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明治30年，在怪异现象频发的东京，真打津轻在一个能让观众观看怪物们自相残杀的小屋中工作，他被称作「妖鬼杀手」。这天，一位只有头颅的美少女——轮堂鸦夜，带着她的女仆——驰井静句来到他的面前，她的目的是……

由鸦夜、津轻、静句三人所组成的「鸟笼使者」一行人以专查怪物的侦探而闻名。某天，他们接到了一个案件调查的委托。那是一个在法国的东部所发生的，人类亲和派的吸血鬼被杀害的案件。

「鸟笼使者」一行人继续调查发生在戈达家的吸血鬼谋杀案。鸦夜怀疑这起案件为内部人员所犯下的，于是便询问戈达家所有人在事发当下的行动。然后，他们便和戈达勋爵一同前往西部的森林……

鸦夜在知晓杀害汉纳戈达的凶手究竟是谁后，将戈达一家和他们的佣人召集了起来。她在一一解答疑问的同时，解开一个又一个的谜团，最后锁定出了凶手。这起滑稽悲惨的闹剧事件，背后的凶手究竟是——

1989年，伦敦。铁人福克收到了年轻的怪盗亚森罗苹的预告信，信上写说他将偷走人造的黑钻石「倒数第二个夜晚」，于是福克便向两名侦探发出了委托。他委托的是世界上最厉害的侦探夏洛克福尔摩斯，以及身为「鸟笼使者」的鸦夜等人。

罗苹试图接触「倒数第二个夜晚」的主人菲莱斯福克所委托的侦探福尔摩斯。另外，他也意外地遇到了「鸟笼使者」一行人。随着罗苹所预告的时间越来越近，他们各自在福克的宅邸中等待着罗苹的袭击。

存放有「倒数第二个夜晚」的余罪之间里流入了大量的水。在居室内的所有人皆陷入了绝处逢生的情况。然后，保险箱就消失了……但是，单独行动的「鸟笼使者」一行人却有一个「秘密计划」。

伺机夺取「倒数第二个夜晚」的，并非只有罗苹。随着爆炸而一同出现的五人犯罪集团「夜宴」。詹姆斯莫里亚蒂也是其成员之一，他之前曾与鸦夜有过一段渊源……「倒数第二个夜晚」究竟会落入谁的手中……

在德国的深山里，有一座名为霍伦多夫村的村庄。当「鸟笼使者」一行人抵达时，该村庄正发生了女孩露易丝失踪的事件。自一年多以来，这个村庄就不断地发生着人狼杀害女孩的谋杀事件……

为了知晓如何使用「倒数第二个夜晚」来寻找人狼的村落，「鸟笼使者」一行人便开始调查发生在霍伦多夫村的少女连环谋杀案。听到了人狼村的传闻后，劳合社也出现在了村庄当中。然后，夜色正浓时，人狼又再次展开了行动……

静句在与人狼战斗时从瀑布坠落，而诺拉、薇拉和卡雅这三个人狼少女救了从悬崖坠落的她。此时，鸦夜和津轻正带上劳合社的人前往人狼村，而「夜宴」也正在观察着他们的行动……

静句被怀疑是杀害诺拉的凶手。另一方面，「夜宴」的维克多带走了鸦夜和津轻，并向他们提出了某个交换条件。当两人抵达人狼村沃尔芬赫雷后，他们终于见到了静句。此时，他们也开始为解决事件而行动……

霍伦多夫的村民攻进沃尔芬赫雷，而「夜宴」也与劳合社发生冲突，静句也与她的宿敌卡蜜拉再次交战。同时，鸦夜召集了沃尔芬赫雷与霍伦多夫的村民，并开始解开这两起事件的谜团──