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Depois da morte de Shizuka Hio, a paz volta à Academia. Mas quando Zero regressa, os vampiros do Senado acusam-no de ter assassinado Shizuka.

Yuki tem muito em que pensar, sobretudo depois de quase ter sido beijada por Zero. Mais tarde, decide que não falará com Kaname até que este admita a inocência de Zero.

A classe noturna vai para a casa de férias da família Aido durante as férias escolares, mas Hanabusa decide ficar na Academia para investigar Kaname.

Enquanto a classe noturna está na casa de férias da família Aido, Yuki, levada pelo seu desejo de parar de magoar Zero, tenta recuperar as suas memórias do passado.

Visões de sangue não param de assombrar Yuki. Não obstante, ela está determinada a fazer Kaname contar-lhe mais sobre o seu passado.

Kaname pede a Yuki para ser sua namorada. Os guardas da classe noturna começam a acompanhá-la por todo o lado e Yuki não consegue esconder o seu constrangimento.

Senri regressa à Academia, mas depois de ter tido uma conversa confidencial com Ichiru, torna-se visivelmente diferente do que era antes.

Yuki transforma-se num vampiro e recupera a memória da sua infância. Agora, recorda-se do pai, da mãe e do irmão.

Yuki percebe agora quem realmente é. Preocupada com Zero, foge sorrateiramente do quarto para ir à sua procura, mas ele simplesmente não aceita quem ela é agora.

Quando os servos vampiros de Rido começam a atacar os alunos, o diretor ordena uma evacuação de emergência dos alunos da classe diurna.

O diretor confronta o chefe da Sociedade dos Caçadores com o intuito de proteger a Academia, enquanto Rido continua à solta.

Yuki decide que, na qualidade de guardiã, tem de proteger todos os alunos da academia e enfrentar Rido.

A força de Zero não é suficiente para matar Rido. Ele terá de pedir ajuda a Kaname, mas a luta provocará a destruição da Academia Cross.