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一番星雷为寻找宇宙某处宝物“究极的战斗之魂”而旅行。同伴是小龙无限和机器人索尔特。平时悠闲轻浮的雷，在战斗场上变身超帅零。为求究极战斗之魂情报，顺路去的卡牌战斗站里，统管宇宙的弥勒成员流星基里加到来。雷立刻想挑战。

一番星雷挑战赌上显示宇宙最强战斗之魂所在地宇宙罗盘的战斗，变身为灼热零。对手是弥勒手下银河三羽鸦之一哈西布托。零发动“究极齐格弗里德”的究极触发！

拥有显示究极战斗之魂所在地宇宙罗盘的陆和莱拉，与高明卡牌探索者一番星雷踏上寻宝之旅。另一方面，盯上罗盘的弥勒手下银河三羽鸦，唆使银河七将之一邪眼阿尔梅达，计划夺走罗盘。

行星冈洛克的另一位银河七将强推的戈因在开采水晶的矿山带走镇上孩子父亲强制劳动。被委托救出的雷寻找戈因，却中戈因们设下的陷阱，被关在坑道。

雷做了梦。在暴风雪中有什么呼唤他的不可思议梦。当天，魔法明星咲的节目发出“行星冰立方发现究极水晶”的魔法情报。

零与渡边战斗，但无法抽到得到的“究极齐格弗里登”。另一方面，银河七将首领晓之巴吉拉的船被偷。偷的是女海贼明之明星艾莉丝部下加鲁博。

雷在行星冰立方与真心朋友河童托诺再会。托诺是海洋运动有名的行星贾古奇王子。但被闯来的弥勒手下用战斗之魂击败，星之宝物青把手被夺走。

托诺战斗输了，行星贾古奇宝物要被巴吉拉夺走。雷为不让夺走向巴吉拉挑战。但银河七将挡在前面。雷接受与银河七将赌上巴吉拉重要腌菜收藏和究极的战斗。

托诺把度假行星绿色冰沙的招待券送给雷等人，回贾古奇。到达行星的雷等人一边避开巨大昆虫袭击，一边享受稍奇怪的休假。但雷重要的究极牌组被神秘大蜘蛛偷走。

度假中的雷等人遭神秘大猩猩军团（路人炸弹）袭击，莱拉被掳走。此时，变装的银河三羽鸦出现，告诉他们森林深处野生王国的事，以及莱拉被掳去当森林之神祭品。

究极水晶被行星绿色冰沙的暗黑神炸弹和翻译鸟香蕉带走。雷等人为夺回究极水晶追赶炸弹。

基里加被弥勒命令夺来雷等人的宇宙罗盘。一番星号下一目的地是通往第二阶层的传送点，流星号抢先前往。

因无限买了魔法明星咲的超稀有限定手办，钱没了。雷等人在顺路去的卡牌站找工作。

魔法明星咲担任行星ASAKUSA警署署长之日。银河三羽鸦绑架了魔法明星咲。魔法明星咲大粉丝的无限大怒！

一边训斥不会整理的弟弟陆一边打扫的莱拉，因吸尘器暴走把陆的收藏卡弄散。生气的陆说“姐姐睡觉时也放屁给人添麻烦！”飞出一番星号。

为找船之墓场的宝藏，一番星号来到萨尔加索宙域。被薯条连锁店炸薯条吸引，雷等人顺路进去，但客人表情阴沉，店内全员都因战斗之魂输给流星基里加，被夺走所有随身牌组。

一番星号抵达据说有宝藏的船之墓场。此时，过去索尔特乘坐过的海贼船COWCOW号出现。船长吉和船员塔达因紫究极水晶诅咒变成幽灵。

一番星号被萨尔加索中心巨大水槽吞没。那里有萨尔加索之主萨尔加索魔神。对满心要找到究极战斗之魂的陆，魔神寂寞地说“也有找不到的东西”。

基里加拜访少女法莉。法莉父亲是基里加朋友，父亲死后一段时间音讯不明的基里加再会时已失去记忆。同时，来到卡牌站的雷与曾对战过的里德尔再会并开始战斗之魂。

因冷披萨和冰杯可乐身体过冷的雷，每次打嗝都会咕噜咕噜变成各种零。在青色行星再会艾莉丝等人面前也变色。这症状医学无法治愈。

来到行星蓝石青沙漠的雷等人，为前往有究极水晶的混沌神殿决定雇向导。出现的是扮成沙漠向导的银河三羽鸦，以及导游科林和汉宗郎。

被“究极亚历山大”以“那你就好了”选为第二张卡主人的雷无法释怀。雷决心“赌上自己的强大”用战斗展示实力。锁定汉宗郎的雷变身绀碧零。

行星卡奇多尼亚是因阿里恩斯家与特伦斯家之争分裂成两半的奇妙星球。在站里听到经过的雷向阿里恩斯老大提议雇自己当保镖。另一方特伦斯家的保镖是流星基里加。

雷邀请基里加加入寻找究极战斗之魂的同伴。基里加留下意外回答“我考虑一下”离去。从汉宗郎处得到紫究极牌组的弥勒，使用从基里加处收到的里银河文书。

