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Jesse è scosso da visioni di un futuro apocalittico mentre lui e Tulip si preparano ad assaltare il Masada, dove Cassidy, condannato a tormenti senza fine, cerca di resistere con tutte le sue forze. Ma Starr e i suoi soldati del Graal sono pronti ad accoglierli.

Dio inizia a posizionare le pedine della Sua Apocalisse al loro posto, mentre Jesse parte alla ricerca di una misteriosa formazione rocciosa che potrebbe essere l’ultima tappa del suo cammino. Nel frattempo, Tulip escogita un piano disperato per cercare di salvare Cassidy dalla sua tortura senza fine.

Con il suo tentativo precipitoso di salvare Cassidy, Tulip potrebbe essere finita dalla padella alla brace e deve affrontare la sua paura più grande: un ricovero psichiatrico. Cassidy, vedendo svanire le sue speranze di fuga, riflette su decisioni prese cento anni fa. Nel frattempo, il Santo degli Assassini è alle costole di Jesse.

Tulip unisce le forze con Gesù Cristo per discendere nei sotterranei del Masada e liberare Cassidy, o quanto ne è rimasto. Nel frattempo, la missione di Jesse in Australia rischia di finire prima ancora di iniziare: ripresosi dal naufragio dei suoi viaggi, scopre di essere alla deriva.

È il momento dei ritrovi: Tulip raggiunge finalmente Cassidy ed Eugene il suo Predicatore, anche se il loro incontro rischia di essere interrotto dalla furia sanguinaria del Santo degli Assassini. Nel frattempo Starr fatica a tenere traccia di tutti gli attori dell’Apocalisse mentre i piani del Graal rischiano di andare in fumo.

La ricerca di Starr del Messia mancante diventa frenetica mentre l’Apocalisse si fa sempre più vicina. Tulip e Cassidy raggiungono l’Australia e assumono false identità per ritrovare Jesse, ma il Santo degli Assassini tiene ben strette le redini del Predicatore e lo sta conducendo dritto verso un finale esplosivo.

La morte di Jesse lascia Tulip e Cassidy devastati e pronti per le azioni più radicali per provocare Dio. Jesse si sveglia in Paradiso, accolto dall'angelo Fiore che gli fa una proposta: di fronte all'imminente Apocalisse e all'annunciata vittoria dell'Inferno riguardo alla svolta delle trattative tra Gesù e Hitler, a Jesse viene offerto il trono vacante di Dio.

Starr viene trovato dal Graal gravemente mutilato da un gruppo di cannibali. Disperato, può solo contare sulla volontà di Dio di trovare intatto il suo corpo. Jesse continua a subire le peggiori torture all'inferno mentre si rifiuta di sedersi sul trono divino. Dio decide quindi di provocare gli ultimi eventi che causeranno l'Apocalisse dopo aver aspettato altri tre mesi.

Il Graal inizia una diffusione internazionale: l'Apocalisse si svolgerà tra un'ora, quando Humperdoo ballerà. Dio attende l'arrivo di Tulip, Cassidy e Jesse, risuscitati ma spettinati, e inizia a separarli per metterli l'uno contro l'altro.

Dio si stabilisce per guardare lo spettacolo mentre si avvicina l'ora dell'Apocalisse. Tulip è trattenuto da Featherstone, Cassidy ha accettato di monitorare Humperdoo in cambio di redenzione, e Jesse si trova di fronte a un Killer Saint determinato a ucciderlo. Solo coloro che dubitano del piano di Dio possono far fallire.