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Una grave minaccia incombe sulla Terra: un'orda di Oni, i demoni cornuti, invadono la terra con eserciti di mostri e bestie combattenti. L'unico baluardo a difesa dell'umanità è l'esercito di Getter Robot realizzati dal dottor Saotome, un brillante scienziato scopritore dell'energia Getter, in grado di alimentare gli automi combattenti. I demoni però sono più ostici del previsto e i Getter Robot vengono spazzati via. Il professore allora capisce di essere giunto ad un punto di svolta: è necessario reclutare una nuova squadra di piloti che non siano persone qualsiasi ma uomini dotati di uno spirito combattivo fuori dal comune per un nuovo progetto sperimentale. Grazie a fedeli collaboratori, Saotome raccoglie informazioni su potenziali candidati, scelti fra i migliori nel loro campo. Il primo scelto è Ryoma Nagare, un teppista da strada, abile nelle arti marziali e temibile nel corpo a corpo. Il giovane viene messo alla prova da tre killer professionisti che, nonostante il vantaggio dell'agguato e del sovrannumero vengono sterminati. Al termine del combattimento il giovane viene narcotizzato e portato alla base, il Laboratorio Saotome: il primo pilota è stato reclutato. Ryoma si sveglia in una stanza asettica, chiedendosi dove si trova ma non impiega molto a sfondare la porta e fuggire nei meandri dell'istituto. Vagabondando per sfuggire alle guardie, si ritrova in un tetro laboratorio dove in capsule criogeniche vengono custoditi i cadaveri di terribili mostri. Il ragazzo, terrorizzato, viene sorpreso da Saotome che lo illumina sulla situazione. La terra, che lui ci creda o no, è stata invasa da terribili esseri, gli Oni, che intendono spazzare via la razza umana e ciò che vede sono i corpi di alcuni di loro, attualmente oggetto di studio. Il giovane non ha tempo nemmeno per stupirsi o lamentarsi: gli Oni hanno invaso il Laboratorio e fanno strage del personale. Lo spirito combattivo di Ryoma non tarda a emergere e, nonostante il terribile asp

Una banda di terroristi irrompe nel Centro di Controllo dell'Agenzia di Difesa gaipponese e dopo aver sterminato brutalmente gli occupanti, carpiscono informazioni da un moderno computer. I dati riguardano un'arma segreta che si trova presso un'avanzata base difensiva chiamata Laboratorio Saotome. I guerriglieri tentano di infiltrarsi nell'installazione per carpirne i segreti più interessanti: a capo del manipolo c'è Hayato Jin, individuo misterioso, calcolatore e dal cuore freddo come il ghiaccio. Ma nulla sfugge al professore Saotome: il giovane ribelle infatti è fra i candidati per diventare membro della nuova formazione Getter. Ryoma si occupa del comitato d'acoglienza: con un breve corpo a corpo spazza via la banda di terroristi e si prepara ad affrontare il loro capo, tutt'altro che impressionato. Dopo una breve battaglia alla pari ecco qualcosa in grado di scuotere l'animo di Hayato: un'orda di demoni torna alla carica del laboratorio e minaccia i due umani. Dopo un'iniziale incertezza i due combattenti, prima avversari, si ritrovano alleati contro i terribili mostri che vengono presto sconfitti. Ma come già è successo i problemi non vengono mai soli: ecco arrivare una tremenda bestia meccanica che attacca il nuovo laboratorio di Saotome, ricostruito dopo il primo attacco nemico. Ryoma sa già qual'è il suo compito e coinvolge anche Hayato, reclutato suo malgrado nella lotta contro gli Oni. Il primo sale a bordo della navetta rossa, l'Eeagle, il professore, indossata la tuta da battaglia, sale sulla navetta gialla, il Bear, e Hayato, indossato un casco tecnologico capace di trasmettere le conoscenze necessarie al pilotaggio, viene messo sulla navetta bianca, il Jaguar. I tre mezzi decollano dalla base e, combinati assieme, danno vita al nuovo Shin Getter Robot. Agile, efficace e devastante, il nuovo mezzo dei terrestri riesce ad avere la meglio sul mostruoso essere biomeccanico e cogliere nuovamente la vittoria sull'invasore.

Il monaco Benkei Musashibo si allena in pratiche ascetiche, ma un giorno i suoi fratelli e il suo maestro si trasformano in demoni e mirano alla spada in suo possesso. Ryoma è mandato dal professor Saotome a cercare il monaco, ma si schianta in mezzo ai monti.

Il laboratorio è attaccato da un misterioso mostro rampicante con radici esplosive che viene apparentemente sconfitto con facilità dal Getter Robo. I piloti faticano ancora a cooperare tra loro per incompatibilità caratteriali.

Uno dei demoni giganti affrontato dal Getter Robo scompare entrando in un vortice di luce. Ryoma vuole sapere dove fuggano sempre i demoni e decide di seguire il consiglio del professor Saotome e di gettarsi al loro inseguimento.

Dopo essere stati trascinati nel vortice di luce, Ryoma, Benkei e Hayato si risvegliano nel periodo Heian, dove Ryoma fa la conoscenza del famoso comandante Minamoto no Raiko.

Hayato e Benkei riesumano il Getter Robo dalla montagna sotto cui era sepolto, ma senza Ryoma il robot non riesce a sprigionare la sua totale forza.

Il Getter Robot affronta i demoni giganti evocati da Abe no Seimei. Nel frattempo, Raiko sferra un assalto all’oscura capitale Heian, portando con sé le truppe a bordo delle sue aeronavi.

Sono passati tre anni da quando il Getter è scomparso nel lago Biwa e, quando fa il suo ritorno improvviso, i membri del laboratorio del Professor Saotome sono scossi e lo attaccano credendolo un nemico.

Dopo la visione infernale del futuro, Ryoma torna a Tokyo dove incontra vecchie conoscenze. Seimei, però, appare proprio nella città alla guida di un demone gigantesco e inizia a causare distruzione ovunque.

Continua la battaglia del Getter Robo contro Abe no Seimei, ma Benkei inizia a nutrire seri dubbi sul fatto che il Getter Robo sia la salvezza dell’umanità. All’improvviso, nei cieli sopra il laboratorio quattro misteriose figure fanno la loro apparizione.

I Quattro Re Celesti continuano ad attaccare il laboratorio, ma il Professor Saotome invia i prototipi dei Getter ad affrontarli. Intanto, Ryoma e i suoi compagni devono liberare il Getter Robo dalle macerie per partecipare allo scontro finale.

Il Getter Robo continua la battaglia contro i Quattro Re Celesti grazie all’energia ricevuta dal professor Saotome, ma Tamonten si getta nelle profondità del laboratorio, dove incredibilmente c’è un varco che conduce a un’altra realtà spaziotemporale.