通往第三阶层的大门站被破坏。为问出破坏者名字，灼热零与弥勒手下汉宗郎战斗。在弥勒身边观看战况的鲁基诺斯觉得零眼熟。

雷得到担负守护的三龙神之一柱。艾莉丝和基里加寻找剩余二柱。另一方面，一番星号终于到达第三阶层。为吃名产螃蟹披萨前往行星卡尼梅德。银河三羽鸦预料到并在等待。

雷想寻找弥勒下落，伊安告诉他已在弥勒身上装了发信器。另一方面，艾莉丝遵从心中呼唤声，前往能听到那声音的行星。感知到究极气息的弥勒追踪艾莉丝的维纳斯号。

寻找三龙神究极之一的基里加到达六色星云。确认了取回记忆觉悟的“究极射手阿波罗龙”放出耀眼光与风，变身为卡，收进基里加的牌组。

基里加来到海洋行星。法莉和萨曼莎到来。法莉给基里加看旧相册，说也许能成为记忆线索。此时，作为弥勒追兵而来的汉宗郎向基里加挑战，要求交出船、牌组和一切。

能与魔法明星咲共演的索尔特来到秘境行星。咲邀请一番星号全员参加节目收录之旅“大家一起出发！”。梦想与咲两人约会的索尔特失望。秘境密林中，雷胸口的究极符号产生反应，发生雾。雾中龙眼发光。

一番星雷终于制霸战斗之魂六色。此时，艾莉丝等人的维纳斯号被气体星云吸引。从船中飞出的巧克力吹散星云气体，其中出现巨大的究极水晶。

弥勒叫出狮子座里十二宫Brave使者，派往秘境行星。另一方面，魔法明星咲回去了，索尔特意气消沉。陆提议用秘境行星的稀有食材做披萨送给她。

雷与艾莉丝合流。下一个目标是第四阶层。但在此之前必须夺回被抢走的宇宙罗盘。雷向陆约定绝对取回。此时，莱拉说出要拜艾莉丝为师。

一番星号收到SOS。发信者是希望救鹤嘴、鹤嘴锄和渡的哈西布托。雷等人虽犹豫，但被告知归还宇宙罗盘，便前往救援。渡因偷魔法明星咲的宝物周边被逮捕。

依靠法莉父亲留下的线索，基里加等人等待巨大彗星“彗彗彗星”，并尝试用流星号进入出现的彗彗彗星。另一方面，雷等人追踪带走宇宙罗盘的银河三羽鸦前往卡牌战斗站。

为要回“宇宙罗盘”，雷等人追踪银河三羽鸦，却让他们逃了。竟然潜入地下。雷称赞“虽是敌人但干得漂亮”，无限生气，大吵一架。飞出一番星号。

为取回正义杯优胜奖品“宇宙罗盘”，雷等人前往行星贾斯蒂斯。主办大会的是贾斯蒂斯立花。作为嘉宾登场的魔法明星咲也宣言参战。雷等人为取回而出场。

大会进行到半决赛，第一场对战是银河三羽鸦之间的对决。鹤嘴扔下护目镜，进入绝对要赢的认真模式。另一方面，雷进入第二场半决赛。若突破，决赛将对战其中一人……

里十二宫Brave使者德内波拉挡在雷面前，说若不在正义杯优胜奖品宇宙罗盘上赢自己就不交给他。贾斯蒂斯对突然行动面露难色，但雷干劲十足地接受。

雷等人为寻找某物追踪弥勒。弥勒出现在汉宗郎面前。围绕召唤里十二宫Brave使者的里银河文书石板，决心反抗弥勒的汉宗郎，赌上究极使者的骄傲向弥勒挑战。

捡到汉宗郎的雷等人与基里加们所在的宝藏号合流。与雷交换了“究极亚历山大”和“究极奥丁”的基里加，建议雷把牌组放入宝藏号舰桥的插槽。

到达第四阶层的宝藏号收到两个SOS。基里加和雷分别乘船前往救援，弥勒侵入宝藏号。艾莉丝赌上自己的牌组和弥勒的宇宙罗盘对战。

回到弥勒号的银河三羽鸦害怕弥勒，密谈逃跑。但弥勒阴森笑道“闭嘴跟着来”。另一方面，被引出的基里加与将掳走的法莉和萨曼莎安置在观众席的德内波拉对峙。

雷的一番星号和基里加的流星号前往行星基萨拉姆。将究极战斗之魂探索交给艾莉丝等人，两人急行阻止弥勒。但弥勒终于让奈克斯的实体出现。

莱拉和陆鼓励雷：“如果弥勒是真心朋友，把他变回来才是真心朋友。”宝藏号朝着究极战斗之魂出发，弥勒号追踪其后。宝藏号到达目的地，出现由无数战斗之魂卡构成的巨大墙壁。

雷和基里加决心阻止奈克斯。宝藏号全速冲向奈克斯，却被宇宙风暴阻挡。雷试图说服与奈克斯融合的弥勒。

宇宙风暴中，宝藏号前往奈克斯。基里加为封住敌人攻击，与伊安一起乘流星号迎战。

宝藏号冲入奈克斯，但船体出现裂纹。此时，祈祷的人们所持的卡离开手中，飞临宝藏号周围。

奈克斯召唤出Brave魂体。零被削减生命只剩1点，奈克斯正要一口气给予致命一击。