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Megumi vive in un piccolo villaggio, in cui i suoi unici interessi sono il compagno di classe Natsuno Yuuki e una casa in stile europeo sulla collina. Un giorno, mentre si avvicina alla casa sulla collina, sparisce.

Mentre Toshio, il medico del villaggio, cerca di scoprire le cause della morte di Megumi, si verificano altre morti nella zona. Toshio e il monaco decidono di investigare su queste misteriose morti.

Un altro abitante del villaggio mostra sintomi dell'epidemia, ma Toshio nota un nuovo indizio durante un'ispezione. La famiglia che si è appena trasferita comincia a mostrarsi in città, mentre la figlia mostra un interesse disturbante per Seishin.

Mentre il bilancio delle vittime aumenta, Toshio e il suo staff si riuniscono per esaminare la situazione delle morti. La misteriosa ammiratrice di Seishin ritorna con un'affermazione che la mostra stranamente saggia per la sua età.

Dopo aver visitato i familiari dei deceduti, Seishin scopre una cosa in comune con ogni vittima. Natsuno è torturato dall'impotenza mentre le visioni di Megumi si avvicinano in modo spaventoso alla realtà.

Toshio è sempre più frustrato perché non trova una cura per l'epidemia che si sta diffondendo in città. Convinto che Megumi sia rinata dalla morte, Natsuno fa delle ricerche in biblioteca.

Quando gli amici di Megumi pensano che in casa Kanemasa ci siano delle attività sinistre, Natsuno suggerisce di scavare nella tomba di Megumi per cercare delle risposte.

Natsuno, Akira e Kaori aprono la tomba di Megumi per provare la loro teoria. Intanto le recenti spiegazioni del dottore fanno sospettare Seishin della ragazzina di Kanemasa.

Toshio e Seishin restano nella clinica durante la notte a sorvegliare la paziente, per cogliere sul fatto eventuali visitatori notturni.

I sospetti di Toshio e Natsuno si rivelano veri. Gli Okiagari, le creature che si cibano della vita delle persone, hanno nel mirino Natsuno.

Mentre gli abitanti del villaggio discutono sulla causa delle frequenti morti, la sciamana punta il dito contro i residenti di Kanemasa.

Dopo l'attacco di Toru, Natsuno avverte Kaori e Akira dicendogli di scappare dal villaggio, prima che vengano colpiti anche loro.

La popolazione del villaggio si riduce sempre di più, mentre gli Okiagari continuano a fare vittime, compresa la moglie di Toshio. Ormai privo di forze, Natsuno invita Toru per un ultimo pasto.

Il padre di Kaori collassa durante la notte. Nella clinica, Toshio studia il corpo di sua moglie per trovare indizi su come combattere gli Shiki.

L'obiettivo degli Shiki è di tenere il resto del paese all'oscuro delle morti a Sotoba. Quando Toshio minaccia di smascherarli, un membro della villa Kanemasa gli fa visita.

Sunako convoca Toru alla villa Kanemasa per raccontargli la sua storia. Kaori e Akira decidono di contrattaccare quando anche la loro madre viene attaccata.

Mentre gli Shiki continuano a colpire gli abitanti del villaggio, Seishin finalmente fa la sua mossa. Una notte alla clinica, Toshio riceve una visita.

Tatsumi va a trovare Natsuno, dopo il suo ritorno dalla morte. Sperando di divertirsi nei suoi ultimi giorni di vita, Toshio porta la signora di Kanemasa al festival del villaggio.

Gli abitanti del villaggio si riuniscono in gruppo per liberare la città dagli Shiki. Intanto Tatsumi ragiona sul da farsi con Sunako.

Toshio guida gli abitanti del villaggio che sono rimasti in vita, in una caccia contro gli Shiki, ma c'è ancora un posto in cui non hanno controllato.

Gli abitanti del villaggio scoprono l'ultimo nascondiglio degli Shiki, e la guerra si avvicina alla fine, ma rimangono ancora due dei Kirishiki.

Sunako cerca di scappare, mentre Tatsumi viene fermato da Natsuno. Intanto a Yamairi scoppia un incendio, che rischia di diffondersi per tutto il villaggio.