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Un pilote de la seconde guerre mondiale, qui avait disparu en 1947 après avoir survolé le dangereux archipel du Triangle des Bermudes, réapparaît dans l'Utah, en 1997, pourvu de pouvoirs spéciaux...

Adam, après avoir piraté une base de données de la NSA, retrouve l'adresse d'un certain Louis Faraday, un chercheur rejeté par la communauté scientifique pour ses théories fantaisistes sur la gravité. Il tente de le convaincre de poursuivre ses recherches qu'il avait abandonnées en lui faisant comprendre qu'il fait partie des rares personnes capables de sauver l'espèce humaine de son extinction...

Adam entre dans une ancienne base militaire pour s'emparer du cristal qui crée l'arc-en-ciel du diable. Car, entre de mauvaises mains, ce cristal peut être une arme redoutable. Selon lui, les humains ne sont pas en mesure de s'en servir. En chemin, il croise la route de Charlie, sa petite-fille...

Pour échapper à un père violent, Danny a trouvé refuge auprès de la secte de l'Oméga à Los Angeles. Secte qui attend le signal d'un vaisseau qui viendra les sauver... Adam tente de convaincre le jeune homme qu'il n'existe pas de vaisseau mais que ses recherches sur les ondes cérébrales peuvent changer le monde...

Adam capte un message venant de l'espace qui provoque en lui de violents maux de tête. Le Dr Alex Burton, qui s'apprête à envoyer un radiotéléscope dans l'espace, est le seul pouvant déchiffrer ce message...

La traque de McArthur conduit le colonel Vise et le FBI jusqu'à un certain Ben Proctor, qui travaillait en 1967 sur des fragments d'origine extraterrestre. Fragments qu'Adam doit trouver avant qu'"ils" n'arrivent...

On fête Halloween dans la petite bourgade de Mill Lack dans l'Oregon. Un animateur de radio déjanté, persuadé que la guerre des mondes est pour bientôt, voit un vaisseau spatial atterrir devant sa fenêtre. Paniqué, il lance un appel à l'aide à la radio. McArthur est dans les parages pour "leur" dire qu'il ne veut pas partir avec "eux"...

Constance MacArthur, l'épouse de Adam, est mourante. Ce dernier se rend à son chevet, dans un hospice à St Petersburg, mais le FBI l'y attend pour le coincer... A Mill Lake, un champ de force impénétrable fait office de bouclier... L'individu arrivé avec le vaisseau spatial retrouve la trace d'Adam en suivant Charlie Dalton qui va voir sa grand-mère à l'hospice...

Démobilisé parce qu'il ne contrôle plus la situation, Vise est hanté par le souvenir d'amis kidnappés sous ses yeux impuissants par des extraterrestres. Il veut se venger en éliminant MacArthur qu'il croit être un extraterrestre... L'étranger venu de l'espace est Michael O'Ryan, le meilleur ami de Vise autrefois kidnappé. Il veut ramener Adam à la colonie, mais ce dernier tient à rester sur terre pour essayer de sauver l'humanité de la fin qui l'attend...

Le colonel se rend alors à la prison pour tuer MacArthur. Mais Michael intervient et essaie de convaincre son ex-meilleur ami de les laisser partir. Tandis que les deux hommes échangent des balles, MacArthur parvient à s'échapper. Michael meurt à la suite de ses blessures...

A la recherche de Randall Craig, qui pourrait l'amener sur les traces de son fils Jason, Adam croise le chemin de Laura, une jeune femme célibataire et enceinte. Il fait également connaissance du grand-père de celle-ci, le professeur Wayland Scott, qui a consacré 20 ans de sa vie pour mettre au point un accélérateur de particules. Adam comprend que ce détour, qui l'éloigne momentanément de sa route, est une occasion pour lui de réconcilier une jeune femme et son grand-père. Mais le temps est compté : le Pentagone et le FBI arrivent à Waring, dans le Dakota du Sud, la ville natale de Vise...

McArthur essaie de convaincre Magnolia, une voyante, que ses visions ne vont pas forcément se réaliser, qu'il est possible de changer le futur. Ensemble, ils vont alors tenter d'éviter une catastrophe dans les locaux de l'institut pharmaceutique Climmings, qui fait des expériences sur des cerveaux humains...

Sur le point d'être arrêté par Vise et le FBI, McArthur est aspiré par un vaisseau spatial. En essayant d'intervenir, Vise est gravement blessé. A bord du vaisseau, Adam est confronté à la rancoeur des siens qui l'accusent d'avoir mis la Colonie en danger vis-à-vis des extraterrestres...