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ラゲルタが殺害されてから半年。デクスターは相変わらず父、兄、そして連続殺人鬼としての人生を送っている。デボラは警察を退職し探偵事務所に勤務。バティスタはデボラの抜けた穴を埋め、警部補となった。マイアミ警察の面々は脳の一部を切除された男性の殺害事件を捜査する。

マイアミ警察が“脳外科医”の捜索を進める中、ボーゲル博士は自分が過去に診た患者を調べるようデクスターに依頼。デボラは私立探偵として探偵事務所の仕事を進めるが、足を踏み入れてしまったことに自ら始末をつけなければならなくなる。

デクスターは“脳外科医”を個人的に追い続ける。ボーゲル博士はデクスターが完璧なサイコパスであることをデクスター自身に証明しようとする。デボラは罪悪感を抑えきれなくなり、ラゲルタを殺害したことを自白してしまう。

デクスターはボーゲル博士のリストから連続殺人鬼の可能性がある別の元患者を見つけ出し、追跡する。クインは巡査部長への昇進試験で好成績を収めるが、デボラの名誉を守るためケンカ騒ぎを起こしてしまう。ボーゲル博士は罪悪感にさいなまれ続けるデボラの治療に当たる。

ボーゲル博士が“脳外科医”に誘拐され、デクスターとデボラは博士の救出に向かう。そんな折、何とマスオカに娘がいることが発覚。

デクスターは自分の手術台に迎える理由があるかどうか、ある若いサイコパスのことを調べる。デボラとは元の関係を取り戻すが、突然現れた元恋人ハンナの訪問に驚愕する。

ハンナのことを調べ、なぜマイアミに戻ったのか突き止めようとするデクスター。いよいよ弟子を受け入れ、掟を教えることにする。

デクスターは弟子が自分の隣人を殺したと信じ、行動を監視し始める。また、国外へ逃亡しようとするハンナに協力することも決心する。

弟子を殺されたデクスターは、殺害の経緯について調べる。ボーゲル博士は過去に自分の前からいなくなった人物が戻ってきて、計り知れない衝撃を受ける。

ボーゲル博士の協力の下、デクスターは“脳外科医”をおびき出して手術台に迎えようとする。しかしデクスターの人生において重要な人物が、目の前で殺されてしまう。

デクスターはハンナとハリソンの3人ですぐに国を出るか、それともサクソンを葬り去るか、選択に頭を悩ませる。一連の出来事の中でデクスターは人間としての成長を見せるが、行動を起こさなかったことで残酷な結果を招いてしまう。

【シーズン8 最終話】この画期的なドラマもいよいよ最終話。デクスターは絶望的な戦いに直面する。大型のハリケーンがマイアミに接近する中、彼なりにすべてを終わらせる時が来る。