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Después de la muerte de Shizuka Hio, la paz se restablece en la academia. Pero cuando regresa Zero, los vampiros del Senado lo acusan de asesinato.

Yuki tiene muchas cosas en la cabeza después de casi ser besada por Zero. Ella afirma que no hablará con Kaname hasta que él admita la inocencia de Zero.

La clase nocturna va a la casa de vacaciones de la familia Aido durante el largo receso, pero Hanabusa decide quedarse en la academia para investigar a Kaname.

Mientras la clase nocturna está en la casa de vacaciones de la familia Aido, Yuki, impulsada por su deseo de dejar de lastimar a Zero, trata de recuperar su memoria del pasado.

Yuki es continuamente perseguido por visiones de sangre. Sin embargo, está decidida a descubrir su pasado a través de Kaname.

Kaname le pide a Yuki que sea su amante. Los guardias de la Clase Nocturna comienzan a acompañarla a todas partes, y Yuki no puede ocultar su vergüenza.

Senri regresa a la Academia, pero al tener una conversación confidencial con Ichiru, se vuelve notablemente diferente de antes.

Yuki despierta a un vampiro y vuelve a recordar su infancia. Ahora recuerda a su padre, su madre y su hermano.

Yuki ahora comprende quién es ella en realidad. Preocupada por Zero, ella se escapa de su habitación para encontrarlo, pero él simplemente no puede aceptar en lo que se ha convertido.

El director pide una evacuación de emergencia de los estudiantes de la clase diurna, ya que los sirvientes vampiros de Rido comienzan a atacar a los estudiantes.

Para proteger la academia, el Director se enfrenta al jefe de la Sociedad de Cazadores mientras Rido todavía está alborotado.

Yuki decide que, como guardiana, debe proteger a todos los estudiantes de la academia y luchar contra Rido.

Toda la fuerza de Zero no es suficiente para matar a Rido, necesitará la ayuda de Kaname. Pero la pelea dejará devastada a Cross Academy.