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Abby Mills vuelve a Harper´s Island para celebrar la boda de su mejor amigo, Henry Dunn, y su prometida, Trish Wellington. Abby no había vuelto a su casa en siete años, desde que su madre y otras cinco personas fueron asesinadas por John Wakefield.

Los invitados a la boda participan en un juego buscando tesoros escondidos. Por otro lado, Trish se encuentra con un antigüo amor. Henry habla con los habitantes de la isla y Abby se encuentra con una amiga que fue perseguida por John Wakefield.

Cuando la muerte de una chica de la isla es tratada como un suicidio, Abby reta a su padre, el Sheriff, a investigar qué es lo que realmente sucedió. La boda está cada vez más cerca y Trish debe tomar una decisión sobre Hunter.

Los padrinos de boda llevan a Henry a pescar en su despedida de soltero y hacen un descubrimiento macabro. Las damas de honor celebran la despedida de soltera de Trish con un medium, que reacciona muy bruscamente al conocer a Abby.

Un paseo en bicicleta por el bosque entre padre e hija conduce a una revelación sorprendente. Abby descubre la secreta obsesión del Sheriff y el ensayo de boda entre Trish y Henry toma un giro inesperado.

Con los invitados de la boda ya recuperados tras los mortales sucesos del ensayo, Abby, Henry y JD deciden poner el asunto en sus manos para intentar resolver el asesinato.

Los invitados a la boda comienzan a prepararse para dejar la isla, pero el Sheriff sospecha que uno de ellos es el asesino. Parte de la información revela una misteriosa conexión entre Abby y Wakefield.

Cuando los invitados ya estaban preparados para salir de la isla, uno de ellos desaparece misteriosamente. Abby recibe una llamada telefónica de alguien que amenaza con matar al desaparecido si alguien sale de la isla.

Entre el grupo crece la tensión y todos se culpan entre sí. Pero encuentran un mapa y esto les fuerza a unirse para encontrar a Madison.

Un intento por salir de la isla después de que Katherine ha sido asesinada se convierte en un desastre que mantendrá al resto de invitados atrapados por ahora. Mientras tanto, descubrirán un secreto y 4 nuevas víctimas serán reclamadas.

Abby se enfrenta al asesino, pero los invitados empiezan a pensar que puede ser su cómplice. Otro invitado muere y otro más desaparece.

Ocho de los sospechosos luchan por sobrevivir mientras se descubre la verdad.

Las respuestas se dan a conocer finalmente en el último episodio de la temporada.