出去帮忙捉羊，以此来阻止黑太狼和小羊们见面。但谁知，黑太狼最后拆穿小狼人的阴谋，还是与小羊们见面，不过好在小羊们没有认出他。

小羊认为灰太狼古古怪怪来到狼堡查看，灰太狼惊慌失措发动全家一起对小羊们、黑太狼各种遮掩、隐瞒黑太狼的存在，同时又不能让黑太狼知道小羊的存在，可在小羊们完全信任准备离开时，黑太狼和小羊们却相遇。

沸羊羊对黑太狼的身份存疑，决定去狼堡查明真相。期间，沸羊羊旁敲侧击，发现黑太狼眼露凶光的原因竟是近视。沸羊羊放心离开，却意外发现黑太狼的真实身份。羊狼为黑太狼的去留发生争执，紧要关头，黑太狼竟被小狼人突然带走。

沸羊羊发现小狼人所留下的鳞片竟与逗逗的十分相似，于是只身前去中转站验明逗逗的身份，结果误会一场。另一边，众羊找到了黑太狼与小狼人，但不幸被困地洞，只好求助沸羊羊。但沸羊羊却因地震被困中转站。

中转站地震，沸羊羊幸得金腰带战士相救，之后两羊合力救下了中转站众人。另一方面小羊们发现了小狼人，却被困在了一起，狼羊明争暗斗，最终小狼人用变身能力，成功将黑太狼带出去，众羊却只能眼睁睁看着他们离开。

灰太狼为了不让父亲黑太狼消失便不舍得他回去，但这又会使世界重置，于是他陷入两难抉择。在寻找黑太狼的过程中，灰太狼见父亲想要守护自己，心生感动，也想守护父亲，便决定选择隐瞒小羊，偷偷将父亲留下来。

黑太狼藏身羊村，灰太狼引开众羊寻找父亲。小狼人诱惑灰太狼与其合作，但就在两人抬着以为藏有黑太狼的箱子离开羊村时，却与小羊们碰上。羊狼抢夺箱子正酣，黑太狼这才现身。最终灰太狼为了带走父亲，“背叛”了小羊。

灰太狼答应与小狼人合作，将众羊带到狼堡，随后一同前去安全屋，躲避世界重置。但殊不知小狼人出尔反尔，中途易容成灰太狼的模样，将小羊捉起，借此离间小羊与灰太狼。原来，小狼人合作是假，阻止灰太狼拉拢小羊是真。

黑太狼藏身羊村，灰太狼引开众羊寻找父亲。小狼人诱惑灰太狼与其合作，但就在两人抬着以为藏有黑太狼的箱子离开羊村时，却与小羊们碰上。羊狼抢夺箱子正酣，黑太狼这才现身。最终灰太狼为了带走父亲，“背叛”了小羊。

小羊们被困起来，小狼人拿着脱发水想要为逗逗报仇，幸得灰太狼进来解救，黑太狼想要吃羊，也被灰太狼制止了，当晚黑太狼再过来吃羊之时，却发现小羊被救走了。在逃跑过程中，小羊们发现小狼人竟然是逗逗的哥哥！

鱼逗逗向大家解释兄弟俩的故事，正逢时空即将重置，草原陷入混乱。羊狼默契合作被黑太狼看在眼里，喜羊羊更在危机之际不放弃黑太狼，这些令黑太狼的心里起了变化。时空越来越混乱，但鱼淘淘仍不死心地抓走了黑太狼。

灰太狼知道自己一直被骗后，和小羊一起阻止淘淘的计划。但淘淘用升级的天狼号打败众羊，黑太狼还把灰太狼推下车。灰太狼难过父亲的无情，但其实黑太狼是打算独自对抗淘淘。最终黑太狼成功阻止淘淘，并主动提出回到自己的时代。

黑太狼要求回去，灰太狼与黑太狼告别却不敢面对黑太狼。淘淘为了阻止黑太狼回去与逗逗合体，击倒小羊。危机时刻，逗逗清醒阻止淘淘令小羊有可乘之机离开，黑太狼成功回到原本的时空，狼羊以为一切结束却发现被困。

虽然把黑太狼送回去了，众狼羊却被困在了中转站，因此危机仍未解决。淘淘正得意时，却发现逗逗冒着危险去帮助狼羊打开时空门。可时空重置已经开始，大家逃到安全屋时，慢羊羊和红太狼却因躲避不及在大家面前被重置。

世界已经重置，时间也回到了食人鱼族群存在之时，淘淘兴奋不已，却没料到一番意外，食人鱼族群再次被冰封，逗逗也遭遇不幸。为了完成逗逗遗愿，淘淘和小羊们合作，扭转时空钟面，逆转时间，一切都回到了最美好的时候。