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Quando o Agente Locke e sua equipe se veem em meio a um horrível ataque biológico na colônia de Sedra, eles devem recorrer a uma fonte improvável para obter informações-chave sobre quem é o responsável pelo ataque e o que isso significa para a raça humana. Os agentes da ONI e a Guarda Colonial de Sedra finalmente conseguem seguir o rastro até a fonte, embora eles nunca tivessem imaginado que isso os levaria a um pedaço fragmentado do anel Halo.

O Agente Locke e o Coronel Aiken conduzem suas respectivas equipes juntas até a superfície do Fragmento Alpha a fim de deter os contrabandistas e destruir qualquer rastro do novo elemento mortal. No entanto, durante a missão, eles percebem que as condições extremas do fragmento do anel devem ser o menor de seus problemas.

Conforme cresce a tensão entre os esquadrões do Agente Locke e do Coronel Aiken, um plano é determinado para recuperar a ogiva presa a bordo do Condor e concluir a missão. Porém, outro encontro com sua ameaça mais recente pode significar o fim para mais de um soldado.

A cada momento, escolhas são feitas, linhas de batalha traçadas, e a determinação de cada soldado encara a prova definitiva. Quando as peças começam a cair, quem permanece leal e quem permanece vivo?

Para concluir a missão, os verdadeiros soldados farão o sacrifício final, restando apenas uma coisa: uma corrida para fugir e uma vontade de sobreviver.