Alle afleveringen

In 2015 keert een Engel terug om Tokyo-3 aan te vallen. Misato Katsuragi vervoert Shinji naar een basis die wordt geleid door zijn vader Gendo, van wie hij is vervreemd.

Nadat Shinji de Eva Unit 1 heeft bestuurd, wordt hij wakker in het ziekenhuis zonder zich het gevecht te herinneren. Uit medelijden laat Misato hem bij haar intrekken.

Op school wordt gezegd dat Shinji de Eva-piloot is. Zijn klasgenoot Toji neemt hem dat kwalijk. Er verschijnt een Engel en Shinji gaat weer de strijd aan als piloot.

Shinji is gespannen na zijn laatste gevecht. Hij loopt weg van huis en ontmoet Kensuke. Als Nerv hem terugbrengt, stelt Misato hem voor een keuze.

Rei Ayanami, de piloot van Unit 0, lijkt te zijn hersteld. Maar ze heeft geen vrienden, geen dossiers uit haar verleden en geen interesse om Shinji te leren kennen.

Terwijl de Vijfde Engel naar Nerv boort, leidt Misato Operatie Yashima: alle energie van Japan zal worden gebruikt om Ramiel met een positronengeweer uit te schakelen.

Ritsuko vertelt Shinji over de geheime echte oorzaak van de Tweede Inslag. Daarna gaat ze met Misato naar een test van een mecha-concurrent van een Eva.

Shinji en zijn vrienden vergezellen Misato om Eva Unit 2 en piloot Asuka op zee te ontmoeten. Misato's oude vriend Ryoji Kaji is aan boord met een eigen agenda.

Asuka en Shinji nemen het op tegen een andere Engel, maar die krijgt de overhand. Ze hebben zes dagen om een aanvalspatroon te leren en de Engel volledig te vernietigen.

Nerv hoort over een Engel in een slapende embryonale vorm in een vulkaan. Met behulp van magma-apparatuur wordt Asuka uitgezonden met Unit 2 om de Engel op te halen.

Juist als er nog een Engel wordt gesignaleerd, verliest Tokyo-3 kracht. De Eva-piloten moeten de basis vanaf het oppervlak bereiken en Nerv prepareert de units handmatig.

Gendo en Fuyutsuki zijn op Antarctica en de net gepromoveerde Misato heeft de leiding. Dan verschijnt er een nieuwe Engel die Tokyo-3 wil bombarderen.

Een Engel infiltreert in Nerv en neemt de Magi-supercomputer over. Ritsuko stelt voor om een programma te schrijven en daarmee Ireul te laten evolueren tot het uitsterft.

Terwijl Seele de acties van Nerv en Gendo tegen de Derde tot en met de Elfde Engel doorneemt, voert Ritsuko een test uit waarbij de Eva-piloten van unit wisselen.

Voor het eerst sinds jaren ontmoet Shinji zijn vader bij het graf van zijn moeder. Ritsuko, Misato en Ryoji gaan naar een bruiloft en Asuka heeft een date.

In een gevecht worden Shinji en Unit 1 verzwolgen door de groeiende schaduw van een Engel. Nerv is bang dat ze beiden verloren zijn en Shinji heeft een vreemde ervaring.

Nerv 2 in Nevada verdwijnt, samen met Eva Unit 4. Unit 3 komt eraan, dus Gendo beveelt Ritsuko om daarvoor een piloot aan te wijzen.

Unit 3 komt aan uit de VS, maar Shinji weet nog steeds niet wie de piloot is. Tijdens het testen komt Nerv erachter dat Unit 3 bezeten is door een Engel.

Shinji is verward na het gevecht. Hij zweert om nooit meer een Eva te besturen en stopt opnieuw met Nerv. Vlak voor zijn vertrek valt er opnieuw een Engel aan.

Nadat Shinji een ongekende synchronisatiesnelheid heeft bereikt, fuseert hij met Unit 1. Als hij uit zijn lichaam treedt, probeert Nerv hem te redden.

Seele ontvoert Fuyutsuki, ondervraagt hem over de ware intenties van Nerv en Gendo en onthult gebeurtenissen uit het verleden. Ryoji wordt vermist.

Asuka's synchronisatieratio daalt en dat ondermijnt haar zelfvertrouwen. Ze is vastbesloten om haar kwaliteiten te laten zien en negeert orders tijdens een gevecht.

Ondanks haar worstelingen moet Asuka Rei helpen in een gevecht tegen Armisael. Als ze faalt, doet Rei een wanhopige poging om Shinji te redden.

Kaworu Nagisa, het Vijfde Kind, komt naar Nerv om Unit 2 in Asuka's plaats te besturen. Hij is vriendelijk tegen Shinji, maar is gehuld in mysterie.

Het Instrumentaliteitsproject begint en de zielen van de mensheid fuseren. De piloten worden geconfronteerd met de aard van hun bestaan terwijl de realiteit verdwijnt.

Het Instrumentaliteitsproject gaat door. Shinji moet besluiten of hij alleen in een wereld wil leven of verbindingen met anderen wil accepteren.