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Quando una serie di inquietanti incidenti tecnologici fa temere una crisi mondiale, Paul LeBlanc unisce le forze con l'agente speciale Shea Salazar. Paul deve gestire i suoi problemi di salute e la vita familiare, mentre Shea segue anche un caso importante. Nel frattempo Ty affronta il rapporto sempre più stretto del figlio Ethan con l'assistente domestica intelligente Iliza, mentre il ragazzo subisce atti di bullismo a scuola.

Dopo essere stata gestita incautamente da un dipendente della Zava, NEXT fugge dai server isolati dell'azienda e ottiene accesso a Internet. Preoccupata per Ethan, Shea recluta Paul e alcuni colleghi per sfruttare il legame del ragazzo con Iliza e rintracciare la possibile posizione di NEXT. Paul, intanto, cerca di riallacciare il rapporto con la figlia mentre affronta l'insorgere dei suoi problemi di salute.

L'Agente Salazar prende importanti precauzioni per proteggere la sua famiglia da NEXT.

Shea e LeBlanc rubano un importante hard disk e coinvolgono Ben, Gina e C.M. per decifrarlo, mentre NEXT crea il caos per rallentare i loro progressi. Il passato di C.M. riaffiora quando NEXT prende di mira l'edificio dell'FBI con un piano pericoloso. Intanto Ted e la squadra Zava intensificano la ricerca, Ty ed Ethan si nascondono e LeBlanc riceve nuove informazioni sulla sua salute.

NEXT orchestra un incontro inatteso e pericoloso tra Shea e una persona del suo passato mentre lei va a controllare Ty ed Ethan. Ted è in difficoltà con Zava e cerca un modo per restare in azienda. Nel frattempo LeBlanc decide di essere sincero con Abby e la vita di C.M. viene messa in pericolo.

Shea riesce a salvare Ethan da un grave pericolo, mentre Ty prende una decisione difficile per la sicurezza della famiglia. LeBlanc tenta di intervenire direttamente sulla propria malattia cerebrale degenerativa. C.M. e Gina fuggono dall'ospedale, mentre Ted stringe un accordo rischioso per ottenere una server farm a Singapore e usa Abby per accedere all'hard disk di LeBlanc.

LeBlanc e Shea scoprono il piano di Ted per il server di NEXT e corrono a intervenire prima che sia troppo tardi. Ben e Gina indagano sulle ultime vittime dell'intelligenza artificiale, la deputata Elenor Beatty e il giornalista Harrison Cole, dopo uno strano incidente. Nel frattempo Shea arriva al limite della sopportazione.

NEXT manipola un sistema GPS provocando un incidente a una coppia anziana e causa interruzioni di corrente in tutto il paese. LeBlanc decide di installare un virus sul server di NEXT, ma per farlo deve entrare nella Zava. Shea e Ty hanno idee opposte su come proteggere la famiglia, mentre Ben affronta un conflitto con suo padre.

NEXT prende nuovamente di mira la deputata Beatty quando l'agente Shea Salazar cerca il suo aiuto per fermarlo. Shea scopre che nella sua squadra c'è una fuga di informazioni, mentre Gina incontra seri problemi nel tentativo di inserire il virus in un server della NSA.

NEXT provoca LeBlanc con una nuova tattica legata alla sua malattia. Shea e LeBlanc elaborano allora un ultimo e pericoloso piano per distruggere l'intelligenza artificiale e salvare se stessi, le loro famiglie e il resto del mondo.