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怪人協会の急襲で支援者の息子を誘拐されたヒーロー協会。S級ヒーローが集合し救出作戦が練られていた。フブキは壊滅したフブキ組にサイタマを勧誘するのだが…。その頃、怪人協会のアジトでガロウが目を覚ます。

怪人協会幹部への勧誘を受け、ガロウはヒーローの首を獲るために街へ繰り出すが、腹ごしらえのために訪れたファミレスで食い逃げをする。そこへ偶然居合わせていたサイタマは、逃走するガロウを追いかけるのだが…。

キリサキングと蟲神を相手に攻勢に出るガロウだったが、不意に現れたヘドロクラゲにタレオを人質に取られてしまう。一方、ジェノスの救難信号を受けたクセーノ博士はサイタマの元を訪れていた。

ヒーロー協会は怪人協会アジトへの突入を準備。S級ヒーローの招集が決定する中、ガロウ捕獲に失敗したシルバーファングと新参のジェノスは除外される。一方、瀕死から回復したガロウは怪人協会へ侵攻する。

怪人協会に侵攻しタレオを助け出したガロウに次々と怪人たちが襲い掛かる。タレオを先に逃すも災害レベル：竜の育ちすぎたポチの強襲で、地底深くへと落下。そこに怪人王オロチとギョロギョロが待ち構えていた。

怪人協会への突入を前にS級ヒーローが集結し作戦会議を開く。意見がかみ合わない中、A級1位アマイマスクが現れるとS級を相手に激しく対立し一触即発に！　ヒーロー達の思惑が交錯する中、怪人協会との決戦が迫る！

Ｚ市へ到着したヒーロー達を待ち受けていたのは、数多くの怪人による全方向からの奇襲だった。サポートとして作戦に参加したＡ級以下のヒーロー達が激闘を繰り広げる中、上空ではギョロギョロが戦況を偵察していた。

地下へ突入した閃光のフラッシュを待ち受けていたのは疾風のウインドと業火のフレイム。同じ「里」の出身ながら怪人となり災害レベル：竜となった二人は、忍のプライドを捨てた二人がかりの殺人技で強襲する！

ワガンマを発見した童帝の前に現れたのは、転生し災害レベル：竜となったフェニックス男。数々の発明メカがまるで歯が立たない童帝は強力な最終兵器を起動し、ワガンマを守りぬくため決死の覚悟で戦いを挑む！

ゾンビマンが対峙したのは、異能の血を代々引き継ぐ吸血鬼バンパイア。いかなる致命傷を受けても不死のゾンビマンと、血を吸えばどんな傷も回復するバンパイアとの血で血を洗う泥仕合が幕を開ける！

童帝の活躍でワガンマ救出作戦は成功。一方でタレオを発見したアトミック侍は黒い精子と、ゾンビマンはホームレス帝と、ぷりぷりプリズナーはニャーンと、それぞれ災害レベル：竜の幹部怪人たちと死闘を繰り広げる！

S級ヒーローが怪人たちと熾烈な戦いを繰り広げる中、戦慄のタツマキはギョロギョロの元にたどり着き、異次元の超能力バトルが始まろうとしていた。そして、サイタマの前には究極の生命体・怪人王オロチがついに姿を現す！